B GIÁO DO
I HC M TP. H CHÍ MINH
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
tài:
TNG LÊN MEN
VI KHUN NI SINH Bacillus sp. T3
NHM NÂNG CAO HOT TÍNH KHÁNG
NM Corynespora cassiicola
KHOA CÔNG NGH SINH HC
CHUYÊN NGHÀNH: VI SINH SINH HC PHÂN T
GVHD : ThS. NGUY
SVTH : NGUYN THÀNH TRUNG
MSSV : 1053010856
KHÓA : 2010 2014
Tp. H Chí Minh, tháng 5 nm 2014
LI C
tài này, ngoài s c gng ca bn thân còn có s ng
dn ca thy cô, anh ch và s ca bn bè.
u tiên, em xin chân thành ct c các thy cô Khoa Công ngh Sinh
Hi Hc M Tp. H t cho em nhng kin thc
nn tng nht, em xin cy Nguyt Linh và thy
luôn bên cng, truyt kinh nghing viên em
tài.
Con c, co mu kin tt
nh con hoàn thành vic hc ca mình.
1.3.1 Lch s phát hin nm Corynespora cassiicola (Berk. & Curt.) Wei
12
1.3.2 Phân loi hc 12
1.3.3 m hình thái 12
1.3.4 m sinh lý 13
1.3.5 Kh n ti 14
1.3.6 Kh 14
1.3.7 ng xâm nhp và kh nh ca nm Corynespora
cassiicola 15
1.4 TNG QUAN V Bacillus 15
1.4.1 Phân loi 15
1.4.2 17
1.4.3 ng 17
SVTH: NGUYN THÀNH TRUNG ii
1.4.4 ng dng ca Bacillus 19
1.4.5 Cht chuyn hóa kháng nm ca Bacillus 20
1.5 QUY HOCH THC NGHIM 22
1.5.1 ch thc nghim 22
1.5.2 m quy hoch thc nghim 22
1.5.3 ng ca quy hoch thc nghim 23
1.5.4 Thí nghim sàng lc 24
1.5.5 T 26
1.5.6 Phn mm quy hoch thc nghim Minitab 16 30
VT LIU 37
2.1 THM NGHIÊN CU 38
2.2 VT LIU NGHIÊN CU 38
2.2.1 Chng vi sinh vt nghiên cu 38
2.2.2 Chng nm Corynespora cassiicola th nghim 38
610
và m t bào 57
3.3.2 ng kính vòng kháng nm 58
3.3.3 Sàng lc các yu t ng 61
3.3.4 Xnh yu t ng chính theo ma trn Plackett Burman 68
3.3.5 Thí nghim khu 73
3.3.6 Thí nghim tìm khong tc 75
3.3.7 Thí nghing b mt theo thit k thí nghim Box Behnken
77
3.4 KHO SÁT HOT TÍNH CHT KHÁNG NM THEO THI GIAN 84
3.5 SO SÁNH KH T NM Corynespora cassiicola CA MÔI
NG TNG NB 85
KT LUN VÀ KIN NGH 91
TÀI LIU THAM KHO 93
PH LC 102
SVTH: NGUYN THÀNH TRUNG iv
DANH MC CH VIT TT
ANOVA Oneway analysis of variance
C. cassiicola Corynespora cassiicola
CFU Colony forming unit
Cs. Cng s
NA Nutrent Agar
Bng 3.11. Giá tr các bin s trong thí nghim Plackett Burman tìm yu t nh
n hot tính kháng nm chng Bacillus sp. T3 68
Bng 3.12. Thit k thí nghim Plackett Burman và kt qu thí nghim vi các
m ca các yu t 69
Bng 3.13. B trí thí nghim khu cho 4 yu t ng chính 73
Bng 3.14. Tc chuyc chng Bacillus sp. T3 75
Bng 3.15. Kt qu ng kính vòng kháng nc sau khi thc hin p
pháp leo dc chng Bacillus sp. T3 76
Bng 3.16. Giá tr tng m trong thit k thí nghim Box Behnken 77
Bng 3.17. B trí và kt qu thí nghim Box Behnken chng Bacillus sp. T3 78
Bng 3.18ng kính vòng kháng nm theo thi gian chng Bacillus sp. T3 84
Bng 3.19. Kt qu th nghim phun dch lc c ch nm Corynespora cassiicola
chng vi khun Bacillus sp. T3 nuôi cng NB 86
SVTH: NGUYN THÀNH TRUNG vi
Bng 3.20. Kt qu th nghim phun dch lc c ch nm Corynespora cassiicola
chng vi khun Bacillus sp. T3 nuôi cng t 88
Bng 3.21. Tóm tt kt qu nghiên cu 90
SVTH: NGUYN THÀNH TRUNG vii
DANH MC BI
Bi n tính gia OD
610
và m t bào Bacillus sp.
