B GIÁO DO
TRI HC NHA TRANG
VIN CƠNG NGH SINH HNG
THANH BÌNH
ẢNH HƯỞNG CỦA pH, NHIỆT ĐỘ VÀ ENZYME ĐẾN
HOẠT TÍNH CỦA BACTERIOCIN Ở MỘT SỐ CHỦNG VI
KHUẨN PHÂN LẬP TỪ ĐỘNG VẬT BIỂN VIỆT NAM
ÁN TT NGHII HC
Chun Ngành: CƠNG NGH SINH HC GVHD: TS. NGUY
ThS. NGUYN TH HI THANH Nha Trang, năm 2013
i
Lời cảm ơn
c tiên, tôi xin chân thành ccác thy cô giáo Vin Công ngh sinh
hi h luôn quan tâm, dy d, ging dy
nhit tình, giúp tôi tip cc nhng kin thc quý báu.
c bày t lòng bit n TS. Nguy Th.S.
Nguyn Th Hi Thanh, B môn Công ngh sinh hc, Vin Công ngh sinh hc và
ng ng dng, dy bo và to mu kin cho tôi
án tt nghip này.
12
1.4. ng dng ca bacteriocin 13
13
13
trong NTTS 14
1.5. Tình hình nghiên cu vi khun bin sinh bacteriocin 15
1.5.1. 15
21
VT LIU 23
2.1. Vt liu 23
2.1.1. 23
2.1.2. 23
iii
2.1.3. 23
2.2. u 24
24
24
25
26
III. KT QU NGHIÊN CU VÀ THO LUN 28
3.1. Tuyn chn các chng vi khun sinh bacteriocin có hot tính kháng khun mnh 28
3.2. Mi quan h ging và sinh bacteriocin ca mt s vi khun bin
sinh bacteriocin. 30
3.3. ng ca enzyme, nhi n tính kháng khun ca mt s
chng vi khun bin 35
3.3.1. 35
3.3.2. 38
TSA
Tryptone Soya Agar
8
TSB
Tryptone Soya Broth
9
VSV
Vi sinh vt
v
Bng 1.1. So sánh bacteriocin và kháng sinh 3
Bng 1.2. Phân loi bacteriocin 7
Bng 1.3. Tính cht hóa lý ca mt s bacteriocin ca vi khu 11
Bng 1.4. Các chng vi khun bin sinh bacteriocin 18
Bng 1.5. Bacteriocin t vi khuc phân lp t ng vt bin 20
Bng 3.1. Vòng kháng khun ca các chng nghiên ci vi 3 chng ch th 28
Bng 3.2. Kh ng (OD
600
) và sn sinh bacteriocin ca chng CR9.1 30
Bng 3.3. Kh ng (OD
600
) và sn sinh bacteriocin ca chng CR10 31
Bng 3.4. Kh ng (OD
600
) và sn sinh bacteriocin ca chng CR15 32
Bng 3.5. Kh ng (OD
600
R2(D), chng ch th P. mirabilis T14 38
Hình 3.8. ng ca nhi n hot tính kháng khun ca dch bacteriocin
thô t các chng CR9.1, CR10, CR15, R2, chng ch th P. mirabilis T14 40
Hình 3.9. ng cn hot tính kháng khun ca dch bacteriocin thô t
các chng CR9.1 (A) và CR10 (B), chng ch th P. mirabilis T14 42
Hình 3.10. ng cn hot tính kháng khun ca dch bacteriocin thô
t các chng CR15 (A) và R2 (B), chng ch th P. mirabilis T14KT LUN VÀ
KIN NGH 43
1
Vit Nam là mt quc gia rt giàu có v tài nguyên bin, vng b bin
. S ng v sinh hc bi
c nghiên c, nht là nhng nghiên cn v vi khun
bing vt ch ng d
vrt hn ch.
