B GIÁO DÀO TO
I HC M Tp. HCM
KHÓA CÔNG NGH SINH HC
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
TÀI:
KH KHÁNG
KHÁNG SINH CA VI KHUN
ESCHERICHIA COLI PHÂN LP TI
BNH VING 1 T 10/2013
N 03/2014.
NGÀNH VI SINH - SINH HC PHÂN T
GVHD: ThS. Bs LÊ QUC THNH
SVTT: PHAN TH KIM HNG
MSSV: 1053010260
NIÊN KHÓA: 2010 2014
Tp.H Chí Minh, tháng 5, 2014.
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHH: Ths.Bs Lê Quc Thnh
SVTT: Phan Th Kim Hng
MSSV:1053010260
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHH: Ths.Bs Lê Quc Thnh
SVTT: Phan Th Kim Hng
MSSV:1053010260
LI CM
u tiên, em xin gi li cm n chơn thƠnh đn ThS.Bs Lê
Quc Thnh. Thy đư đnh hng và tn tình hng dn cho em
nhng kin thc chuyên môn đ em hoàn thành tt báo cáo khóa
lun tt nghip này.
Em xin gi li cm n đn các cô, chú, anh, ch trong khoa
Vi sinh - Bnh vin Nhi ng 1 đư trc tip truyn đt các kin
thc, hng dn các k thut chuyên môn vƠ luôn giúp đ em
trong sut thi gian thc hin khóa lun tt nghip.
Em xin chân thành bit n đn s tn tình dy d, truyn
đt và chia s nhng kin thc b ích ca tt c các quý thy cô,
cùng các anh, ch khóa trên và các bn trong khoa Công ngh
sinh hc trng i hc M Tp.HCM.
Li cm n chơn thƠnh vƠ sơu sc nht, em xin gi đn gia
đình, cha, m đư sinh thành và nuôi dy em, luôn sát cánh đng
viên và to mi điu kin tt nht đ em hc tp và hoàn thành tt
khóa lun tt nghip ca mình.
TP H Chí Minh, ngày 10 tháng 05 nm 2014.
Sinh viên
Phan Th Kim Hng
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHH: Ths.Bs Lê Quc Thnh
SVTT: Phan Th Kim Hng
MSSV:1053010260
IMP: Imipenem
MP: Meropenem
TCC: Ticarcillin/Clavulanic acid
POL (PB): Polimyxin B
FEP: Cefepime
ATM: Aztreonam
CPD: Cefpodoxime
CTX: Cefotaxime
CAZ: Ceftazidime
CCTX: Cefotaxime/Clavulanic acid
CCAZ: Ceftazidime /Clavulanic acid
NOR: Norfloxacin
NAL: Nalidixic acid
NIT: Nitrofurantoin
Khoa:
1AB: Khoa ngoi tng hp
1CD: Khoa ni tng quát 1
1I: Khoa nhim
2AB: Khoa phng, chnh hình
2CD: Khoa ni tng quát 2
2I: Khoa Thn
3B: Khoa tim mch
3CD: Khoa hô hp
3I: Khoa st xut huyt + huyt hc
CC: Khoa cp cu
HSN: Khoa hi sc ngoi
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHH: Ths.Bs Lê Quc Thnh
SVTT: Phan Th Kim Hng
MSSV:1053010260
ICU: Khoa hi sc tng cng
Bng 2.3 Bng trc nghim sinh hóa đnh danh trc khun Gram âm 40
Bng 2.4 Tiêu chun đng kính vòng vô khun ca vi khun đng rut 46
Bng 3 T l vi khun phân lp đc 49
Bng 3.1 T l vi khun E.coli phân lp đc theo bnh phm (N=242) 50
Bng 3.2 T l vi khun E.coli phân lp đc theo khoa điu tr (N=242) 51
Bng 3.3 T l vi khun E.coli phân lp đc theo tui (N=242) 52
Bng 3.4 T l vi khun E.coli phân lp đc theo gii tính (N=242) 54
Bng 3.5 T l kháng kháng sinh ca vi khun E.coli 55
Bng 3.6 T l vi khun E.coli sinh men betalactamase trong th nghim sàn lc
(N=242) 57
Bng 3.7 T l vi khun E.coli sinh men betalactamase trong th nghim khng đnh
(N=242) 57
