transcription polymerase chain reaction
Abstract. T
-P
-
-
Keywords. ; ;
Content
I. Đặt vấn đề
Orthomyxoviridae.
,
vir
/H5N1 .
1. a chn p thc hin phn ng multiplex RT-
2. n cu ti n ca phn ng multiplex RT-PCR: nhit
i gian gn mi, nng
3. Th nghin ng multiplex RT-t s
mu bnh phm thu thm.
II. Vật liệu và phương pháp nghiên cứu
Mâ
̃
u bệnh phẩm:
g); 30
Tách chiết RNA: thu RNA
Thiết kế mô
̀
i : 5, N1
, 2.0.11. Sau khi
5.4 /H5N1
1000 (Biorad).
(10 )
2%,
ethidium bromide 0,5 /ml 15 ,
A/H1N1, /H3, (
), /H5
(
)
/H5N1 1.2/blunt (Fermentas) ,
Kit (Fermentas).
. Sau
,
10
.
III. Kết qu
Thiê
́
t kê
́
mô
̀
i:
5, N1
, 3
DiagMR
GTGACAGGATTGGTCTTGTCTT
158-139
55.8
DiagH5F
AGTGATCAGATTTGCATTGGTTAC
46-69
54.6
371 bp
DiagH5R
GACCAAGAACTTTTGGGGATG
416-396
55.4
DiagN1F
CCAGTTGGTTGACAATTGGAAT
503-524
54.5
292 bp
DiagN1R
GCATCAGGATAACAGGAGCA
794-775
55.4
Tối ưu phn ứng mutiplex RT-PCR: -
) .
,
mutiplex RT-
3
95
o
C trong 15 ;
45
(94
o
C: 30 ; 57
o
C: 30 ; 72
o
C:
30 );
(ngươ
̀
i, Escherichia coli, Mycobacteria tuberculosis,
Chlamydia trachomatis, Neisseria gorrnorhea, Hepatitis B virus, Hepatitis C virus,
Human immunodeficiency virus, Human Papillomavirus), utiplex RT-PCR
.
Ảnh điện di đa
́
nh gia
́
n ư
́
ng mutiplex RT-PCR:
,
10
1
10
10
/
10
2%.
di cho
nha
̣
y cu
̉
a pha
̉
n ư
́
ng multiplex RT-PCR
M: thang DNA 100 bp; NC: Chư
́
ng âm; S lưng bản sao RNA trong mu th đưc ghi
ch pha trên.
ng dng k thuật mutiplex RT-PCR pha
́
t hiê
̣
n cu
́
m A /H5N1 trên mâ
̃
u bê
̣
nh
phâ
̉
m:
Kmutiplex RT-PCR
).
utiplex RT-
14
.
Kết qua
m pha
̉
n ư
́
ng multiplex RT-PCR phát hiện virus cm gia cầm A/H5N1
trên một s mu bê
̣
nh phâ
̉
m
M: Thang DNA chuẩn 100 bp; NC: Chứng âm; PC: Chứng dương;
1-10: Mu bệnh phẩm.
Kết luận
-
mutiplex RT-PCR.
-
-
/H5N1 .
- ex RT-PCR
References :
Tiếng Việt
Báo cáo tình hình cm gia cầm tại Việt Nam,
Tạp ch Công nghệ Sinh học 2(1): 1-18.
Tạp ch Khoa học Kỹ thuật Th y, 11(1): 81-86.
Tạp ch Khoa học Kỹ thuật Th y,
11(2): 53-58.
Tiếng Anh
5. Abdel-Ghafar AN, Chotpitayasunondh T, Gao Z, Hayden FG, Nguyen DH, et al,
N. Engl.
J. Med, 358, pp. 261-73.
6. Apisarnthanarak A, Kitphati R, Thongphubeth K, Patoomanunt P, et al, 2004,
Emerg Infect Dis, 10, pp. 1321- 4.
-length
influenza A (H5N1) in a child presenting with diarrhea foll N
Engl J Med, 352, pp. 686-91.
19. De Jong MD, Simmons CP, Thanh TT, Hien VM, Smith GJ, Chau TN, Hoang DM,
Chau NV, Khanh TH, Dong VC, Qui PT, Cam BV, Ha DQ, Guan Y, Peiris JS,
uenza A
Nat Med, 12,
pp. 1203- 07.
20. De Jong MD, Tran TT, Truong HK, Vo MH, Smith GJ, Nguyen VC, Bach VC, Phan
e
N Engl J Med, 353, pp. 2667-
72
Proc Natl
Acad Sci U S A, 90(9): 4171-4175.
22. Duan L, Bahl J, Smith G, et al. (2008), The development and genetic diversity of
H5N1 influenza virus in China, 1996-Virology, 380, pp. 243-54.
Evolution of the receptor
Virology; 344:432-438.
24. Greninger A (2004), The Definition and Measurement of Dangerous Research.
25. Guan Y, et al (2004), H5N1 influenza: A protean pandemic threat, PNAS, 101(21),
pp. 8156-61
Proc. Natl Acad. Sci. USA, 99, pp. 89505.
27. Hamada S., Suzuki Y., Suzuki T., et al (2006), Haemagglutinin mutations
responsible for the binding of H5N1 influenza A virus to human-
Nature, 444(7117), pp.378-82.
Influenza, Report 2006.
29. Hatta M., et al (2007), Growth of H5N1 Influenza A Viruses in the Upper
Respiratory Tracts of Mice, PLoS. Pathog.
30. Hoa, L.T., D.D. Khang, P.V. Chi, N.V. Hai, T.N. Hai, N.T.B. Nga, and L.T. Binh
40. Luong, G. and P. Pales , Curr
Opinion Gen Develop, 2: p. 77-81.
Emerg. Infect. Dis., 11, pp. 1303-5
42. Rowe T, Abernathy RA, Hu-Primmer J, et al (1999), Detection of Antibody to
Avian Influenza A (H5N1) Virus in Human Serum by Using a Combination of
Serologic Assays, J Clin Microbiol, 37(4), pp. 937- 43.
43. Sastre A (2006), Antiviral Response in Pandemic Influenza Viruse, CDC, vol 12
number 1
44. Senne, DA, Panigrahy, B, Kawaoka, Y, Pearson, JE, Suss, J, Lipkind, M, Kida, H
and Webster, RG (1996) Survey of the hemagglutinin (HA) cleavage site
sequence of H5 and H7 avian influenza viruses: amino acid sequence at the HA
cleavage site as a marker oAvian Diseases, 40: 425-
437.
45. Swayne DE and Halverson DA (2007), Diseases of Poultry: Influenza, 12th edn.
Ames, IA: Blackwell Publishing Professional.
46. Takano R, Nidom CA, Kiso M, Muramoto Y, Yamada S, Sakai-Tagawa Y, Macken
viruses isolated in Indonesia from 2003-Virology, 390, pp. 13-21.
influenza A (H5N1) in 10 patN Engl J Med, 350, pp. 1179-88.
48. Uiprasertkul, M., R. Kitphati, P. Puthavathana, R. Kriwong, A. Kongchanagul, K.
Ungchusak, S. Angkasekwinai, K. Chokephaibulkit, K. Srisook, N. Vanprapar,
Apoptosis and pathogenesis of avian influenza A
Emerg Infect Dis, 13(5): p. 708-712.
49. WHO inter-country-consultation, influenza A/H5N1 in humans in Asia: Manila,
Philippines, 6-7 May 2005.
50. World Health Organization (2009), Continuing progress towards a unified
nomenclature system for the highly pathogenic H5N1 avian influenza viruses.