NTTS hin là mt trong nhc sn xut thc phm phát trin mnh
nhc ta. Tuy nhiên, dch bnh lng xuyên xy ra gây thit hi kinh t
hàng triô la M mn na, cùng vi hing bii khí hu toàn
cu, nhi t nh và truyn nhi
Vic lm dng cht kháng sinh trong phòng u tr bnh cho thy sn
gây nên hing nhn thung xu ng nuôi. Bên c
ng kháng sinh trong sn phm thy sn gây ng ln n sc khe
i tiêu dùng vic xut khu sn phc khác. Vì vy, các
thân thin vng dng vaccine, cht kháng
sinh th h mi hay probiotic ngày càng c quan tâm. S dng vaccin ng
vt thy sn ng v u qu vt ch,
tn kém v chi phí sn xut, chi phí nhân công và ng vt nuôi. Do
, các ch phm vi sinh có th là mt gii pháp hiu qu. Chúng kìm hãm s phát
trin ca các vi khun có hi nh tính cnh tranh ca các chng có li, nâng cao kh
3
C I.
Bacteriocin là các peptide
bào vi kh Bacteriocin
bacteriocin ó [5, 19, 26].
Các kháng con
tiêu nhau, còn
bacteriocin
[19, 26].
. So sánh bacteriocin và kháng sinh
Bacteriocin
n
vng trong NTTS
Trên ribosom
Colicin [22, 36].
Bacteriocin của vi khuẩn Gram dương
[22, 36].
bacteriocin
n nay có khong 200 lonh, tuy nhiên vic
phân loi bacteriocin vn tranh cãi.
c phân loi kt hp theo các tiêu chí khác nhau.
Nhng tiêu chí chính là vi khun sn xut, trng phân t ca chúng và trình
t acid amin [17]. Da trên h thng phân loi bacteriocin ca Klaenhammer và
c chia làm 4 lp (nhóm) p III và l
c nghiên cu nhiu, ch yu là lp I và lp II.
Lớp I
Bacteriocin lp c gi là Lanbiotic là nhng peptide nh (<5
kDa), bn nhit và hong bng cách ng lên cu trúc màng. Mi din
5
tiêu biu ca nhóm này là Nisin [30]. c chia thành 2 phân lp là
Ia và Ib da trên s ng cu trúc.
a) Phân lớp Ia
Gm các peptide dng thuôn dài, linh hot và t
ng bng cách hình thành các l trong màng t bào cht ca các loài vi khu
[29].
Nisin (thuc nhóm này) là mc hình thành bi 34 amino acid. Có 2
bin th ca Nc ghi nhn là Nisin A và Nisin Z, chúng ch khác nhau amino
acid th 27: Histidine trong Nc thay th bi Asparagin trong Nisin Z.
Loi bacteriocin này c sn xut bi mt vài chng Lactococcus lactic,
c s dt cht ph gia trong thc phm. Nó có ph kháng khun Gram
c hong cp này ch tìm
thDivergicin A và Acidocin B [32].
Lớp III
B
Lactobacillus [30].
Lớp IV
lipid
[20]
actocin 27 [11, 44].
Các lactic (LAB)
Ngoài ra, b
b.
7
Loi
Lp
Vi khun
Trng
ng phân
t (kDa)
Hong
Protein-
Bacteriocins
Gracilicutes
Xanthomonas
campestris
50
Phân gii kiu
Enterocoliticin
Yersinia
enterocolitica
669
Phân gii kiu
Carotovoricin
Erwinia
carotovora
68/76
Phân gii kiu
Firmicutes Helveticin J
Lactobacillus
helveticus
t
Millericin
Streptococcus
milleri
Escherichia coli
Hot tính enzyme
ni bào/ To l
màng
Firmicutes Class I
Lactic acid
bacteria
2-4
To l màng
Class II
4-6
To l màng
Cyanobacteria Microcin-like
Prochloron
didemni
0,7
t
Nguồn: [29]
hong cc công nhn rng
quá trình vn chuy tng hp nên thành peptidoglycan t trong t bào
cht. Bacteriocin thuc nhóm này có kh t vi lipid nm trên màng
nguyên sinh, s liên kc gii thích rng do phn ln
n tích âm vì th s liên kc d dàng to ra
trên màng. Sau khi to liên kt, bacteriocin s khóa lipid làm chúng mt kh
vn chuyn các ti cu to nên thành peptidoglycan.
