MỘT SỐ VẤN ĐỀ VỀ ỨNG DỤNG CÔNG NGHỆ THÔNG TIN
TRONG NHẬN BIẾT NGUỒN GEN THỰC VẬT
guyễn Tiến Hưng, Hoàng Thị Hai,
guyễn Thị Hiền, guyễn Chí Tín
SUMMARY
Application of information technology for gets known plant gene sources
The established of information technology give human enjoy the new century.
Information technology impact to all most the face of field life. The application of
information technology to biology research being hot problem. In the world, many
countries, many organizations have been implicated bio-informatics and harvest
promoting result.
In Vietnam, the application bio-informatics still new and have many limited, special in
plant research. To present, Vietnam have some biology data-base as data-base in ational
Plant Gene Bank (include agronomy morphology data and background data), data-base in
protein
For research, conservation and exploitation-utilization of plant genetic resources, the
get known plant gene sources is the first work and very important. This is the key to
determined subject and the orientation conservation for plant genetic resources; it is the
base to build ational Basic Collection. Simultaneously, it helps determined target plant to
establish conservation zoon for indigenous plant groups and wild relative near with plant.
The accurate get known plant gene sources also scientific base for selected material for
breeding to new varieties by heterocyst or biotechnology modern method.
The application of information to establish the software to determined and get known
the classification sit gene sources becomes convenient and can subheading gene sources
by morphology data-base before application biotechnology modern method.
From problems above, we can clearly saw that the application of information
technology for gets know plant gene sources have been necessary and practical value.
Keywords: Application bio-informatics, get know, information, plant gene
Tạp chí khoa học và công nghệ nông nghiệp Việt Nam
2
I. ĐặT VấN Đề
thng nht cao phc v mc ớch tra cu, nhn dng cỏc loi cõy, qun lý v khai thỏc
s dng chỳng cú hiu qu. i vi cõy trng, da vo cỏc tiờu chớ phõn loi, cỏc nh
khoa hc ó thng kờ trờn th gii cú khong 5.000 loi cõy trng nụng nghip, riờng
Vit N am ó cú khong trờn di 1.000 loi c cp v mụ t trong cỏc cun Thc
vt chớ, Danh lc thc vt v mt s ti liu khỏc.
Tuy nhiờn, n nay vic phõn loi thc vt theo cỏc phng phỏp truyn thng cng
mi ỏp ng c n mc loi tr lờn, cỏc cp di loi cũn rt hn ch vi s
lng taxon nht nh.
T¹p chÝ khoa häc vµ c«ng nghÖ n«ng nghiÖp ViÖt Nam
3
2. Một số kết quả về ứng dụng công nghệ thông tin trong nhận biết nguồn gen thực
vật trên thế giới
ng dng công ngh thông tin vào nghiên cu sinh hc ưc các nưc N ht Bn,
Hàn Quc, Hoa Kỳ, N ga, là nhng nưc i tiên phong, ã hình thành ưc cơ s lý
lun và phương pháp lun cho mt lĩnh vc khoa hc mi là “Tin sinh hc” (Bio-
informatic). Hot ng chính ca nó trưc ht là xây dng phn mm các b d liu v
sinh hc, giúp cho vic khai thác phc v công tác nghiên cu, bo tn và s dng ngun
tài nguyên di truyn thc vt có hiu qu. Theo hưng này, các t chc và cơ quan
nghiên cu như: T chc N ông lương Th gii (FAO), Vin Tài nguyên Di truyn thc
vt Th gii (Bioversity), Vin nghiên cu lúa quc t (IRRI), Trung tâm Rau màu châu
Á (AVDRC) ã tin hành ng thi vic xây dng các cơ s d liu tài nguyên di
truyn thc vt song song vi vic xây dng các N gân hàng thc liu. Kt qu là các cơ
quan này ã thit lp ưc mt lot cơ s d liu tài nguyên di truyn thc vt như
PROSEA, GRIN , ICIS, CUBIK qung bá trên Internet. Mi i tưng có th truy cp
chia s thông tin hoc khai thác s dng. Mt s cơ s d liu chung liên kt n
nhiu d liu cũng ã ưc khi ng và ang tin hành th nghim như cơ s d liu
kt hp thông tin kiu gen và kiu hình ca các tp oàn qu gen GERMIN ATE do ba t
chc gm i hc Dundee, Vin nghiên cu cây trng Xctlen và Trung tâm Tài nguyên
Di truyn Thc vt Hà Lan phi hp thc hin. N hng cơ s d liu trên bưc u ã áp
ng ưc phn nào mc ích tra cu, nhn dng ngun gen thc vt cho nhiu i tưng
rng vi các phương pháp phân loi mi nht, thut ng sinh hc và khóa nh danh
loài giúp mi i tưng là hc sinh, sinh viên và nhng ngưi mun nghiên cu, tìm
hiu v các loài ng thc vt rng Vit N am, thm chí c nhng ngưi có kin
thc hn hp nht v phân loi cũng có th tip cn. Hn ch ca b d liu này
ch: Cu trúc ca nó gn vi kiu sách in t hơn, (gn vi cách tra cu ca GRIN
hay Eflora), tc là tra cu theo tên khoa hc là chính, không thuc kiu cơ s d liu
tra cu nhn dng, nh danh mu vt.
Trong lĩnh vc cây trng, hin nay h thng bo tn tài nguyên di truyn thc vt
quc gia ang lưu gi 20.800 ngun gen ca gn 300 loài cây trng phc v mc tiêu
lương thc và nông nghip quc gia bao gm các loi cây lương thc, thc phNm, rau,
bn a và nhp ni. N gân hàng gen cây trng quc gia ang tin hành xây dng b d
liu in t nhưng mi còn gii hn mc d liu v hình thái nông hc và d liu v
lai lch cho nhng i tưng ã khá rõ ràng. Mt trong nhng khó khăn ln xây dng
b d liu này là công tác nhn dng các ngun gen ca chúng ta còn yu, nhiu ngun
gen chưa ưc xác nh tên khoa hc hoc xác nh không chính xác (như các tp oàn cây
ci to t, cây thc ăn gia súc, mt s nhóm rau, u , ), iu này còn nh hưng rt ln
n quá trình nghiên cu, bo tn và khai thác các ngun gen ó như xác nh i tưng bo
tn, xây dng các tp oàn ht nhân, tp oàn cơ bn
III. KÕT LUËN
Xây dng b phn mm d liu v ngun gen thc vt là công vic khá phc tp,
òi hi phi có lc lưng mnh v ngun nhân lc cũng như trang thit b k thut.
Song trong hoàn cnh hin nay, Vit N am ang va thiu va yu v nhng iu này.
Công vic òi hi phi có nhng chuyên gia có trình và kinh nghim nhưng trong h
thng bo tn hu như có rt ít các chuyên gia thc th trong lĩnh vc phân loi thc
vt. Vic nh danh ngun gen ch yu da vào tên gi ca cây trng nên tin cy rt
thp. Vn nh dng trong các tp oàn qu gen ca h thng bo tn nói chung còn
b trùng lp nhiu, cn ưc tin hành b sung bng các bin pháp như ch th phân t
và hóa sinh nhưng v mt này chúng ta cũng còn rt yu.
Mt s nguyên nhân khách quan khác có tác ng ln n vic bo tn ngun gen thc
vt ca chúng ta như nhiu ngun gen quý him quc gia ã b xói mòn, mt s thc vt xâm
6. ITIS DATA ACCESS. Vascular Plant
Taxonomy Fourth Edition. Walters D. R. and Davis J. K., 1996.
gười phản biện
TS. Nguyễn Văn Vấn