TRƯỜNG ĐẠI HỌC sư PHẠM HÀ NỘI 2 KHOA SINH - KTNN
LƯU THỊ NHƯ
PHÂN TÍCH MỐI QUAN HỆ DI TRUYỀN CỦA SÂM LÀO
(PANAX SP.) VÀ SÂM NGỌC LINH (PANAX VIETNAMENSIS HA
ET GRUSHV.) VỚI MỘT SỔ LOÀI KHÁC TRONG CHI
PANAX
KHÓA LUẬN TÓT NGHIỆP ĐẠI HỌC
• • • • Chuyên ngành:Thực vật học
Người hướng dẫn khoa học:
TS. NGUYỄN THỊ PHƯƠNG TRANG TS. HÀ
MINH TÂM
Hà Nội, 2013
LỜI CẢM ƠN
Trong quá trình làm khóa luận, tôi đã nhận được sự hướng dẫn và giúp đỡ của TS.
Nguyễn Thị Phương Trang và TS. Hà Minh Tâm. Nhân dịp này, tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu
sắc nhất tới các thầy cô.
Trường ĐHSP Hà Nội 2 Khóa luận tốt nghiệp
Lưu Thị Như K35C - Sinh
Tôi xin trân trọng cảm ơn tập thể cán bộ phòng Hệ thống học phân tử và Di truyền bảo
tồn - Viện Sinh thái và Tài nguyên sinh vật đã tạo mọi điều kiện thuận lợi và tận tình giúp đỡ tôi
trong suốt quá trình tìm hiểu và nghiên cứu tại viện.
Trong quá trình thực hiện đề tài, tôi còn nhận được sự giúp đỡ của nhiều tổ chức, cá
nhân trong và ngoài trường. Nhân dịp này, tôi xin ưân trọng cảm ơn: Ban chủ nhiêm khoa Sinh
- KTNN - Trường Đại học Sư phạm Hà Nội 2; đặc biệt là sự giúp đỡ, động viên của gia đình,
bạn bè trong suốt thời gian tôi học tập và nghiên cứu.
Một lần nữa, tôi xin trân trọng cảm ơn!
Hà Nội, ngày 10 tháng 05 năm 2013 Sinh viên
Lưu Thị Như
LỜI CAM ĐOAN
Để đảm bảo tính trung thực, khách quan của khóa luận, tôi xin cam
đoan:

PCR Polymerase Chain Reaction (phản ứng chuỗi trùng hợp)
rDNA ADN ribosome
RE Restriction Enzyme (enzyme giới hạn)
RFLP Restriction Fragment Length Polymorphism DNA
Trường ĐHSP Hà Nội 2 Khóa luận tốt nghiệp
Lưu Thị Như K35C - Sinh
Simple Sequence Repeat (ưình tự các đoạn lặp đơn giản)
DANH LUC BẢNG
trang
và Panax vỉetnamensỉs với một số loài khác trong chi Panax trên cơ sở phân tích
trình tự vùng ITS- rDNA bằng phương pháp Maximum Parsimony
Trường ĐHSP Hà Nội 2 Khóa luận tốt nghiệp
Lưu Thị Như K35C - Sinh
SSR
Bảng
1
MỞ ĐÀU
Lý do chọn đề tài:
Sâm ngọc linh {Panax vỉetnamensỉs Ha et Grushv. 1985) được tìm thấy ở
Việt Nam và hiện đang được coi là loài đặc hữu hẹp, chỉ phân bố ở miền trung
Việt Nam (vĩ độ 14°15) ở độ cao trên 1800m so với mặt biển [18]. Sâm ngọc linh
được xác định là một cây thuốc quý về giá trị sử dụng cũng như giá trị nguồn gen
[16].
Nhiều công trình nghiên cứu về Sâm ngọc linh đã được triển khai, đặc biệt
từ năm 1985, thông qua sự hợp tác quốc tế hiệu quả, chủ yếu với các nhà khoa
học Ba Lan và Nhật Bản đã cho thấy Sâm ngọc linh có 52 hợp chất Saponin, trong
đó có 24 saponin đã được xác định là có cấu trúc hoàn toàn mới, lần đầu tiên được
công bố. Khi so sánh với các nhóm sâm trồng có giá trị trên thế giới như Nhâm
sâm (Panax ginseng), Sâm mỹ (P. quỉnqueỷolỉus) và Tam thất (pnotogỉnseng) thì
thành phần saponin của Sâm ngọc linh rất giống với 3 loài trên nhưng hàm lượng

Ỷ nghĩa thực tiễn:
Đánh giá sự sai khác về mặt di truyền giữa cây sâm có nguồn gốc từ
Lào và Sâm ngọc linh của Việt Nam.
