TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI
KHOA KỸ THUẬT Y HỌC
BÁO CÁO THỰC TẬP VI SINH
LÂM SÀNG
Hà Nội, Tháng 12 năm 2014
TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI
KHOA KỸ THUẬT Y HỌC
BÁO CÁO THỰC TẬP HÓA SINH
LÂM SÀNG
Địa điểm thực tập :Khoa xét nghiệm – Bệnh viện Nhiệt đới
Trung Ương
Địa chỉ : Số 78, Giải Phóng, Đống Đa, Hà Nội
Hà Nội, Tháng 12 năm 2014
ĐẶT VẤN ĐỀ
Được sự phân công của bộ môn Vi Sinh trường Đại học Y Hà Nội, em đã vinh
dự được thực hành học phần Vi sinh lâm sàng năm 4 tại khoa xét nghiệm bệnh
viện Nhiệt Đới Trung ương. Sau 4 tuần thực hành (thời gian từ 17/11/2014 đến
12/12/2014) em đã được các cô, anh chị trong khoa xét nghiệm cung cấp cho em
những kiến thức cơ bản về vi sinh lâm sàng. Sau đây em xin trình bày báo cáo về
những gì em đã học được tại khoa.
MỤC TIÊU:
Nắm được cách thức tổ chức quản lý một phòng XN vi sinh bệnh viện.
Nắm được các công việc xét nghiệm trong khoa (các loại XN, chủng loại
XN, số lượng bệnh phẩm từng loại/ ngày và chung cả đợt)
Một số căn nguyên vi sinh vật thường gặp
Quy trình một số XN thông thường trên vi sinh lâm sàng
Tham gia 1 số công việc của phòng xét nghiệm, tự đánh giá khả năng của
mình và chất lượng sau khi hoàn thiện công việc
Viết báo cáo thu hoạch sau khi đi thực hành bệnh viện.
PHƯƠNG PHÁP HOC TẬP
Phương
CN Dương Thị Thu
Thủy, KTV Nguyễn
Thị Luyên
KTV Nguyễn Minh
Hải
KTV Hoàng Phương
Dung
Phòng ký sinh
trùng
CN. Nguyễn Thị Lan
CN. Đỗ Thị Lê Na
CN. Nguyễn Thị
Huyền Trang,
Phòng Miễn dịch-
HIV
Ths. Nguyễn Thị Như
Hà
KTV. Nguyễn Thị Hà
KTV.Vương khánh
Hoan
CN. Nguyễn Thị Hòa
Ths.Ngô Mai Khanh
KTV. Phạm Đức Quý
CN Nguyễn Thị Thu
Hà
CN Bùi Thị Thu
trang
Phòng sinh học phân
tử
tử, miễn dịch phục vụ cho việc chẩn đoán, xác định nguyên nhân gây bệnh,
theo dõi diễn tiến của bệnh nhân trong quá trình điều trị.
Khoa xét nghiệm hoạt động dưới sự lãnh đạo của trưởng khoa, người giám
sát toàn bộ hoạt động của khoa cùng với một đội ngũ cán bộ có chuyên môn,
với sự trợ giúp của phó trưởng khoa. Khoa xét nghiệm đã bổ sung hai nhân
viên Quản lý chất lượng(QLCL) Quản lý kỹ thuật(QLKT) có trách nhiệm
đảm bảo mọi hoạt động của khoa.
Khoa xét nghiệm thực hiện nhiệm vụ trong Quy chế khoa cận lâm sàng do
Bộ Y tế ban hành. Cán bộ, viên chức của khoa phải có đủ tiêu chuẩn về trình
độ chuyên môn, năng lực, phẩm chất của người cán bộ y tế.
2. Trang thiết bị, dụng cụ, vật tư tiêu hao:
Khoa xét nghiệm đã xây dựng và duy trì các quy trình thích hợp cho việc lựa chọn,
sử dụng và bảo quản các thiết bị thuộc xét nghiệm bao gồm các dụng cụ, vật tư tiêu
hao, hệ thống phân tích gồm cả phần cứng và phần mềm của máy vi tính.
