Bài thuyết trình kỹ thuật gen:
Cắt nối chọn lọc tiền mRNA của gen
sterol 27-hydroxylase (CYP 27) gây ra bởi
đột biến G thành A ở nucleotide cuối cùng
của exon 6 trong bệnh nhân mắc bệnh
cerebrotendinous xanthomatosis (CTX).
Nhóm 6 _ Lớp 10-03
Viện Đại học Mở Hà Nội
Khoa Công Nghệ Sinh Học
Tìm hiểu về bệnh cerebrotendinous
xanthomatosis (CTX)
!
" #$ % & ! ' ( ) *
+ ,- ./ 0 & ! 12 '
3456)*&70$%.8$7($4)
* 9:;14;'+
7<37=>?&@6
5+
7<37=4707'7'?
AB(CD542
"1=2
E
5%7.F%G;.;+
Các biểu hiện khác của CTX bao gồm tiêu chảy mãn tính ở trẻ
sơ sinh, làm đục ống kính của mắt (đục thủy tinh thể), phát triển
chậm ở trẻ nhỏ, xương dần dần giòn dễ gãy, có các vấn đề về thần
kinh ở tuổi trưởng thành, chẳng hạn như mất trí nhớ, co giật, ảo
giác, trầm cảm, và khó khăn với các phản ứng phối hợp (mất điều
hòa) và nói.
Các triệu chứng thần kinh gây ra bởi sự tích tụ các chất béo và
& b A ` A KLB
IJ KL % X
c7=>X&d,^A+
4 7D = ! 50 Be M A 7@ & [f .; R 5g
&bAD.;7&=5<"N
.:A-7D=7=Q4?X&d,^ 7.F
Q%7'h7=+445 97@"A>
=M^!&bA`"IJKL
c7=X&Ad,^$i_!jkQ
`$1 !D5b(. l !7@&[f5 &
4d,^7D=M^+,"R
7 = 3% 4N3m3" A7D=
;'51n70>)./QG?X
&d,^+
43.;
343$1o<A
"R
H1o<7.Fb7'3%457'
!47!3%T354";
: 1 .gp1& .F$ 7 5 ) ? A
G+
" R $./ T 9 A
5 3 7' 3% 4 1= QN
+
Kỹ thuật điện di
I. Kỹ thuật lai Northern blot
J% d,^ 2 5Q A" R 5
3%T$5?((')325>'A
; '&+ J.;343 7.F T9a 34
Khi đột biến xảy ra tại
nucleotide cuối cùng của
exon 6, hiệu quả của nó trên
phiên mã mRNA được phân
tích trong in vivo. Phân tích
Northern blot RNA của bệnh
nhân cho thấy một vạch
rộng hơn so với mẫu bình
thường (2.2 kb), chỉ ra rằng
có thể tồn tại loại nối mRNA
khác ở bệnh nhân. Không
giảm rõ ràng hiệu quả phiên
mã, ở bệnh nhân (0,90) so
với mẫu bình thường (0,97)
được xác định bằng cách
phân tích định lượng của
các tín hiệu.
II. Kỹ thuật PCR đảo ngược
RT-PCR (inverse PCR)
JN R dBJd 3N R 1= 7! D 7!
12 c d,^ " h A Jd+ r >
"D&5(d,^"&1=
7!D7!A(?./3Nb1o<
dBJd
MiK7!j
−
JN R = 7] d,^ F r,^ R )
3N / 7= D O 3" .F 5
3 5< 7! 7.F 3"
.Fd+Y7(Q4?]F3Fr,^R!/
H7.F>"DKt+J% 70.F
7.F>a4Q*$<7DA45!77.F3%
T93@,{Z{$e+`e+yB7.F1=7!.
D71'53% 70.F+
Kết quả
Trong sản phẩm RT-PCR
của bệnh nhân, tìm thấy hai
mạch nhỏ hơn ngoài đoạn
có kích thước bình thường
so với mẫu bình thường. Tỷ
lệ của ba loại là 1 : 0,84 :
0,16 (kích thước bình
thường: kích thước ở giữa:
kích thước nhỏ nhất) bằng
cách phân tích định lượng.
Số lượng kích thước
bình thường ở bệnh nhân
chiếm 54,1% RNA so với
RNA của người khỏa mạnh
được xác định bằng cách
phân tích định lượng.
III. Phân tích trình tự gen
Phân tích trình tự gen là kỹ thuật xác định trình tự theo cấu
trúc bậc một của chuỗi các nucleotide trong một phân tử
nucleic acid, xác đinh vị trí, sắp xếp các nucleotide trong phân
tử DNA. Trong những năm gần đây, một số phương pháp xác
định trình tự mới nhờ sự hỗ trợ của máy tính_ Giải trình tự
gen trên máy tự động.
Các bước thực tế
?>3% r,^7.F>a4T9^{Jd{YWƒ_e\
IV. Xây dựng vecter biểu hiện gen
H'Q41'&14%:>7D=M^
: & b A `$ ) !$ ( 5
12(7D=$77.F!57.F'!354=
‚Y+
?>8[•AIJKL8%
5D7&.F1k!7.F1=7!a4T9
iYJ3[fM^^M^^MM^MM^^_fjx•eB•ee
5 YJ [f^M^MM^MM^^ _f j e[•`B
e`eL+
JNR1=7!Jd7.F>_\1}
71je3G:•[v= 5w3G:`xvXi
51*+J@7@[f7!iY33RDX7@
^M550 .;7&B_A^MDM7.F7NN0
QN+J@&_f7!iYJR1=GM^+
Y14<1=7!27!Keee3a
7 $ ‡ > =3 5 5 '
3^dMSƒ7((RW†7@15>p
3$D1N'R7D‡$54
Y†w\ 3 : &+ J A 4 ) G
a ˆSY^d 3 V+ Z ( ) G
.;>$!87D=MB^:&bA`$
(4<:3% ?>+
V. Gây đột biến điểm định hướng
(site-directed mutagenesis)
M% 7D = 7' 70 .g B
Q4?!D=7]470"r,^a4
T9D]F33(D=7]
?>+
Để phân tích biểu hiện đột biến của cDNA chuỗi kép mang đột biến
! 7D$ K\ s 3 r,^ ? ./
# r,^ 7D = .; > 7.F ' !3 @ 5 e
e\Š`=+
Ywx$4=77.F!'54'
02<3'3@k7.FT91NKLB
+
Các bước thực tế
Phân tích trình tự xác nhận vạch ở 726
bp quan sát trong minigen bình thường
tương ứng với loại RNA có cách cắt nối
chính xác. Mặt khác, vạch đậm được
quan sát thấy trong các minigen đột biến
thiếu exon 5 và exon 6, và một vạch mờ
là minigen thiếu exon 6, vạch mờ còn lại
mất 1 đoạn 88 bp (tính ngược từ đầu 3’
của exon) và sử dụng một mối nối chưa
rõ nào đó ở đầu 5’. (Hình A)
Xác định các mạch cDNA bất thường
được tạo ra bởi cắt nối chọn lọc tiền
mRNA do đột biến, minigen cấu trúc
gồm trình tự gen từ exon 5 đến exon 9
của gen CYP27, có hoặc không có đột
biến, được chuyển nạp vào các tế bào
COS. RT-PCR phân tích của RNA tổng số
được chiết xuất từ các tế bào chuyển
nạp sử dụng mồi SPup và SPd, cho thấy
một vạch duy nhất ở 726 bp ở minigen
bình thường. Trong khi ở minigen đột
biến, có 1 vạch đậm ở 412 bp và 2 vạch
mở 560 và 638 bp. (Hình B)