CHƯƠNG 1. TỔNG QUAN TÀI LIỆU
1.1Giới thiệu về chi Sâm {Panax)
Chi Nhâm sâm (Panax L.) là một chi nhỏ trong họ Ngũ gia bì (Araliaceae).
Toàn bộ chi Sâm {Panax L.) trên thế giới đã biết chắc chắn có 11 loài và 1 dưới
loài (thứ -var) [23]. Sự phân bố của chi Panax L. trên thế giới cho thấy chúng chỉ
xuất hiện ở bắc bán cầu, kéo dài từ vùng rừng núi giáp bờ biển phía Đông của Bắc
Mỹ bao gồm bắc Hoa Kỳ và Tây Nam Canada (có 2 loài P. quinquefolius và (P.
trỉỷolỉatus) . Vùng Đông Bắc Á (gồm viễn đông Nga, đông bắc Trung Quốc, bán
đảo Triều Tiên và Nhật Bản) có 2 loài p. ginseng và P. japonica. Trung tâm phân
bố của chi Panax L. có thể từ vùng Tây Nam của Trung Quốc lan tỏa xuống phía
Bắc của Việt Nam. Thực chất khu vực này gồm 2 tỉnh biên giới kề nhau là Vân
Trường ĐHSP Hà Nội 2 1 Khóa luận tốt nghiệp
Lưu Thị Như K35C - Sinh
Nam (Trung Quốc) và Lào Cai (Việt Nam). Ở đây đang có tới 7 loài và thứ (dưới
loài) mọc hoàn toàn tự nhiên. Hai loài trồng là p. notogỉnseng nhập tò Bắc Mỹ và
p. pseudogỉnseng (không tìm thấy trong hoang dại nhưng giả thiết có nguồn gốc từ
vùng cận Himalaya hoặc là kết quả của lai tự nhiên giữa 2 loài gần gũi nào đó).
Đây có thể coi là trung tâm phân bố của chi Sâm {Panax L.) của thế giới. Ở Bắc
Mỹ hiện có 3 loài (P. notoginseng; p. quỉnqueỷolỉus và p. trỉỷolỉatus). Giới hạn cuối
cùng về phía Nam của chi Panax L. là loài Sâm ngọc linh (Panax Vieừiamensis) ở
miền trung của Việt Nam, tại 14°15 vĩ độ Bắc. Chính vì vậy Sâm ngọc linh được
coi là loài đặc hữu hẹp của miền trung Việt Nam [6].
Các loài Nhâm sâm nói chung có tính hàn, ưa khí hậu ôn hoà, mát mẻ, sợ
rét, sợ ánh nắng mặt trời mạnh chiếu trực tiếp, không ưa mưa nhiều và nhiệt độ
cao, sợ gió nóng. Nhiệt độ thích hợp để sinh trưởng là 20 - 28°c. Candolle, 1830,
Seemann 1868 mô tả Panax có cụm hoa tán, hoa nhỏ có năm cánh, bộ nhụy có 2
hoặc 3 lá noãn, quả mọng khi chín màu đỏ hoặc cam, có 2

dùng lá và rễ con.
Sinh học:
Vào đầu tháng 1 hàng năm, Sâm xuất hiện chồi mới sau mùa ngủ đông,
thân khí sinh lớn dần lên thành cây sâm trưởng thành. Từ tháng 4 đến tháng 6, cây
nở hoa và kết quả. Tháng 7 bắt đầu có quả chín và kéo dài đến tháng 9. Cuối tháng
10, phần thân khí sinh tàn lụi dần, lá rụng để lại 1 vết sẹo ở đầu củ sâm và bắt đầu
giai đoạn ngủ đông đến tháng 12. Chính căn cứ vào vết sẹo trên đầu củ mỗi mùa
đông đến mà người ta có thể nhận biết cây sâm bao nhiêu tuổi, phải ít nhất 3 năm
tuổi tức trên củ có 1 sẹo (sau 3 năm đầu sâm chỉ rụng 1 lá) mới có thể khai thác,
khuyến cáo là trên 5 tuổi [18, 20]. Mùa đông cũng là mùa thu hoạch tốt nhất phần
thân rễ của sâm.
