B GIÁO DC VÀ ÀO TO
TRNG I HC M TP. H CHÍ MINH
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
Tên đ tài:
ÁNH GIÁ KH NNG I KHÁNG VI VI
KHUN Vibrio paraheamolyticus PHÂN LP T
MU TÔM BNH HOI T GAN TY (AHPNS)
CA MT S CHNG Bacillus
KHOA CÔNG NGH SINH HC
CHUYÊN NGHÀNH: VI SINH – SINH HC PHÂN T
GVHD : Ths. NGUYN THANH THUN
Ths. NGUYN VN MINH
SVTH : LÊ ANH TUN
MSSV : 1053010888
KHÓA : 2010 – 2014
Tp. H Chí Minh, tháng 5 nm 2014
LI CM N
hoàn thành đ tài này, ngoài s c gng ca bn thân còn có s hng
dn ca thy cô, anh ch và s giúp đ ca bn bè.
u tiên, em xin chân thành cm n tt c các thy cô Khoa Công ngh Sinh
Hc trng i Hc M Tp. H Chí Minh đã truyn đt cho em nhng kin thc
nn tng nht, em xin cm n thy Nguyn Thanh Thun, thy Nguyn Vn Minh,
cô Dng Nh
t Linh và thy an Duy Pháp luôn bên cnh đnh hng, truyn đt
kinh nghim, đng viên em hoàn thành đ tài.
1.2.2 Tình hình dùng hóa cht, kháng sinh điu tr bnh tôm 9
1.3 BNH HOI T GAN TY EMS/AHPNS TRÊN TÔM TH 11
1.3.1 Tình hình dch bnh 11
1.3.2 Tác nhân gây bnh 13
1.3.3 Mt s đc đim ca Vibrio parahaemolyticus 14
1.4 GII THIU PROBIOTIC VÀ VIC NG DNG TRONG NUÔI
TRNG THY SN 15
1.4.1 nh ngha probiotic 15
1.4.2 iu kin yêu cu cho probiotic 16
1.4.3 Vai trò ca probiotic trong nuôi trng thy sn 16
1.5 GII THIU V Bacillus 19
1.5.1 c đim chung ca chi Bacillus 19
1.5.2 ng dng ca Bacillus trong nuôi trng thy sn 21
1.5.3 S dng ch phm sinh hc t Bacillus đ kim soát mm bnh
do Vibrio 21
CHNG 2. VT LIU VÀ PHNG PHÁP NGHIÊN CU 24
2.1 THI GIAN VÀ A IM NGHIÊN CU 25
2.2 VT LIU NGHIÊN CU 25
SVTH: Lê Anh Tun
ii
2.2.1 Chng vi sinh vt 25
2.2.2 Tôm dùng đ th nghim 25
2.2.3 Môi trng - hóa cht 25
2.2.4 Thit b - dng c 26
2.3 PHNG PHÁP NGHIÊN CU 27
2.3.1 Hot hóa ging 27
SVTH: Lê Anh Tun
iii
PH LC 2 74
SVTH: Lê Anh Tun
iv
Bng 3.1 Kt qu phân lp 41
Bng 3.2 Kt qu nhum Gram 7 chng phân lp đc t mu bnh 45
Bng 3.3 Kt qu đnh danh Vibrio sp. NT
7
45
Bng 3.4 Kt qu LD
50
ca chng Vibrio parahaemolyticus NT
7
48
Bng 3.5 Kt qu th đi kháng bng phng pháp cy vch vuông góc 49
Bng 3.6 Kt qu th kh nng đi kháng bng phng pháp đc l thch 51
Bng 3.7 Kt qu th nghim tính an toàn ca chng Bacillus sp. F
33
54
Bng 3.8 T l tôm sng sau khi cm nhim vi V. parahaemolyticus NT
7
(%) 54
SVTH: Lê Anh Tun
vi
DANH MC CÁC HÌNH
Hình 3.6 Kt qu th nghim bng phng pháp đc l thch 53
SVTH: Lê Anh Tun
vi
DANH MC S
S đ 2.1 Phng pháp thí nghim 27
S đ 2.2 S đ th đi kháng bng phng pháp đc l thch 37
SVTH: Lê Anh Tun
vi
DANH MC BIU VÀ TH
Biu đ 3.1 Kh nng đi kháng ca Bacillus spp. đi vi Vibrio parahaemolyticus
NT
7
52
th 3.2. T l tôm sng sau khi cm nhim Vibrio parahaemolyticus NT
7
55
KHÓA LUN TT NGHIP T VN
Necrosis Syndrome (AHPNS) (Flegel và cs., 2012).