i vi màng sinh cht, bacteriocin liên kt và s dng lipid trên màng
thc hin quá trình oxi hóa kh, lúc này lipid có tác d
nhng con dao ct to nên nhng l hng trên màng nguyên sinh. Nhng l hng
này làm tht thoát nhiu các ion, các cht hòa tan trong nguyên sinh cht (mui
10
y phân và tht thoát nhiu ATP dn
t bào ch[24].
Lp II - n hình là Sakacin: do thuc nhóm k c sau khi to ra kênh
dn trong màng, bacteriocin thuc nhóm này s liên kt vi lipid trong thành phn
phospholipid màng, chúng s gn trc tit thành phn ca màng,
c hin các phn ng oxi hóa kh to nên nhng l h
nhóm I [24].
Lp III - ng trc tip lên thành t bào, làm tan
thành t bào và phá v tính thm thu [24].
Lp IV- hin nay các nhà khoa hc vt kt lun c th rõ
ng ca nhóm này. Theo s gi nh ca các nhà khoa
hc, h cho r ng ch yu lên DNA, RNA và s tng hp
protein. Các bacteriocin nhóm này có th to phc hp không tan v
cn DNA tng hp nên RNA và protein, hoc liên kt vi DNA làm dch mã ra các
protein không bình th nó liên kt trc tip và c ch hong
ca protein [24].
1.2. Tính cht hóa lý ca bacteriocin
1.2.1.
lipase và -amylase. Hay vibriocin AVP10 bacteriocin t
chng vi khun Vibrio có trong cá bin,
[31].
3.
Tên bacteriocin
Nhi x lý
Khong pH bn
Enzyme thy phân
Megacin A 216
60°C/30 phút
2÷7
Chymotripsin, Pepsin,
Trypsin
Clostocin A
100°C/30 phút
4÷9
Trypsin, Chymotripsin,
Pronase P, Rnase, Dnase
Clostocin B
80°C/10 phút
4÷9
Trypsin, Chymotripsin,
Pronase P, RNAse, DNAse
Clostocin C
80°C/10 phút
4÷9
Trypsin, Chymotripsin,
Pronase P, RNAse, DNAse
Trypsin
Nguồn: [43]
1.3.
Ngày nay, vic s dng rng rãi các bacteriocin trong bo qun thc ph
n nhng li ích nhnh so vi vic s dng cht bo qun hóa h
- An toàn trong bo qun thc phi, ít có hn ch
vi nhng cht bo qun hóa hc vì các phân t c sn sinh t nhiên bi vi sinh
vt lên men trong thc phm lên men truyn thng [36].
- ng vì chúng b thoái bin nhanh chóng.
- c s dn th yi vi các tác
nhân gây bnh mà không làm n vi khun có li [30].
- Bacteriocin không làm thai tính cht cm quan thc phm [36].
- Có ph hong rõ ràng.
- B sung cho tác nhân kháng khun.
- Có th thay th thuc kháng sinh trong nuôi trng thy sn mà không gây
c hi vi t bào eukaryote [22].
- Bacteriocin tinh khii n nh v mn 10%, ph hong
i hp so vi kháng sinh truyn thng nên s không git cht nhng sinh vt
có ích.
1.3.2.
Vi nhng lc ng dng rng rãi trong
13
công nghi t loi kháng sinh a t s
m
- c bii các cht bo qun hóa hc.