Phòng vi khuẩn Phòng ký sinh
trùng
Phòng miễn
dịch
Phòng sinh
học phân tử
Trang
thiết bị
-Máy Vitel 2-
Compact
-Tủ an toàn sinh học
-Nồi hốp Tomy
-tủ nuôi cấy VK
hiếu khí
-Máy đo độ đục
-Kính hiển vi
Dụng
cụ, vật
tư tiêu
hao
-Que cấy, đèn cồn,
đĩa, dụng cụ lấy
máu, lấy bệnh phẩm
khác (tuýp vô trùng,
tăm bông vô trùng,
hộp nhựa vô
trùng…), dụng cụ
giữ chủng, chai cấý
máu,
-Que cấy, đèn
cồn, đĩa, dụng cụ
lấy máu, tuýp vô
trùng, tăm bông
vô trùng, hộp
nhựa vô trùng…),
dụng cụ giữ
chủng, chai cấý
máu,
-thùng đựng
kim, ống lấy
máu, pipet,…
-pipet, tip, tube,
giá đựng mẫu,
dụng cụ thủy
tinh
Sinh
3. Chú ý về cách bố trí, sắp xếp:
- Khoa XN được bố trí ở tầng 5, tách biệt với khu khám bệnh, bệnh phòng.
- Cửa ra vào: được lắp kính và có chốt/khóa an toàn
- Bố trí thiết bị: các thiết bị được đặt ở vị trí vững chắc, máy ly tâm nên đặt ở vị trí
tách biệt tránh ảnh hưởng đến năng lực hoạt động của các thiết bị khác (cân, máy
đọc…)
-Bố trí khu vực xét nghiệm: phòng SHPT có các khu vực riêng cho thao tác phân
tách DNA, chạy máy luân nhiệt , điện di ;đảm bảo khu vực nhuộm, lấy mẫu BP
luôn thông và thoáng gió; phòng ăn nghỉ tách biệt, điều hành tách biệt với khu xét
nghiệm…
6
PHẦN B:
Công việc xét nghiệm của khoa
1. Tiếp nhận mẫu bệnh phẩm
-Kiểm tra thông tin bệnh phẩm và phiếu yêu cầu xét nghiệm
-Ghi vào sổ nhận bệnh phẩm các thông tin về mẫu bệnh phẩm và các
yêu cầu xét nghiệm
-Ghi ngày, giờ nhận nhận bệnh phẩm và kí giao nhận
2. Chuyển bệnh phẩm tới phòng xét nghiệm
-Mẫu bệnh phẩm sẽ được chuyển kèm theo các phiếu yêu cầu tới
phòng xét nghiệm
3. Soát xét các mẫu bệnh phẩm
- Cán bộ kỹ thuật kiểm tra lại các thông tin trên phiếu yêu cầu và số
lượng, chất lượng các mẫu bệnh phẩm trước khi thực hiện xét nghiệm
-Nếu phát hiện sai sót phải phản hồi lại cho cán bộ tiếp nhận hoặc
người gửi mẫu dể giải quyết kịp thời
4.Xử lý bệnh phẩm
- Tiến hành xử lý các mẫu bệnh phẩm theo yêu cầu của từng loại bệnh
phẩm (ly tâm,bảo quản, lưu trữ )
5. Tiến hành kỹ thuật xét nghiệm
khuẩ
n
1. Nuôi cấy, phân lập các VK từ dịch não
tủy
2. Nuôi cấy, phân lập các VK từ máu
3. Nuôi cấy lao từ máu
4. Nuôi cấy, phân lập các VK từ đường
hô hấp
5. Nuôi cấy, phân lập các Vk từ đường
tiết niệu
6. Nuôi cấy, phân lập các VK từ da, niêm
mạc
7. Nuôi cấy MGIT từ các loại BP
8. Nuôi cấy, phân lâp VK từ các BP khác
9. Định danh VK bằng kỹ thuật thông
thường và bằng máy tự động
10. Xác định mức độ nhạy cảm với kháng
sinh bằng KT kirby-Bauer, E-test, máy tự
động
11. Nuôi cấy, phân lập, xác định VK kỵ
khí
12. Nghiên cứu các tác dụng ức chế, diệt
khuẩn của hóa chất, đông y.
- Bệnh phòng lấy mẫu trong
ống vô trùng.
- Nhân viên phòng xét ngiệm
lấy máu tại giường.
-Bệnh phòng lấy mẫu để
trong ống vô trùng có nắp
đậy.
-Dịch não tủy, màng phổi,
màng bụng, màng tim: 3-5ml
(vô trùng, có nắp đậy).
-Dịch rửa phế quản, dịch
khớp, đờm: tối thiểu 3ml (vô
trùng, có nắp).
-4ml máu chống đông.
-2-3ml dịch não tủy.
9
10. PCR-EV và EV 71
11. PCR cúm A,B và subtype A
12. Định type HCV
-Bệnh phẩm dịch họng, hầu
họng (lấy ở bệnh phòng).
