Xác định đặc tính sinh học phân tử gen VP1 của các chủng virus
vacxin viêm gan vịt ở Việt Nam và so sánh với một số chủng
khác của thế giới
Đề cương đề tài mã số: CH0852
Lời cam đoan...................................................................................................................................1
Lời cảm ơn.......................................................................................................................................2
Mục lục............................................................................................................................................3
Danh mục các chữ viết tắt...............................................................................................................6
Danh mục bảng................................................................................................................................7
Danh mục hình..........................................................................................................................8
1. MỞ ĐẦU...................................................................................................................................10
1.1 Tính cấp thiết của đề
tài…………………………………………………….. 10
1.2 Mục tiêu nghiên cứu của đề tài……………………………………………...11
1.3 Ý nghĩa khoa học của đề tài…………………………………………………11
2. TỔNG QUAN TÀI LIỆU.........................................................................................................12
2.1 Bệnh viêm gan virus ở vịt (Duck Hepatitis)
………………………………...12
2.1.1 Sơ lược về lịch sử phân bố bệnh………………………………………..12
2.1.2 Loài mắc bệnh…………………………………………………………..13
2.1.3 Đường xâm nhập và cách lây lan……………………………………….13
2.1.4 Cơ chế gây bệnh của virus……………………………………………...14
2.1.5 Triệu chứng lâm sàng và bệnh tích……………………………………..14
2.1.6 Chẩn đoán bệnh viêm gan vịt do virus………………………………….16
2.1.7 Phòng chống bệnh………………………………………………………17
2.2 Một số đặc tính sinh học của virus viêm gan vịt type I……………………..18
2.2.1 Đặc tính nuôi cấy virus…………………………………………………18
2.2.2 Sức đề kháng của DHV-1………………………………………………20
2.2.3 Đặc tính kháng nguyên của virus DHV-1………………………………20
2.2.4 Biến dị của virus
....................................................................................................................

3.5.2 Phương pháp thực hiện phản ứng RT-PCR một bước.…………………43
3.5.3 Phát hiện sản phẩm RT-PCR ……………..……………………………44
3.5.4 Tinh sạch sản phẩm RT-PCR…..………….……………………………45
3.5.5 Phương pháp tách dòng và lưu giữ nguồn gen …………………………45
3.5.6 Thực hiện phản ứng giải trình trình tự…….……………………………49
3.5.7 Tinh sạch sản phẩm giải trình trình tự ...….……………………………50
3.5.8 Xử lý số liệu……………………………….……………………………51
4. KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN......................................................................................................52
4.1 Kết quả tách chiết RNA tổng số………………………….. ………………..52
4.2 Kết quả phản ứng RT-PCR ………………………………..………………..53
4.3 Kết quả dòng hóa và tách dòng sản phẩm………………… ………………..54
4.3.1 Kết quả dòng hóa sản phẩm vào tế bào khả biến E.coli .………………54
4.3.2 Kết quả kiểm tra DNA plasmid tái tổ hợp ..……………………………56
4.4 Kết quả giải trình trình tự nucleotit và axit amin của gen kháng nguyên VP1 ở 2 chủng virus
vacxin viêm gan vịt…………………………….. ……………….57
4.5 Kết quả truy cập ngân hàng gen, so sánh chuỗi gen kháng nguyên VP1 của 2 chủng virus
vacxin nghiên cứu với một số chủng khác trên thế giới…..………..59
4.6 So sánh thành phần nucleotit và axit amin của gen VP1 giữa hai chủng virus vacxin ở Việt
Nam và một số chủng trên thế giới……………..………………..62
4.6.1 Các chủng tham gia trong phân tích so sánh ..…………………………62
4.6.2 Kết quả đối chiếu so sánh thành phần nucleotit và axit amin vùng gen VP1 của VxAC và
VxXT với các chủng khác trên thế giới …………………63
4.7 Tỷ lệ tương đồng nucleotit và axit amin giữa các chủng nghiên cứu ..……..69
4.8 Kết quả phân tích mối quan hệ phả hệ giữa hai chủng virus nghiên cứu (VxAC và VxXT)
với một số chủng khác……………………. ………………..71
5. KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ......................................................................................................74
5.1 Kết luận ……………………………………………………………………..74
5.2 Kiến nghị…………………………………………………...
………………..74
TÀI LIỆU THAM KHẢO.................................................................................................................75

1.1 TÍNH CẤP THIẾT CỦA ĐỀ TÀI .........................................................................7
1.2 MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU CỦA ĐỀ TÀI............................................................8
1.3 Ý NGHĨA KHOA HỌC CỦA ĐỀ TÀI...................................................................8