Trường ĐHSP Hà Nội 2 1 Khóa luận tốt nghiệp
Lưu Thị Như K35C - Sinh
Hình 2: Sâm ngọc linh (Chụp tại vườn Sâm Đăc-Tô, Nam Trà My,
tỉnh Quảng Nam)
1.2.2. Phân bổ tự nhiên của Sâm ngọc linh (Panax vietnamensis)
Cho đến nay, Sâm ngọc linh mới chỉ phát hiện thấy ở cao nguyên Trung
phần, trong đó điểm phân bố tập trung vốn có (và quan trọng nhất) là núi Ngọc
Linh. Cụ thể là ở các xã Tê Xăng, Măng Ri, huyện Tu Mơ Rông; xã Mường
Hoong, Ngọc Linh, huyện Đăk Glei (tỉnh Kon Tum) và xã Trà Cang, Trà Linh, Trà
Nam, huyện Nam Trà My (tỉnh Quảng Nam).
Theo Hà Thị Dụng, cây sâm do Phạm Hoàng Hộ phát hiện ở núi Lang
Biang (tỉnh Lâm Đồng) năm 1970 cũng là Sâm ngọc linh [13].
Như vậy, nếu tính về “tính nguyên thuỷ” của nó thì Sâm ngọc linh đã có mặt
ở 3 vùng núi khác nhau, tạm thời cho rằng thuộc 2 điểm phân bố (dãy Ngọc Linh
và Lang Biang). Cả 2 khối núi này đều có độ cao trên 1.500m. Điểm phát hiện có
Sâm ngọc linh mọc tự nhiên đều vào khoảng 1.800 - 2.200IĨ1 [6, 24].
1.2.3 Tầm quan trọng, giá trị và thành phần hoá học của cây Sâm ngọc lỉnh
a. Tầm quan trọng và giá trị
Tất cả những loài thuộc chi Panax đều có giá trị làm thuốc, một số loài của

b. Thành phần hóa học
Từ năm 1974 - 1990 Nguyễn Thới Nhâm và cộng sự đã nghiên cứu Nhâm
sâm việt nam, so sánh với Nhâm sâm Triều Tiên {Panax ginseng), Nhâm sâm nhật
bản (Panax japonicus) và Nhâm sâm hoa kỳ (Panax quinquefollium) [17]. Kết quả
có thể tóm tắt như sau:
Bằng phương pháp sắc ký lớp mỏng (SKIM) đã phát hiện trong Panax
vietnamensis 15 vết saponin có giá trị Rf (Rf: Hệ số di chuyển) và mầu sắc tương
ứng với 12 hợp chất saponin của Panax ginseng. Chi tiết hơn nữa trong Panax
vietnamensis có hàm lượng cao nhất saponin kiểu damarane (7.58%), trong đó
saponin thuộc diol và triol có tỷ lệ 32% và một lượng nhỏ saponin của axit
oleanolic. Điều này trái với quy luật chung là thông thường các cây nhâm sâm cho
thân rễ phát triển thì thường chứa lượng saponin của axit oleanolic và lượng nhóm
saponin damarane [17].
Trường ĐHSP Hà Nội 2 1 Khóa luận tốt nghiệp
Lưu Thị Như K35C - Sinh
Cũng là lần đầu tiên trên thế giới, người ta chiết được 1 lượng lớn
majonozit R2 và ocotillol saponin trong cùng một loại Panax (chỉ riêng hai chất
này đã chiếm 4.34%) gấp 43 lần hàm lượng majonozit và ocotillol saponin cao
nhất có trong các loài chi Panax. Ocotillol saponin đã trở thành 1 hợp chất cần chú
ý có thể đưa thành tiêu chuẩn để phân loại hóa học cho các cây Panax vì nó có thể
ảnh hưởng đến một số tác dụng mang tính đặc thù của Panax vietnamensis. Sự có
mặt của damarane saponin kiểu ocotillol cũng còn làm cho Sâm Việt Nam khác
với Nhâm sâm Triều Tiên vì cho tới nay người ta chưa tìm thấy ocotillol trong
Nhâm sâm ữiều tiên. Năm 1994, Nguyễn Minh Đức còn chứng minh Nhâm sâm
việt nam có hàm lượng saponin damarane cao nhất (12 - 15%) so với Nhâm sâm
khác chỉ chứa 10% và số lượng saponin nhiều nhất (49%) so với 26% trong nhâm
sâm triều tiên [10].
Ngoài những saponin nói trên, trong Nhâm sâm việt nam còn chứa các
polyacetylen, axit béo, axit amin, gluxit, tinh dầu và một số yếu tố vi lượng [15].