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHH: Ths.Bs Lê Quc Thnh
SVTT: Phan Th Kim Hng
MSSV:1053010260
DANH MC CÁC HÌNH
Hình 1 Cu to vi khun E.coli 5
Hình 1.1 a)Vi khun Escherichia coli di kính hin vi đin t 5
b) Khun lc vi khun E.coli phân lp đc di kính hin vi 5
Hình 2 Môi trng CA 23
Hình 2.1 Khun lc vi khun Escherichia coli trên CA 23
Hình 2.2 Môi trng MC 24
Hình 2.3 Lactose (+/-) trên môi trng MC 24
Hình 2.4 Khun lc vi khun Escherichia coli trên môi trng MC 24
Hình 2.5 Môi trng MHA 25
Hình 2.6 Th kháng sinh đ trên môi trng MHA 25
Hình 2.7 Môi trng SS 26
Hình 2.8 Escherichia coli trên môi trng SS 26
Hình 3.4 Máy ly tâm XIII
Hình 3.5 Máy Vorter XIV
Hình 3.6 T m 37
0
C XIV
Hình 3.7 T cy máu Bactec XV
Hình 3.8 Các dng l dng mu XVI
Hình 3.9 T lnh XVI
Hình 3.10 Kt qu th nghim kháng sinh đ ca E.coli XVII
Hình 3.11 Khun lc E.coli trên các loi môi trng khác nhau XVIII
Hình 3.12 Kt qu test sinh hóa ca E.coli XIX
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHH: Ths.Bs Lê Quc Thnh
SVTT: Phan Th Kim Hng
MSSV:1053010260
DANH MC CÁC BI
Bi 3 T l vi khun phân lp đc 49
Bi 3.1 T l vi khun E.coli phân lp đc theo loi bnh phm (N=242) 50
Bi 3.2 T l vi khun E.coli phân lp đc theo khoa điu tr (N=242) 52
Bi 3.3 T l vi khun E.coli phân lp đc theo tui (N=242) 53
Bi 3.4 T l vi khun E.coli phân lp đc theo gii tính (N=242) 54
Bi 3.5 T l kháng kháng sinh ca vi khun E.coli phân lp đc trong thi gian
kho sát 56
Bi 3.6 T l vi khun E.coli sinh men betalactamase trong th nghim sàn lc
(N=242) 57
Bi 3.7 T l vi khun E.coli sinh men betalactamase trong th nghim khng
2.1.3 a kháng sinh 32
2.1.4 Thit b và dng c 34
2.2 Phng pháp nghiên cu
[23]
35
2.2.1 Kho sát đc đim mu 35
2.2.2 Các phng pháp cy:
[16,23]
35
2.2.3 Quy trình đnh danh: 38
3 KT QU NGHIÊN CU VÀ BIN LUN 49
3.1 Kt qu t l nhim khun 49
3.1.1 Theo mu bnh phm 50
3.1.2 Theo khoa điu tr 51
3.1.3 Theo đ tui 52
3.1.4 Theo gii tính 54
3.2 Kt qu đ kháng kháng sinh 54
3.3 T l vi khun Escherichia coli tit men betalactamase ph rng 57
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHH: Ths.Bs Lê Quc Thnh
SVTT: Phan Th Kim Hng
MSSV:1053010260
3.3.1 Trong th nghim sƠng lc 57
3.3.2 Trong th nghim khng đnh 57
3.4 BÀN LUN 59
3.4.1 c đim mu 59
3.4.2 Kháng sinh đ 59
3.4.3 Kt qu tit men betalactamase 60
4 KT LUN VÀ NGH 62
4.1 KT LUN 62
4.2 NGH 62
S dng kháng sinh đư điu tr thành công bnh nhim khun do vi khun Escherichia
coli gây ra, đng thi cng to nên mt áp lc đ tn ti đi vi vi khun, đa đn các
chng vi khun kháng vƠ đa kháng thuc. Bên cnh đó vic s dng kháng sinh không
hp lý làm cho vi khun kháng nhiu loi kháng sinh nh: Ampicillin, các kháng sinh
nhóm Cephalosporin, Fluoroquinolone và Carbapenem. Hn na vi khun E.coli li có
kh nng tit men betalactamase ph rng (ESBLs) kháng đc hu ht kháng sinh
Cephalosporin nên gây rt nhiu khó khn cho vic điu tr. ơy chính lƠ mi lo ngi
ln cho ngành y t trên toàn th gii.