-Đủ 3ml máu không chống
đông
Phòn
g ký
sinh
trùng
1. Cấy nấm
2. Cấy tổn thương da
3. Nhuộm soi và làm test miễn dịch kst
sốt rét.
4. Soi tìm KST đường ruột
5. Nhuộm soi tìm nấm
6. Soi tìm ấu trùng giun chỉ
7. Kháng sinh đồ nấm
-Bp lấy mẫu để trong ống
nghiệm vô trùng có nắp đậy.
Theo dõi thực trạng xét nghiệm vi khuẩn ngày/tuần/tháng
Thời gian
Bệnh phẩm
Ngày 16/11 Tuần từ 15-22/11 Tháng 11
Cấy máu 16 133 549
Nước tiểu 4 30 128
Phân 2 19 70
Đờm 4 22 104
Mủ 1 9 39
Làm BK 9 94 319
Dịch khác 2 12 39
2. Phòng ký sinh trùng từ ngày 17/11/2014 đến 21/11/2014
- Cấy máu : 25 bệnh phẩm
- Dịch não tủy:12 bênh phẩm
- Đờm: 5 bệnh phẩm
- Dịch họng: 8 bệnh phẩm.
- Dịch màng phổi: 6 bệnh phẩm.
- Nước tiểu: 6 bệnh phẩm
- Da: 1 bệnh phẩm
- Dịch phế quản: 2 bệnh phẩm
- Xét nghiệm máu tìm KST sốt rét: có 8 bệnh phẩm
- Xét nghiệm phân tìm KST đường ruột : 15 bệnh phẩm.
- Dịch chọc hạch:1 bệnh phẩm
- Cấy nấm: 48 bệnh phẩm
11
3 Phòng miễn dịch tuần từ 1/12/2014 đến 3/12/2014
− Test nhanh
+ Ns1-Ag:21
+ Dengue IgM-IgG:10
+ Ricketia:18
ria cấy hình chữ thập, theo đường kính của đĩa thạch. Sau đó, ta ria theo đường zíc
zắc cắt hình chữ thập vừa ria, các đường cấy sát nhau và ria hết mặt thạch.
Chú ý: - Trong quá trình ria cấy thì ta vừa ria vừa xoay ăng cấy để vi khuẩn được
dàn đều ra môi trường
- Vì đây là kĩ thuật cấy đếm, có liên quan đến kết luận có nhiễm trùng
tiết niệu hay không nên đòi hỏi thể tích bệnh phẩm cấy phải chính xác.
Vì vậy thao tác tiến hành phải chuẩn
Cấy phân vùng: Là kĩ thuật được áp dụng rộng rãi nhất, mục đích tạo khuẩn
lạc riêng rẽ, từ đó quan sát màu sắc, hình thái và có thể đánh giá 1 số tính chất
sinh vật hóa học. Bệnh phẩm là nước tiểu, dịch não tủy, mủ, ….
Kỹ thuật: Nếu cấy nửa đĩa thì ta cấy 3 vùng, nếu cấy cả đĩa thì ta cấy 4 vùng
- Lấy bệnh phẩm, để ở 1 vị trí sát thành đĩa thạch
Vùng thứ 3
Vùng nguyên
ủy
Vùng thứ 2
13
- Dùng que cấy vô trùng, tạo vùng nguyên ủy, là vùng đầu tiên, diện tích ria cấy
vào khoảng ¼ đĩa thạch
- Đổi mặt que cấy, ria tiếp vùng thứ 2, các đường cấy vùng 2 cắt 3, 4 đường cấy
cuối của vùng nguyên ủy, diện tích ria cấy của vùng 2 khoảng 1/3 đĩa thạch.
- Lấy que cấy mới ria cấy vùng thứ 3, các đường cấy của vùng thứ 3 cắt 3, 4
đường cấy cuối cùng của vùng thứ 2. Diện tích ria cấy của vùng 3 khoảng ¼ đĩa
thach.
- Nếu cấy 4 vùng thì đổi mặt que cấy, cấy tiếp vùng thứ 4 cho đến hết bề mặt
thạch, các đường cấy của vùng thứ 4 cũng cắt 3, 4 đường cấy cuối của vùng thứ 3.
Chú ý:
- Các đường cấy càng sát nhau càng tốt
14
- Vi khuẩn bắt màu đúng
- Tiêu bản không có cặn bẩn, sáng, dễ xem.
