CƠ SỞ DỮ LIỆU
Giới thiệu
Mô hình dữ liệu NCBI
(tuần 1)
Cơ sở dữ liệu trình tự GenBank
(tuần 2)
Cơ sở dữ liệu về cấu trúc
(tuần 3)
Cơ sở dữ liệu bản đồ genom
(tuần 4)
Các cơ sở dữ liệu
 Cơ sở dữ liệu NCBI
(National Center for
Biotechnology Information)
 Cơ sở dữ liệu EMBL-EBI
(European Molecular
Biology Laboratory-European Bioinformatics
Institute)
 Cơ sở dữ liệu CIB-DDBJ
(Center for Information
Biology-DNA Data Bank of Japan)
Mô hình dữ liệu NCBI
 NCBI dựa trên 4 dữ liệu cơ bản:
- Bài báo khoa học
- Trình tự ADN
- Trình tự protein
- Cấu trúc ba chiều.
 Ngoài ra còn có các cơ sở dữ liệu khác:
- Taxonomy
- Bản đồ genome
Mô hình dữ liệu NCBI:

Mô hình dữ liệu NCBI:
Yếu tố nhận dạng trình tự (SEQ-Ids)
 Accession.Version Combined Identifier: Do hợp tác
của GenBank, EMBL và DDBJ đưa ra
- Vẫn cho phép truy cập một bản ghi chỉ dựa trên số
truy cập mà không có phiên bản.
- Cho phép truy cập trình tự đã thay đổi sử dụng số
truy cập và số phiên bản.
- Cho biết trình tự đã thay đổi bao nhiêu lần dựa trên
số phiên bản.
 Accession Numbers on Protein Sequences:
- Accession.version Numbers cũng đã được sử dụng
cho trình tự protein trong CDS feature’s /protein ID
qualifier.
- Gồm 3 chữ in hoa kèm 5 số và 1 số chỉ phiên bản.