THỰC TẬP BIOINFORMATICS
THỰC TẬP BIOINFORMATICS
ĐẠI CƯƠNG
ĐẠI CƯƠNG
NGÀNH CÔNG NGHỆ SINH HỌC
ĐẠI HỌC QUỐC GIA TP.HCM
TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN
KHOA SINH HỌC
CBGD: Nguyễn Thái Minh Quân
Võ Trí Nam
Bài 1 - CSDL SH và PP khai thác thô
ng tin
Slide 2
NỘI DUNG THỰC TẬP
•
Bài 1: Cơ sở dữ liệu sinh học và phương pháp
khai thác thông tin trên internet
•
Bài 2: Khai thác cơ sở dữ liệu PubMed,
Nucleotide, Protein trong NCBI
•
Bài 3: Thiết kế mồi (primer)
•
Bài 4: So sánh các trình tự sinh học
•
Bài 5: Vẽ cây phát sinh loài
•
Bài 6: Bài tập tổng hợp
Bài 1 - CSDL SH và PP khai thác thô
ng tin
Slide 3

SƠ LƯỢC LỊCH SỬ
•
1960s: CSDL đầu tiên về trình tự protein
•
1960s - 1970s: Phát triển thuật giải để
phân tích dữ liệu
•
1980s: thành lập CSDL GenBank và một
số CSDL khác (EMBL, DDBJ, …)
•
1990s: Sự phát triển chóng mặt của
GenBank và PDB
•
1991: Thuật ngữ Bioinformatics xuất hiện
Bài 1 - CSDL SH và PP khai thác thô
ng tin
Slide 6
Bioinformatics là gì? (tt)
•
Xây dựng các cơ sở dữ liệu
•
Phát triển các thuật giải và các phương pháp
thống kê
•
Sử dụng các công cụ tin sinh học được xây
dựng để phân tích và thông dịch nguồn dữ liệu
sinh học