Vit Nam, cn bnh này đã xut hin t nm 2010, nhng s tàn phá rng
rãi nht do EMS ch đc báo cáo k t tháng 3 nm 2011 đng bng sông Cu
Long (Vit Nam). Nó
nh hng chính đn khu vc sn xut tôm: Tin Giang, Bn
Tre, Kiên Giang, Sóc Trng, Bc Liêu và Cà Mau vi tng din tích ao tôm khong
98.000 ha. Trong tháng 6 nm 2011, thit hi cha tng thy tôm sú đã đc báo
cáo trong 11.000 ha nuôi tôm Bc Liêu, 6.200 ha ti Trà Vinh (tng cng 330
triu con tôm đã cht gây thit hi trên 12 t đng), và 20.000 ha ti Sóc Trng (gây
ra thit hi 1,5 nghìn t) (Mooney, 2012).
Trong nm 2010, hi chng t vong sm (EMS) xut hin trên các trang tri
nuôi tôm min nam và trên đo Hi Nam ca Trung Quc. AHPNS đã đc xác
nhn ti Vit Nam và Malaysia nm 2011 và bnh đn Thái Lan trong nm 2012.
Bnh xut hin trong vòng 20-30 ngày sau khi th ging, tôm sú và tôm th chân
trng. Tôm b bnh tr nên l đ, ngng n, d dày và rut trng rng, v mng,
màu sc nht nht, tng trng chm, gan ty xanh xao, nhng và teo và t l cht
KHÓA LUN TT NGHIP T VN
SVTH: Lê Anh Tun
3
lên ti 100% làm cho các ao nuôi tôm b nh hng nghiêm trng (Lightner và cs.,
2012).
Vào đu nm 2013, phòng thí nghim bnh hc trên nuôi trng thy sn i
hc Arizona đã có th cô lp tác nhân gây bnh EMS/AHPNS trong môi trng
nhân to. Th nghim ly t các mu thc đa cho thy nguyên nhân gây bnh là do
vi khun Vibrio parahaemolyticus (Lightner và cs., 2012).
Nm 2013, mt nghiên cu ca Lingtner và cs. cho thy Vibrio
parahaemolyticus b nhim phage (mt th thc khun) làm cho đc t c
a vi khun
Tuyn chn và sàng lc nhng chng Bacillus đi kháng mnh vi vi khun
Vibrio parahaemolyticus phân lp t mu tôm th bnh hoi t gan ty (AHPNS).
Ni dung thc hin:
- Tái phân lp chng Bacillus t b su tp chng ca phòng thí nghim Công
ngh vi sinh.
- Phân lp Vibrio parahaemolyticus t mu tôm bnh.
- Th nghim LD
50
.
- Th đi kháng vi mt s chng Bacillus.
- Th nghim tính an toàn và kh nng bo v ca chng Bacillus lên tôm
ging. KHÓA LUN TT NGHIP TNG QUAN TÀI LIU
SVTH: Lê Anh Tun
5
chân trng ca Trung Quc nm 2003 đt 600 nghìn tn (chim 76% tng sn lng
tôm nuôi ti nc này); đn nm 2008 tôm th chân trng đt sn lng 1,2 triu tn
(trong tng s 1,6 triu tn tôm nuôi). Inđônêxia nhp tôm th chân trng v nuôi t
nm 2002 và nm 2005 đt 40 nghìn tn, n
m 2007 là 120 nghìn tn (trong tng sn
lng 320 nghìn tn).