1.2.4 Hiện trạng của loàỉ Sâm ngọc linh ở Việt Nam

1.4.1 Thành tựu nghiên cứu về phân loại học phân tử
Ngoài nước: trong những năm gần đây, kỹ thuật sinh học phân tử đang
được áp dụng rộng rãi, có hiệu quả trong nghiên cứu tiến hóa, phân loại và đa
dạng di truyền quần thể sinh vật. Phương pháp chủ yếu dựa trên kỹ thuật phân tích
ADN. Các chỉ thị AFLP (đa hình độ dài các đoạn ADN khuếch đại), RFLP (đa
hình các đoạn cắt giới hạn), RAPD (đa hình các ADN Khuếch đại ngẫu nhiên),
SSR (trình tự các đoạn lặp đơn giản), cpSSR (trình tự lặp đơn giản), gen mã hóa
18S - RNA, hay được sử dụng để đánh giá đa dạng di truyền, nhận dạng các
đoạn ADN hoặc các trình tự đặc trưng cho loài [23, 19]. Với số lượng bản sao lớn
trong hệ gen là điều kiện thuận lợi cho kỹ thuật PCR với các cặp mồi thích hợp.
Vì thế chỉ trong vài thập kỷ, cơ sở dữ liệu gen (GenBank, 2007) đã lưu dữ
trên 70 triệu trình tự ADN với gần 90 tỷ nucleotit. Đây là nguồn dữ liệu có giá trị
trong sinh học bảo tồn (Conservation biology) vì bốn lý do chính là (1) số liệu về
trình tự các nucleotit rất có giá trị trong việc xác định các đơn vị bảo tồn giúp cho
đánh giá sắp xếp phân loại, nhất là bậc loài và dưới loài; (2) số liệu trình tự
Trường ĐHSP Hà Nội 2 1 Khóa luận tốt nghiệp
Lưu Thị Như K35C - Sinh
nucleotit đảm bảo độ chính xác cao nên tạo cơ sở khoa học tốt nhất cho bảo tồn đa
dạng di truyền, trong nghiên cứu di ữuyền quần thể (population genetics), vì nó
bộc lộ rõ các biến đổi di ưuyền ở trong và giữa các quần thể, giữa các cá thể, giữa
cha mẹ và con cái ; (3) kết quả ADN cho phép xác định chính xác loài, quần thể
cho đến tận cá thể từ các mẫu vật không còn nguyên vẹn mà vẫn xác định thấy
hiện tượng tạp lai giữa các loài, các quần thể địa lý, ; (4) kết quả nghiên cứu
ADN không bị ảnh hưởng vào bất cứ yếu tố khách quan do môi trường hay con
người gây ra.
Vì các giá trị khoa học nêu trên, đến nay kỹ thuật sinh học phân tử đang là
công cụ hỗ ượ đắc lực cho các nhà nghiên cứu trong việc phát hiện các loài mới,
giải quyết mối nghi ngờ về vị ữí phân loại, đánh giá đầy đủ về tình trạng di ữuyền,
quan hệ chủng loại và mức độ tiến hóa của nhiều loài động thực vật và vi sinh
vật . Các kết quả nghiên cứu ở mức độ ADN đã và đang góp phần đánh giá tính đa

phần vào việc phân loại mẫu thực vật đang còn ít.
1.4.2. Các bước trong phương pháp phân loại hiện đại
1.4.2.1. Kỹ thuật PCR
Kỹ thuật PCR (Polymerase Chain Retion) được Karry Mullis và cộng sự
mô tả lần đầu tiên năm 1985 đã góp phần tạo nên một cuộc cách mạng trong sinh
học phân tử. Đây là phương pháp invitro để nhân bản nhanh một đoạn ADN nào
đó mà chỉ cần lượng mẫu ban đầu rất hạn chế (cỡ 10"
3
[ig). Kỹ thuật này có độ
nhạy rất cao và được ứng dụng trong nhiều lĩnh vực như sinh học phân tó, chuẩn
đoán bệnh, trong di truyền quần thể và phân tích pháp lý [29],
Trong nghiên cứu khoa học, kỹ thuật PCR rất hữu hiệu cho việc nhân bản
số lượng lớn các đoạn ADN, có thể sử dụng PCR để tách dòng đặc hiệu, giúp phát
hiện đột biến, cho phép phân tích gen từ các tế bào riêng lẻ, giúp nghiên cứu quá
trình tiến hóa ở mức độ phân tử. Thậm chí giúp phục hồi những gen đã tồn tại
cách đây hành chục triệu năm [30].