T3 58
Bi ng theo thi gian chng Bacillus sp. T3 59
Bi 3.3. ng kính vòng kháng nm theo thi gian chng Bacillus sp. T3 60
Bi 3.4. Kt qu các nguo sát 62
Hình 3.1. Hình thái nhum Gram vi khun Bacillus sp. T3 56
Hình 3.2. Hình thái khun lc vi khun Bacillus sp. ng NA 56
Hình 3.3. Kt qu th kh ng ging khuch tán chng Bacillus sp. T3
57
Hình 3.4. Kt qu giá tr ta các yu t ng chính 83
SVTH: NGUYN THÀNH TRUNG 1
T V
c tho mc, sn phm công ngh sinh hng chuyn gen kháng
nhn hoc gim bt thit hi do bnh ht bin pháp
tt, có nhiu trin v
Vi nhóm vi sinh vc s dng trong bin pháp sinh hc, thì Bacillus là
mt trong nhng nhóm vi khun c nghiên c ã có nhiu tài liu chng
minh Bacillus có kh m soát sinh hi vi nm bnh trên cây tr
kim soát nm Aspergillus flavus u phng (
Kong và cs., 2010), kim soát
Fusarium solani gây bnh trên cây cà chua (Ebtsam và cs., 2009), kim soát nm
Fusarium oxysporum f. sp. spinaciae (Zhao và cs., 2013). Chi Bacillus có nhiu loài
có li, có kh o ra nhiu hp cht sinh hcht kháng
SVTH: NGUYN THÀNH TRUNG 3
nm và kháng khun, các enzym ngoi bào, các chng thc vt
và các cht hong b mt. (Bottone và cs., 2003)
Chng Bacillus sp. c cung cp bi phòng thí nghim Công ngh Vi
sinh i Hc M Tp. H c ch
in vitroCorynespora cassiicola. Kt qu ng hot
tính c ch nm Corynespora cassiicola i vi chng vi khun ni sinh
Bacillus sp. T3 và tiêu dic nm Corynespora cassiicola n nguyên
cht ca dch nuôi cy (không có kh c lng mi sau khi x
lý vi dch nuôi cy vi khun) (Nguycs., 2013). Trong nghiên cu
này, chúng tôi tp trung chính vào nghiên cu ng t ng vi
khun ni sinh Bacillus sp. T3 nhm nâng cao hot tính kháng nm Corynespora
cassiicola.
T tài nghiên cTng lên
men chng vi khun ni sinh Bacillus sp. T3 nhm nâng cao hot tính nm
Corynespora cassiicola
Mc tiêu:
T ng lên men chng vi khun ni sinh Bacillus sp. T3
SVTH: NGUYN THÀNH TRUNG 5
1.1 O SU Hevea brasiliensis muell. arg
1.1.1 Phân loi hc
Euphorbiaceae,
Moraceae, Apocynaceae, Aslepiadaceae, Compositae
Hevea brasiliensis
HeveaEuphorbiaceae
. Trí, 2004)
1.1.2 Ngun gc
Nam
(Souza và cs., 2013)
. Trí, 2004)
1.1.3 c m thc vt hc
Cây cao su thuc loi thân g, to, cao. nh cao t
20 m n 30 m. Cu to ca thân cao su có phn quan trng là v
phn sn sinh ra nha m quyt sng m. Lá cao su mc
cách, có ba lá chét nh cung dài, có hình bu dn, mt nhn gân song
i vi cây cao su thì lá có vai trò rt quan trng, ng trc tin sn
ng m. V n sinh thái cây cao su phát trin tt
hi nhi trung bình 25
o
L m chc hn
nhii v cht, c trng t Bc
n Nam. (Nguyn Hu Trí, 2004)
1.1.4 Vai trò và tình hình sn xut
lâm công ngh
Corynespora cassiicola
ích. (Han và cs., 2005; Klich và cs., 1994)
SVTH: NGUYN THÀNH TRUNG 7
n nay vic nghiên cu ch ph tr bnh rng lá trên cây cao
su vc quan tâm c c.
Corynespora cassiicola
Bacillus sp. T9 và Bacillus
1.2 ESPORA TRÊN CÂY CAO SU
1.2.1 Phân b
Bnh rng lá Corynespora do tác nhân là nm Corynespora cassiicola, có tác
hi ln tc trng cao su trong khu vnh xut hin
lu trên cây cao su tp theo lt ghi
nhn ti
1988. Bnh gây thit hi
nng nht ti nh b và trng li trên 5.000 ha. Ti Malaysia,
Thái Lan và Indonesia nhiu ngàn ha cao su b hi nng làm ng ln sn
t toàn b , 2009)
Bnh xut hin ti Vii nng cho các
trên din rng mt s tnh mi, Tây Nguyên và min Trung, tp
trung trên dòng vô tính cao su RRIV4, hin chim ding khá ln c
nhn và ti
1.2.2 Triu chng bnh trên cây cao su
1.2.2.1
hin trên phin lá.
Trên chi, các chi xanh d nhim bm b
tn công và gây hi c ch Vt bnh có th phát trin 20 cm
gây cht cht c
cs., 2010)
1.2.3 Tác hi bnh rng lá Corynespora trên cây cao su
1.2.3.1 Sri Lanka
Dòng vô tính
òng vô tính
òng vô tínhh: RRIC 103,
RRIC 104, RRIM 600, 725, Tjir 1, IAN 873 FX 25 và
và RRIC 133.