Nm 2004, tôm th chân trng dn đu v sn lng tôm nuôi, đóng góp trên
50% tng sn lng tôm nuôi trên th gii. Nm 2007, tôm th chân trng chim
75% tng sn lng tôm nuôi toàn cu và là đi tng nuôi chính 3 nc châu Á
(Thái Lan, Trung Quc, Inđônêxia). Ba nc này cng chính là nhng quc gia dn
đu th gii v nuôi tôm.
KHÓA LUN TT NGHIP TNG QUAN TÀI LIU
SVTH: Lê Anh Tun
7
n nm 2003 thì các nc châu Á bt đu nuôi đi tng này và sn lng
tôm th chân trng trên th gii đt khong 1 triu tn, t đó sn lng tôm liên tc
tng nhanh qua các nm, đn nm 2010 sn lng tôm đt khong 2,7 triu tn
(FAO, 2011). n nm 2012 sn lng tôm đt khong 4 triu tn (GOAL 2013).
Các nc nuôi tôm ch yu trên th gii gm Trung Quc, Thái Lan, Indonesia,
Brazil, Ecuador, Mexico, Venezuela, Honduras, Guatemala, Nicaragua, Belize, Vi
t
Nam, Malaysia, Thái Bình Dng, Peru, Colombia, Costa Rica, Panama, El
Salvador, Hoa K, n , Philippines, Campuchia, Suriname, Saint Kitts, Jamaica,
Cuba, Cng hòa Dominica, Bahamas (FAO, 2012). Trong đó Trung Quc có sn
lng cao nht th gii đt khong 1,3 triu tn vào nm 2012 (GOAL, 2012). Hình
thc nuôi ch yu là thâm canh và siêu thâm canh. D kin sn lng tôm th chân
trng đt sn lng khong 6 triu tn vào nm 2015 (GOAL, 2012).
1.1.2 Tình hình nuôi tôm th chân trng Vit Nam
Tôm th chân trng đc đa vào Vit Nam nm 2001 và đc nuôi th
2006 18.441 57.185 3.100
2007 19.919 64.776 3.250
2008 15.079 47.827 3.170
2009 21.339 89.521 4.190
2010 25.397 136.719 5.380
2011 28.683 152.939 5.330
2012 41.789 186.197 4.460
Tháng 9 -2013 47.300 106.479 2.251
Ngun: Tng cc thy sn, 2013.
1.2 TÌNH HÌNH DCH BNH
1.2.1 Mt s bnh do Vibrio gây ra trong nuôi trng thy sn
Bnh do mt s loài vi khun thuc nhóm Vibrio spp. đã đc công b là tác
nhân gây bnh nghiêm trng mt s đi tng nuôi thy sn (Austin và cs., 1993).
Bên cnh V. anguillarum và V. ordalii đc xem là mt trong nhng tác nhân gây
bnh ch yu thuc nhóm Vibrio spp., mt s loài thuc nhóm này cng đc công
b là tác nhân gây bnh mt s đi tng nuôi thy sn quan trng. Mt s tr
ng
hp đin hình nh: V. vulnificus cá chình Anguilla anguilla (Biosca và cs., 1991);
V. alginolyticus cá tráp Sparus aurata và cá mú Epinephelus malabaricus
(Colorni và cs., 1981; Lee 1995); V. salmonicida cá hi (Austin và cs., 1993).
Mt s loài vi khun Vibrio có kh nng phát sáng nh V. harveyi, V.
splendida, V. orientalis, V. fischeri, V. vulnificus. Trong đó, V. harveyi đã đc xác
đnh là tác nhân gây bnh phát sáng trai ngc Pinctada maxima, tôm sú Penaeus
KHÓA LUN TT NGHIP TNG QUAN TÀI LIU
SVTH: Lê Anh Tun
9
monodon và tôm he Nht Bn Penaeus japonicus (Lavilla-Pitogo và cs., 1990;
Karunasagar và cs., 1994). Bnh do nhóm vi khun phát sáng đã gây thit hi kinh
t trong nuôi tôm công nghip Philipines, n và Indonesia. Các nghiên cu
vn sng sót, bi chúng đã mang gen kháng thuc. Bt c mm bnh nào tr li
KHÓA LUN TT NGHIP TNG QUAN TÀI LIU
SVTH: Lê Anh Tun
10
trong ao hay các b cha t rut cá hay t đng ng nc, đu có th trao đi gen
vi các vi khun kháng thuc và còn khe hn trc. Do vy, các mm bnh kháng
thuc phát trin rt nhanh do đi th cnh tranh đã b loi tr. Nng đ tetracycline
không đ mnh đ dit tr vi khun, do vy t l truyn gen gia Vibrio cholerae và
Aeromonas salmonicida tng 100 ln.