1.4.2.2. Đọc trình tự nucleotide
Trường ĐHSP Hà Nội 2 1 Khóa luận tốt nghiệp
Lưu Thị Như K35C - Sinh
Phương pháp giải trình tự hiện nay được dùng phổ biến là phương pháp
Dideoxy hay còn gọi là phương pháp gián đoạn chuỗi (chain - determination
method) là một phương pháp xác định trình tự ADN được Fredermination Sanger
phát ữiển vào năm 1975 [39].
Nguyên tắc cơ bản của phương pháp Dideoxy dựa vào hoạt động của
enzyme ADN - polymerase trong quá trình tổng hợp ADN. Enzim ADN -
polymerase xúc tác quá trình gắn các nucleotit vào mạch đơn ADN đang tổng hợp
ở vị trí 3’có chứa nhóm-OH tự do, khi gặp nucleotit không có nhóm -OH ở vị trí
3’thì phản ứng tổng hợp bị dừng lại. Đặc trưng của phương pháp là sử dụng các
loại dideoxynucleotit để làm ngừng phản ứng tổng hợp ADN một các ngẫu nhiên.
Trong phản ứng sử dụng mồi tổng hợp là đoạn ADN mạch đơn có kích thước

- Mầu Sâm ngọc linh thu tại vườn trồng sâm Đak-Tô, huyện Nam Trà My, Tỉnh
Quảng Nam
Hình 3. Lá và củ Sâm lào (Mấu do Viện dược liệu TW cung cấp)
2.2Nơi thực hiện nghiền cứu
Nghiên cứu được thực hiện tại phòng Hệ thống học phân tử và Di truyền bảo tồn,
viện Sinh thái và Tài nguyên Sinh vật, viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam
2.3Thời gian nghiên cứu
Từ tháng 6/2011-5/2013
2.4Phương pháp nghiên cứu
2.4.1 Tách ADN tổng số
Mầu lá (củ) củ tươi được nghiền trong nitơ lỏng (-196°C) thành dạng bột mịn.
Khoảng lOOmg bột nghiền được dùng để tách ADN, sử dụng Dneasy plant mini kit
(Qiagen, Đức).
Phương pháp chiết tách ADN gồm ba bước chính:
Bước 1: Phá màng tế bào và màng nhân bằng các tác nhân vật lý hay hoá học hoặc kết
hợp nhiều tác nhân, giải phóng ADN ra môi trường.
Bước 2: Loại bỏ thành phần không mong muốn trong mẫu (protein, lipid,
polysaccharide ). Thường dùng hỗn hợp phenol - chloroform - isoamyl alcohol
(25:24:1) làm biến tính protein, sau đó ly tâm: protein biến tính sẽ tủa thành một lớp
nằm giữa pha nước chứa axit nucleic và pha phenol - chloroform, thu nhận lại pha nước
chứa axit nucleic.
Bước 3: Kết tủa axit nucleic. Thường dùng cồn ethanol thể tích 2.5:1 và trong môi
trường có lực ion cao (nồng độ muối cao) hoặc dùng isopropanol thể tích 1:1. Thu ADN
bằng li tâm, sau đó hoà trong nước khử ion hoặc dung dịch đệm.
2.4.2 Phát hiện ADN bằng phương pháp điện di trên gel agarose
Phương pháp này được áp dụng cả trong phân tích định tính lẫn trong việc thu
nhận mẫu axit nucleic.
Nguyên tắc phương pháp dựa vào đặc tính cấu trúc của các axit nucleic.
Đó là các đại phân tử tích điện âm đồng đều trên khắp bề mặt nên khi chịu tác động của
một điện trường, chúng sẽ di chuyển về hướng cực dương. Sự di chuyển nhanh hay

trên hệ thống ABI 3100 Avant Genetic Analyzer (Applied Biosystems.Mỹ).
2.4.5. Phân tích số liệu
Trình tự ADN của 2 loài Sâm lào và Sâm ngọc linh được so sánh, phân tích với
7 loài khác thuộc chi Panax và 1 loài ngoài nhóm (Aralia foliolosa) được dùng làm tham
chiếu (Bảng 3) sử dụng phần mềm Clustal w và MEGA
CHƯƠNG 3. KẾT QUẢ NGHIÊN cứu
Chúng tôi đã tiến hành giải mã 1 đoạn gen ITS của Sâm lào và Sâm ngọc linh, so
sánh một số loài khác trong chi Panax để làm rõ vị trí phân loại của Sâm lào nói riêng
cũng như mối quan hệ di truyền Sâm lào với Sâm ngọc linh.