(Jayasuriya và Thennakoon
1.2.3.2
Dch bnh l1996, nguy him nht trên dòng vô tính RRII
105 chim gn 80% dic. Bnh gây gim sng m n
50% vùng b hi nng. Hi trà trên 10. hn ch
dch bnh và áp dng nhu kin thun li cho bnh xut hin.
n
sau: RRII 105, RRII 118, RRII 300, PR 107, PR 255, PR 261, PB 86, PB217,
PB235, PB255, PB 260, PB 311. (Jayasinghe,
SVTH: NGUYN THÀNH TRUNG 10
1.2.3.3 Indonesia
Vào thp niên 80, 1200 ha cao su b nhim bnh nng và phi cht b 400 ha,
thit hi khong 200 triu Rupiah. 70% dic b bnh gây hi
m khác nhau. Nhiu dòng vô tính cao sn phi loi b: IAN 873, mt s PR
Xut hin vào tháng 8 1999 ti RRIV, gây hi cho dòng vô tính: RRIC
103, RRIC 104, LH 88/372. Cu9, hin din tng Nai, Du
Tii nng trên din tích gn 200
ha ti công ty Lc Ninh các la tui ca cây cao su. Gây bnh trên lá non, già và
c chi. Hu qu, gây rng lá hàng lot làm ng lng và sn
ng. a các dòng vô tính RRIC 103, RRIC 104, LH 88/372
phi tiêu hu. Tip theo nhiu din tích cao su trng bng dòng vô tính RRIC 104
phi trng li. T n nay, bnh có s i v triu ch
tích ly i bùng phát.
n g
RRIV4. Nhiu dòng vô tính nhim bnh m
., 2010)
1.2.4 Cách phòng tr
Do gây hng t n
n khai thác, nên dòng vô tính cao su kháng bnh. Tránh
trng các dòng vô tính cao su mn cm: RRIC 103, RRIC 104, RRIV 3, RRIV 4
Ghép tán bng các dòng vô tính cao su kháng bnh.
Áp dng 1 trong nhng công thc: (1) hexaconazole (5% a.i) n 0,2
0,3%; (2) Hn hp carbendazim (50% a.i) 0,1 0,15% + hexaconazole (5% a.i)
0,1 0,15% (phi trn theo t l 1:1); (3) Thuc phi trn sn gc carbendazim và
gc hexaconazole n ng thuc gc (0,2 0,3%). Pha phi
hp vi cht bám dính BDNH 2000 n
Cn chú ý phun mi lá là
m xâm nhp vi chu k 7 10 ngày/ln.
o m nhng cây b cht tán và cây b bnh nng. (Phan Thành
mng mc nhiu các t bào tn cùng ca bào t (Chee, 1988). Phan Thành
n s bin thiên v c và hình dng c
SVTH: NGUYN THÀNH TRUNG 13
phân lp t lá cao su b nhim bnh ngoài t nhiên và nuôi cy trên môi
ng Potato Dextrose Agar (PDA). Chiu rng trung bình c và
cung bào t l phân lp
t ng dài, thon và có ng nuôi c
ng.
Hình 1.5. Khun lc nm Corynespora cassiicola ng PDA
Hình 1.6Corynespora cassiicolach
lactophenol
1.3.4 c m sinh lý
Corynespora cassiicola phát trin và hình thành bào t tng
Potato Sucrose Agar (PSA) (Sarma và cs., 1970). Onesirosan và cs.
thu kin tt nht cho s phát trin ca C. cassiicola là 28ºC. 32
36ºC nm phát trin chm và khun l
(1995), C. cassiicola phân lp t cây cao su ny mng PSA
nhiu kin nhit
SVTH: NGUYN THÀNH TRUNG 14
thích hp nht cho nm phát trin là 28ºC. Chee (1988) cho rng C. cassiicola
SVTH: NGUYN THÀNH TRUNG 15
ca chúng li n là nguyên nhân mà bnh lan truyn
chm gia các khu vc cách xa nhau. (Mushrif, 2006)
1.3.7 Con ng xâm nhp và kh gây bnh ca nm
Corynespora cassiicola
C. cassiicola
cellulose Trong quá trình
CC toxin
,
Ngoài cây cao su, nm còn là ký sinh ca trên 150 loi cây trng thuc nhiu
h c thuc nhiu vùng khí hu t nhii và có
kh i trên tt c các b phn ca cây t n rn nm
t cây cao su gây hc li.
1.4 Bacillus
1.4.1 Phân loi
Theo khóa phân loi ca Bergey, Bacillus c phân lo
: Bacteria
Ngành: Firmicutes
Lp: Bacilli
B: Bacillales
H: Bacillaceae
Chi: Bacillus
Chi Bacillus là mt chi ln (có nh chính xác và nhiu
c phân long, thuc h Bacillaceae. H này
chia làm 5 chi, gm: Bacillus, Sporolactobacillus, Clostridium, Sporosarcina,
Desulfotomaculum. a h này là s hình thành ni bào t