XÁC ĐỊNH THÀNH PHẦN LOÀI SÁN LÁ THƯỜNG GẶP Ở VIỆT NAM BẰNG SINH HỌC PHÂN TỬ - Pdf 20

XÁC ĐỊNH THÀNH PHẦN LOÀI SÁN LÁ THƯỜNG GẶP
Ở VIỆT NAM BẰNG SINH HỌC PHÂN TỬ

TÓM TẮT
Sán lá ký sinh ở người thường gặp ở Việt Nam bao gồm sán lá gan nhỏ lưu
hành ở ít nhất 24 tỉnh, sán lá gan lớn ít nhất ở 43 tỉnh, sán lá ruột lớn ít nhất 16
tỉnh, sán lá ruột bé ở ít nhất 15 tỉnh, sán lá phổi ở ít nhất 10 tỉnh.
Mục tiêu: Sử dụng kỹ thuật sinh học phân tử để xác định thành phần loài
sán lá ký sinh ở người thường gặp ở Việt Nam.
Phương pháp: sử dụng hệ gen ty thể (cob, cox, nad1) và/hoặc phần giao gen
(ITS-2) và 18S ribosome của hệ gen nhân, so sánh với các chủng đã biết của Việt
Nam và trên thế giới.
Kết quả: Các mẫu sán lá, sán dây và ấu trùng của chúng được thu thập từ 22
tỉnh ở cả 3 miền trong cả nước đã được giải trình tự v# so sánh với các chuỗi
chuẩn.
Kết luận: loài sán lá phổi được xác định là Paragonimus heterotremus; loài
sán lá gan lớn là Fasciola gigantica (có lai với F. hepatica); loài sán lá gan nhỏ ở
miền Bắc là Clonorchis sinensis; loài sán lá gan nhỏ ở miền Nam là Opisthorchis
viverrini; loài sán lá ruột lớn trên người là Fasciolopsis buski; loài sán lá ruột nhỏ
trên người là Haplorchis taichui và H. pumilio.
ABSTRACT
Common parasitic trematodes such as small liver fluke was determined in
more than 24 provinces; giant liver fluke in more than 43 provinces, giant
intestinal fluke in more than 16 provinces, small intestinal flukes in more than 15
provinces, lung fluke in more than 10 provinces in Vietnam.
Objectives: Used molecular method for identification of species of human
Trematode.
Methods: molecular method (PCR technique) using mitochondrial genetic
markers as cob, cox1, nad1, nuclear markers as ITS-2 and ribosomal 18S rRNA.
Results: Adult worms and larvae were collected from 22 provinces in
Vietnam were taxonomically identified by the sequence obtained for the above

PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU
Thu thập mẫu
Thu thập mẫu trên người
Sán lá gan, sán lá ruột từ bệnh nhân bằng đãi phân khi điều trị; mẫu sán lá
phổi từ đờm bệnh nhân khi điều trị. Các mẫu được thu thập từ các địa phương như
sau:
Sán lá gan nhỏ tại: Nam Định, Ninh Bình, Hà Tây, Thanh Hoá, Hà Nam,
Hoà Bình, Quảng Ninh, Nghệ An, Thừa Thiên- Huế, Quảng Nam, Phú Yên, Bình
Định và Đắc Lắc; sán lá phổi tại: Lai Châu, Sơn La, Lào Cai, Hoà Bình, Yên Bái;
sán lá ruột lớn tại: Nam Định, Ninh Bình, Nghệ An, Thừa Thiên- Huế, Cần Thơ và
An Giang; sán lá ruột nhỏ tại Yên Bái, Quảng Ninh, Nam Định, Ninh Bình, Thừa
Thiên Huế, Lâm Đồng.
Thu mẫu từ vật chủ trung gian
ấu trùng sán lá gan từ cá tại Hà Nội, Nam Định; ấu trùng sán lá ruột nhỏ tại
Nam Định, Ninh Bình; ấu trùng sán lá phổi thu thập từ cua tại Hoà Bình, Sơn La,
Lai Châu, Lào Cai, Yên Bái theo phương pháp tiêu cơ bằng pepsin acid.
Bảo quản mẫu
- Mẫu sán được rửa sạch bằng nước muối sinh lý.
- Mẫu được cố định trong cồn 70% và bảo quản lạnh – 20°C, cho đến khi
sử dụng.
Các bước tiến hành kỹ thuật
Tách chiết ADN từ mẫu nghiên cứu:
ADN tổng số được tách chiết bằng bộ hoá chất Genomic-Tip Kit hoặc
DNeasy hoặc QIAamp DNA kit (QIAGEN Inc.) theo qui trình của nhà sản xuất.
Mô tả rút gọn như sau: mẫu vật bảo quản trong cồn 70% được lấy ra và cho cồn
bay hơi hết trong ly tâm chân không, sau đó rửa nhiều lần trong PBS. Mẫu vật
được nghiền kỹ và xử lý với các dung môi của Kit, rồi hấp phụ lên màng và ly
chiết ADN theo qui trình tách chiết.
Chọn mồi cho phản ứng PCR
Gen cox1 (cytochrome oxidase 1) hoặc gen cob (cytochrome oxidase b)

( (Altschul và cs, 1997). Sự đồng nhất giữa
2 hay nhiều chuỗi được thu nhận qua so sánh đa chuỗi (multiple alignment) bằng
chương trình ClustalW bố trí sẵn trong hệ chương trình MacVector8.2 Tra cứu so
sánh sử dụng các phần mềm có trong các Trung tâm tin-sinh học quốc tế (NCBI =
National Centre for Biotechnology Information/USA ()
hay sử dụng một số chương trình đặc biệt có ở ExPASy (). Sự sai
khác về nucleotid và acid amin dưới 5% thông thường được đánh giá là biến đổi
nội loài (intraspecific variation) và 5% trở lên là biến đổi ngoại loài (Interspecific
variation) (Blair và Agatsuma, 1993).
KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU
Kết quả xác định loài sán lá gan nhỏ Clonorchis sinensis
Bảng 1: So sánh nucleotid tại 10 điểm có sự sai khác trong chuỗi gen cox1
của Clonorchis spp Việt Nam với C. sinensis chủng Trung Quốc (CsCN)
Ký hiệu

Chủng gốc

Các vị trí trong chuỗi gen cox1 trong giải trình tự
Nước

Địa phương

9

10

22

69



C

T

T
Cs(Kor)

H.Quốc

Nam Hàn

C

C

T

C

T

C

G

C

T


Thanh Hoá

C

C

T

T

T

C

G

C

T

A
CsNgNB2

Việtnam

Ninh Bình

C

C

T

C

G

C

T

A
CsNgND

Vietnam

Nam Định

C

C

T

T

T

C

G

A
CsNgHB

Vietnam

Hoà Bình

C

C

T

T

T

C

G

C

T

A
CsNgHT

Vietnam


Nhờ tải bản gốc

Tài liệu, ebook tham khảo khác

Music ♫

Copyright: Tài liệu đại học © DMCA.com Protection Status