i
u đáng quan tâm là mô hình nuôi tôm các h dân đa phn không có h
thng x lý nc thi. Do vy lng hóa cht này cùng nc thi ca h nuôi đa
trc tip ra môi trng và gây ô nhim ngun nc, to thành vòng lun qun ô
nhim cho ngi nuôi tôm, gây tác hi cho h sinh vt trong môi trng. Nu ch
mt vài h nuôi x b cht thi kiu đó ra bin thì không sao, nhng vài chc h
dân cùng th
i nc nh vy t hn c vùng bin b ô nhim, ngun bin li thông
vi các ca sông nên nh hng li càng nghiêm trng hn. c bit, cn ht sc
thn trng khi s dng thuc tr sâu hu c bi l chúng có đc tính và kh nng n
đnh rt cao, gây nh hng đn cht lng sn phm nuôi trng và s
c khe con
ngi do c ch tích ly sinh hc.
Các loi phân bón nh Superphotphat urê, phân trâu bò, phân gà,… dùng đ
tng cng s sinh trng ca các đi tng làm thc n cho tôm cng có th góp
phn làm tng thêm ti trng cht dinh dng vô c hay hu c cho thy vc nuôi.
Tóm li, vn đ s dng hóa cht cng nh kháng sinh ch gii quyt tình
trng bnh trong thi đi
m nht thi nng nó li mang đn không ít tác hi trong
đi sng và kinh t nh sau:
phía đông vnh Thái Lan (Flegel, 2012; Enduardo và cs., 2012).
Bnh nh hng nghiêm trng đn trang tri nuôi tôm ông Nam Á, nh
hng lên c tôm sú (Penaeus monodon) và tôm chân trng (Penaeus vannamei),
đc đc trng bi vic cht hàng lot (có th lên đn 100% trong mt s trng
hp) trong 20-30 ngày đu tiên th nuôi (sau th ging trong ao nuôi thng phm).
Du hiu lâm sàng có th quan sát đc bao gm: tng trng chm, bi xon c,
v m
m, cng nh màu sc nht nht. Tôm b nh hng cng đu cho thy du
hiu bt thng gan ty (teo tóp li, nh, sng hoc đi màu). Các tác nhân gây
bnh chính (xem xét bnh có th lây bnh) cha đc xác đnh, trong khi s hin
din ca mt s vi khun bao gm c vi khun Vibrio, Microsporidians và giun tròn
đã đc quan sát thy trong mt s mu. (Lightner và cs., 2012)
Trung Qu
c, s xut hin ca EMS nm 2009 ban đu không đc chú ý
bi hu ht nông dân. Nhng trong nm 2011, s bùng phát tr nên nghiêm trng
hn, đc bit trong các trang tri vi thâm niên nuôi hn 5 nm và nhng ni gn
KHÓA LUN TT NGHIP TNG QUAN TÀI LIU
SVTH: Lê Anh Tun
12
hn vi bin bng cách s dng nc rt mn (Panakorn, 2012). Nuôi tôm Hi
Nam, Qung ông, Phúc Kin và Qung Tây b trong na đu nm 2011 vi gn
80% b thit hi.
Ti Malaysia, EMS ln đu tiên đc báo cáo vào gia nm 2010 b bin
phía đông ca bán đo bang Pahang và Johor. Các dch EMS dn đn s st gim
đáng k trong sn xut tôm th chân tr
ng, t 70.000 tn nm 2010 xung 40.000
tn trong nm 2011. Sn xut trong nm 2012 (đn tháng 7) ch là 30.000 tn và ti
t hn d kin báo cáo cha đc xác nhn nh trên dch EMS ti các bang Sabah
và Sarawak đn tháng t nm 2012 (Enduardo và cs., 2012).