2. Quy trình cấy phân:
2.1. Cách lấy bệnh phẩm:
-Lấy phân từ trực tràng: Dùng tăm bông vô trùng dã tẩm ướt bằng nước muối sinh
lý, xoay tăm bông lấy được một lượng phân nhỏ dính vào sau đó gửi ngay tới
phòng xét nghiệm vi sinh.
-Lấy phân đã đi ra ra ngoài dụng cụ sạch: Dùng một chiếc bô sạch, khô, cho bệnh
nhân đi ra ngoài vào rồi dung tăm bông lấy phân ở những vùng có biểu hiện bệnh
lý, sau cho vào ống nghiệm vô trùng gửi tới phòng xét nghiệm.
-Ghi tên, tuổi, phòng, chẩn đoán,giờ nhận bệnh phẩm vào sổ cấy phân
2.2. Quy trình:
2.3. Một số vi khuẩn thường gặp:
-Trực khuẩn đường ruột: E.coli, salmonella, Shighella
-Vi khuẩn phẩy tả
-Staphylococcus aureus
3. Quy trình cấy máu:
3.1. Kỹ thuật lấy BP:
- Nhận giấy chỉ định cấy máu của lâm sàng;
Dương tính
Vi khuẩn di động,
TCBS khuẩn lạc nhỏ,
trong,vàng
Chỉ định bác sĩ: tìm tả.
Cấy: Thạch kiềm,
TCBS
Bệnh phẩm
Nhuộm soi tìm bạch
cầu, tính di động,vi
3.2. Các Vi khuẩn thường gặp:
- S.epidermidis
- Pseudomonas aeruginos
-Streptococcus
- S.pneumonia
- VK đường ruột: E.coli
- S. aureus
16
Thạch máu Uri select
Dựa vào hình dạng khuẩn lạc, Enh chất tan máu, mùi→ bắt khuẩn lạc nghi ngờ
Nhuộm soi
Dựa vào hình dạng khuẩn lạc, màu sắc khuẩn lạc
Trực khuẩn gram âm Cầu khuẩn gram dương
xếp đám
- đặt opt
- chạy giá đường strep
Uri+ thạch mềm
Oxydase
Vitek 2
KSĐ+
Thạch thường
xếp chuỗi
- Đông huyết tương
3.3. Quy trình cấy máu:
4. Quy trình xác định, phân lập từ bệnh phẩm đờm:
4.1. Kỹ thuật lấy đờm:
Buổi sáng: sau khi Bn đã vệ sinh răng miệng, khạc đờm vào cốc vô trùng,
đưa về phòng. Đối với trẻ em, do không khạc được, nên lấy chất hút từ dạ
dày bằng ống nhựa mềm (Chú ý: nên nhuộm và cấy ngay vào môi trường
- Điền đầy đủ thông tin vào ống đựng bệnh phẩm
- Cần gửi sớm đến phòng xét nghiệm vi sinà
5.2 Quy trình kỹ thuật:
19
Bệnh phẩm
Nhuộm soi: ^m bạch cầu, vi khuẩn Thạch máu, soco(37ºC,24h)
Hình dạng khuẩn lạc, Enh chất tan máu→chọn khuẩn lạc nghi ngờ
Nhuộm soi
Cầu khuẩn gram dương trực khuẩn gram âm
cầu trực khuẩn gram âm
xếp chuỗi xếp đám
Catalase
Opt
Lên men đường strep
Đông huyết tương
Thạch thường
Oxidase
Uri select
Thạch mềm
Vitek2
KSĐ+ Thạch thường + lưu và giư chủng
5.3 Một số vi khuẩn thường gặp:
-K.pneumonia
Thạch soco+Test
X,V
20
-S.Suis
-S.pneumonia
6 Quy trình cấy mủ:
a. Cách lấy BP :
7.1. Kỹ thuật kháng sinh đồ Kirby-Bauer:
a. Bệnh phẩm
- Chủng thuần đã được định danh.
b. Nguyên lý.
- Khoanh giấy có đường kính và độ dày nhất định, vô trùng đã tẩm sẵn kháng
sinh với nồng độ nhất định được đặt lên đĩa môi trường nuôi cấy vi khuẩn. Sau
khi ủ ấm ở nhiệt độ và khí trường thích hợp, vi khuẩn chỉ mọc được ở nơi có
nồng độ kháng sinh thấp hoặc không có. Tuỳ theo khả năng ức chế sự phát triển
của vi khuẩn mà tạo ra vòng ức chế xung quanh khoanh giấy kháng sinh.
c. Tiến hành kĩ thuật.