3.1 Kết quả tách ADN tổng số
Mầu lá và củ của Sâm lào và Sâm ngọc linh được nghiền trong nitơ lỏng (-
196°C) thành dạng bột mịn. Khoảng lOOmg bột nghiền được dùng để tách ADN tổng
Bảng 1. Danh sách các trình tự sử dụng trong nghiên cứu
Tên khoa học Mã hiệu Genbank
1 Panax quinquefolius AY233328
2 Panax japonicus FJ980423
3 Panax japonicus var bipinnatifidus AY271921
4 Panax notoginseng JX680329
5 Panax pseudoginseng var bipinnatifidus AY271923
6 Panax stipuleanatus U41690
7 Panax variabilis AY233329
8 Aralia foliolosa DQ007383
số, sử dụng Dneasy plant mini kit (Qiagen, Đức). Kết quả sau đó được điện di kiểm tra
trên gel Agarose 1% (Hình 5)
Hình 5 Điện di tổng số ADN trên gel Agarose 1%
Giếng 1 ADN tổng số từ Lá Sâm ngọc linh
Giếng 2 ADN tổng số từ Củ Sâm ngọc linh
Giếng 3 ADN tổng số từ Lá Sâm lào
Giếng 4 ADN tổng số từ củ Sâm lào
Ảnh điện di cho thấy đều có ADN xuất hiện ở tất cả các mẫu, tuy nhiên ở các

v
miflimi/'Jwiiíuiraif.BuvuỈI1IUIÌ
GG vOCGTCTTTCT. • ••C"C" 'COACTCTCGGC-V '.CGG T \7CTCGGCTCTCGC 703-vra- •' '.C'j
-
/' CCG '■ • GCG T CTTGOTGTG- TTGCAG TCCCOTG '.CC™TCG -'GTCTTT
\Ếầùĩ±Jk MArwAv ’M- a/u
G A.ACGC AGTTGCGCCCG. A.occ TTAGGCCG GGGC COTC
TQCCTGGCCGTCACGCATCOCGT0GCC0CCC/ CTC TC CTCCCTC
CGGGAGTCG ■ GGCGGAGGGGCGGAT TGGC
V , AAA- . '-aAiWAaAAAa-' • A/I a .A a • „ Aa/W V\ A/Vv
AÌ^AAAAA/V'AAAA<W> '-V\A ' /-'.A^AA.'’.A^^'WV\A ■
/WV'.A/V'/WW\A/Y .AAAA- AIVU WW.A AMAAAA ~,V WVAAAAA.
500 . 510 520 . 530 540. 950. .550 515 580 . 590 _ 600 610
620
GTGTCTCACCQCGOGGTTGQCCC/. • TOCQ 'OTCCTTOOCG•\?
G<3.''CGTC."CGÃC-•
GTGOTOOTTGT,AQCCCTCTTCTCATQTCOTOCOOTOACCCOTCOCCAQCA
••ÁGCTCTCATOẤ
File:SL-ITS-lTS.abl Run Ended: 2011/8/11 22:50:24 Signal G:1835A:1141 C:1471 T:805 Sample: SL-1TSJTS Lane: 85 Base spacing: 14.823459 713 bases
m 16303 scans Page 2 of 2
630 . . 640 , 650 6B0 670 680 690 700 71Ũ
CCTGTTGCGCCGTCCTCG"TGCGCGCTCOG
ACCGCGACCCCAGGTCAGGCGGG ACT " ccCGCTGAGTTTAAGO" A A TCV. :'.T
AGAOS/V»
Hình 7. Hình ảnh các đỉnh (peak) của sản phẩm PCR trẽn máy đọc trình
tựABI 3100
IVIACR
ÒỊGEN
Kết quả giải trình tự cho hình ảnh rõ ràng, không bị nhiễu nền, chứng tỏ sản
phẩm PCR đẫ được tinh sạch tốt. Trình tự sau đó đã được kiểm tra bằng chương trình

p. sp . GGAAATCAAACTGAACTGCGCGCGTCCCCCCCGTTTGCGGGCGGCGGAAGCGTCTTTCTAAAACACAAACGACTCTCG
p.j aponicus
p.vietnamensis Ầ
P.japonicus A A
P.pseudoginseng Ầ T
p.variabilis TA
p.quinqueíolius A