1.3.2 Tác nhân gây bnh
Vào đu nm 2013, phòng thí nghim bnh hc trên nuôi trng thy sn i
hc Arizona đã có th cô lp tác nhân gây bnh EMS/AHPNS trong môi trng
nhân to. Th nghim ly t các mu thc đa cho thy nguyên nhân gây bnh là do
vi khun Vibrio parahaemolyticus (Lightner và cs, 2012).
Hin nay đã có nhiu công b tác nhân gây bnh EMS/AHPNS, nhóm
nghiên cu ca TS. Lightner đã phát hin thy rng EMS đc gây ra bi mt loi
vi khun (Vibrio parahaemolyticus) b nhim phage (mt th
thc khun) làm cho
đc t ca vi khun tng lên. Chúng xâm chim đng tiêu hóa ca tôm và sinh ra
đc t gây phá hy mô và ri lon chc nng ca gan ty, c quan tiêu hóa ca tôm
(theo FAO); (Lightner và cs, 2012).
Tác đng ca vi khun Vibrio parahaemolyticus đã đc đa ra nhiu ln.
Vibrio parahaemolyticus tip tc đc phân lp t tôm b nhim EMS / AHPNS.
Da trên công vic thc hin Trung Quc, các nhà nghiên cu Trung Quc đã báo
KHÓA LUN TT NGHIP TNG QUAN TÀI LIU
SVTH: Lê Anh Tun
14
cáo v đc lc ca mt chng V. parahaemolyticus phân lp t tôm th chân trng
b bnh t vong sm trong nm 2010 ti tnh Qung Tây (Zhang và cs., 2012).
1.3.3 Mt s đc đim ca Vibrio parahaemolyticus
1.3.3.1 Phân loi
Theo phân loi ca Bergey (1994) Vibrio parahaemolyticus thuc
Ngành: Proteobacteria
Lp: Gammaproteobacteria
B: Vibrionales
H: Vibrionaceaae
Chi: Vibrio
Loài: Vibrio parahaemolyticus
nh lý nh chm ln, l đ, c th
chuyn sang màu đ và cht (Abhay và cs., 2003). V. parahaemolyticus cng đc
ghi nhn cùng vi V. harveyi và V. vulnificus đã gây cht tôm nuôi Thái Lan
(Nash và cs., 1992), Philiphine (Lavilla và cs., 1998), n (Jayasree và cs.,
2006), liên quan đn mt s bnh nh nhim khun cc b, nhim khun trên gan
ty trên tôm sú, hi chng đ thân và mm v trên tôm (Lightner, 1996).
Vit Nam, nhng dng nhim vi khun phát sáng thng thy
tri sn
xut hoc ng tôm ging. Khi vi khun phát sáng hin trong c th tôm vi s
lng ln có th làm tôm nhim bnh phát sáng, có th quan sát đc trong bóng
ti. Vibrio phát sáng có th phát thành dch và gây cht đn 100% u trùng tôm, tôm
ging và k c tôm trng thành. Chính vì vy mà bnh phát sáng tôm đc lit
kê vào danh sách các ch tiêu kim dch tôm ging. các tri sn xut tôm ging,
thuc kháng sinh hin v
n là cách ph bin s dng đ phòng tr bnh phát sáng.
1.4 GII THIU PROBIOTIC VÀ VIC NG DNG TRONG NUÔI
TRNG THY SN
1.4.1 nh ngha probiotic
Vi khun Vibrio là mt thm ha cho ngh nuôi tôm khi vic s dng kháng
sinh đ tr không còn tác dng nhiu mà ngc li còn có th làm cho vi khun
kháng thuc (Moriarty, 1999). Vì vy vic s dng ch phm sinh hc đang tr
thành xu hng cng nh gii pháp mi đ kim soát tính hình dch bnh nh hin
nay.
Probiotic có ngun gc t ting Hy Lp bao gm hai t
"pro" có ngha là
dành cho và "bios" có ngha là s sng (Sahu và cs., 2008). Thut ng probiotic vn