• Pha huyền dịch vi khuẩn.
- Pha huyền dịch vi khuẩn trong nước muối sinh lý trực tiếp từ các khuẩn lạc vi
khuẩn mọc trên mặt thạch nuôi cấy đã ủ 18 đến 24 giờ. Điều chỉnh huyền dịch
vi khuẩn đạt độ đục chuẩn McFaland 0.5 bằng máy đo độ đục.
• Trải huyền dịch vi khuẩn trên mặt thạch.
- Trong vòng 15 phút sau khi pha huyền dịch vi khuẩn, dùng một que tăm bông
vô khuẩn vào huyền dịch rồi ép và xoay nhẹ que tăm bông lên thành ống
nghiệm. Động tác này sẽ bớt được lượng huyền dịch vi khuẩn thừa khỏi que
tăm bông.
- Ria vi khuẩn từ que tăm bông lên mặt thạch Mueller- Hinton đã để tủ ấm trước
đó 30 phút bằng máy tự tạo: Đặt ngửa đĩa thạch vào vị trí để đĩa trên máy, đặt
tăm bông từ tâm đĩa thạch, bật máy, kéo từ từ tăm bông từ tâm ra ngoài rìa đĩa
thạch, vừa kéo vừa xoay đều tăm bông.
Định danh, kháng sinh
đồ
22
• Đặt khoanh giấy kháng sinh lên mặt thạch đã ria vi khuẩn.
- Tuỳ theo chủng vi khuẩn làm kháng sinh đồ, chọn bộ kháng sinh thích hợp để
đặt lên mặt thạch. Khi đặt phải ép nhẹ mỗi khoanh giấy để đảm bảo chúng tiếp xúc
với mặt thạch.
- Đĩa thạch ĐK 9mm thì chỉ đặ 2 thanh E- test và 2 thanh E- test phải đặt ngược
chiều nhau.
- Trong 15 phút sau khi đặt khoanh giấy kháng sinh phải để sấp hộp thạch trong
tủ ấm 35ºC.
► Chú ý: Không ủ hộp thạch ở khí trường quá 5% CO2
II. Một số phản ứng huyết thanh học, ELISA:
• Phòng thực hiện các kỹ thuật miễn dịch nhằm phát hiện kháng thể tìm ra
nguyên nhân gây bệnh của virus và định lượng các yếu tố kháng nguyên
trong huyết thanh bệnh nhân. Sử dụng huyết thanh trong XN có nhiều ưu
điểm hơn huyết tương vì huyết thanh trong hơn ít bị thay đổi các yếu tố
hơn và không cần chống đông.
• Để thực hiện được các kỹ thuật trên cần phải có các KIT của các hãng
khác nhau. Mỗi một bộ KIT khác nhau sẽ có một quy trình khác nhau
nhưng tất cả đều dựa trên một nguyên tắc chung là phản ứng kết hợp
kháng nguyên kháng thể.
• Trước khi làm xét nghiệm cần làm thủ tục hành chính:
− Đối chiếu tên, tuổi, khoa, phòng, giữa ống và giấy yêu cầu, ghi giờ
nhận vào sổ.
− Kiểm tra máu lấy có đúng ống không, chất lượng bênh phẩm.Ly tâm
mẫu, chuẩn bị hóa chất, dụng cụ làm xét nghiệm.
1. Quy trình chẩn đoán HIV:
1. 1. Quy trình xét nghiệm HIV 1/2 - Test nhanh:
a. Nguyên lý:
Thử nghiệm SD Bioline HIV-1/2 3.0 gồm các vạch được gắn kháng nguyên bắt giữ
tái tổ hợp của HIV1 (gp41, p24) (vạch 1) và kháng nguyên bắt giữ tái tổ hợp của
HIV2 (gp36) (vạch 2) và vùng cộng hợp chứa kháng nguyên HIV-1/2 tái tổ hợp
24
(gp41, p24 và gp36) gắn colloid. Vạch C gắn kháng kháng thể được dùng để kiểm
chứng, vạch này sẽ xuất hiện khi KTV thao tác đúng quy trình và dung dịch thử
nghiệm còn tốt. Nếu mẫu thử âm tính, không chứa kháng thể thì kháng kháng
- Cho 25µl huyết thanh bệnh nhân vào giếng số 1 (trộn 5 -6 lần)
Hút 25µl dung dịch từ giếng số 1 chuyển sang giếng số 2(trộn 5 -6 lần)
25