- B thoái bin nhanh chóng bi các enzyme phân gii protein.
- Chi phí cao trong vit.
- Ch có hiu qu chng li mt nhóm vi khun òi hi có nhng yêu
ng ru Enterobacter, Klebsiella hoc Samonella. Trong
c sinh ra t vi khun Gram âm có kh c ch các loi vi
khu ng E.coli H22 có th c ch ng ca 7 chi trong h
Enterob Enterobacter, Escherichia, Klebsiella, Morganella,
Salmonella, Shigella và Yersinia). Kh c ch c cho là do s sn sinh
ra microcin C7 [35] và colicin E1 và Ib [16].
i vi gia súc và gia cm, v qun lý s phát trin quá mc ca các tác
nhân gây bi trong nguyên liu sn xut tht quan trng. Chúng
có th b nhim trong khâu sn xut và ngay c quá trình tiêu thc b
sung probiotic trong quá trình nuôi là mt vic làm thit yu. Nghiên cu ca
Carina Audisio và cng s [9] khi b sung bacteriocin sn xut t Enterococcus
faecium J96 có kh nh Salmonella pullorum, và nâng
cao t l sng ca gà con. Trong gia súc, d c n ca tác nhân gây
bnh khó có th kim soát bE. coli O157:H7 [27]. Bên cnh
dc ca nhng tác nhân gây bnh này.
Mt s công trình nghiên cu g b sung colicin t các chng E.coli vào d
c cm s ng tác nhân gây bnh mt cách rõ r.
, E.coli
[37]. E.coli
[44].
1.4.
trong NTTS
15
L. monocytogenes
khói.
2
c công b (Hình 1.2)
Hình 1.2. S ng bài báo nghiên cu v bacteriocin trong mi chu k
1949-c trích dn trên Pubmed [18].
Trong đó: “colicin” là các bacteriocin từ E.coli, “microcin” là các
bacteriocin rất nhỏ từ enterpbacteria, “LAB bacteriocin” là bacteriocin từ vi khuẩn
lactic và “marine bacteriocin” là các bacteriocin có nguồn gốc từ biển.
Bacteriocin t Vibrio sp.
Bacteriocin bi c phân lp t Vibrio harveyi. McCall và
Sizemore n chc 795 chng Vibrio spp. sn sinh ra bacteriocin to
Galveston, Texas. Theo nghiên cu này khong 5% chng Vibrio spp. có kh
kháng khuc phát hin có kh n
trng phân t c mã hóa trên plasmid và ch có kh i kháng
vi loài V. harveyi (bng 1.4). c gi là
Harveyicin. Nhng nghiên c t rng Harveyicin có cu trúc
protein, b bin tính khi x lý vi các loi enzyme và bn nhit (không mt hot tính
kháng khuc x lý nhit 55
0
C trong 4 gi . Harveyicin có kh
cnh tranh vi các loài vi khung rut nhi 4 - 39
0
C, pH = 5 - 9,5
mn 1,75% - 3,5%. Vic phát hin ra Hu cho vic nghiên
cu các loài bacteriocin t vi khun bin. Phn ln nhng nghiên cu này tp trung
nh ti dt cht kháng sinh th h mi hoc
probiotic [3].
17
Các loài Vibrio ng gp ph bi c bin c
phân lp ch yu t ng vt thân mm. Mt vài loài trong s là các
Bacteriocin
N
Kích
c
(kDa)
Listonella
anguillarum
AVP10
Vibriocin AVP 10
Escherichia coli
Listonella
anguillarum
(Arius
thalassimus)
?
Vibrio
mediterranei
BLIS
V.
parahaemolyticus
V. mediterranei
h
BLIS
Pasteurella
piscicida
E. coli V.
vulnificus
Enterococcus
seriolicida
Leiognathus
nuchlis
<5
Chng vi khun
ZM81
Bacteriocins/BLIS
Chng vi khun
bin ZM19
>10