Tình hình đ kháng kháng sinh ca vi khun là mt trong nhng vn đ nan gii
không ch riêng ca ngành y t mƠ còn lƠ chuyên đ quan tâm ca các nhà di truyn
hc và mt s ngành liên quan. Nhng nghiên cu cho thy rng NKBV lƠm tng t l
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHH: Ths.Bs Lê Quc Thnh
SVTT: Phan Th Kim Hng Trang 2
MSSV:1053010260
t vong, kéo dài thi gian nm vin, tng vic s dng kháng sinh, tng đ kháng
kháng sinh vƠ tng c chi phí điu tr ca bnh nhân nm vin. Vi khun E.coli kháng
thuc đang lƠ vn đ y t toàn cu.
Vit Nam, B Y t rt quan tơm đn mc đ, din tin kháng thuc ca vi
khun vƠ đang tin hƠnh các chng trình trng đim quc gia đ giám sát, kim soát
tính đ kháng ca vi khun, trong đó có nhiu nghiên cu v vi khun Escherichia
coli. ng trc tình hình đ kháng kháng sinh ngày càng phc tp và nhm góp phn
tìm hiu thêm v vn đ trên chúng tôi thc hin đ tài
kháng kháng sinh ca vi khun Escherichia coli phân lp ti bnh ving
1 t 10n 03
tài ng dng các phng pháp phơn lp, nuôi cy, đnh danh vi khun, th
nghim kháng sinh đ và tìm men ESBLs t vi khun gây bnh Escherichia coli phân
lp đc t các mu bnh phm. Kt qu nghiên cu nhm cung cp thêm thông tin
cn thit cho các nhà lâm sàng trong vic đnh hng s dng kháng sinh đ điu tr
đi vi các trng hp nhim trùng do vi khun Escherichia coli gây ra. Nhng
B (ordo): Eubacteriales
H (familia): Enterobacteriaceae
Chi (genus): Escherichia
Loài (species):
Escherichia coli (loài ch yu)
Escherichia blattae
Escherichia fergusonii
Escherichia hermannii
Escherichia vulneris
1.1.2
Vi khun Escherichia coli (E.coli) do bác s nhi khoa tên là Theodor Escherich
ngi đu tiên phân lp đc vi khun nƠy vƠo nm 1884, ti München (c)
(Schaechter, 2009).
[30]
Vi tên gi ban đu là Bacterium coli commune. Bn nm sau
đó đi tên thành Escherich nhm tri ơn ngi có công khám phá vƠ đn nm 1991 vi
khun mi đc đnh danh thng nht toàn cu là Escherichia coli.
E.coli cng lƠ mt trong nhng thành viên chính ca h vi khun bình thng
rut nhng nó cng lƠ cn nguyên ca nhiu nhim trùng, trong đó có nhng nhim
trùng nó lƠ cn nguyên hƠng đu.
Vi khun Escherichia coli sng khp ni trong môi trng, trên c th đng
vt vƠ con ngi. ngi vi khun E.coli sng trên các b phn nh rut, đng hô
hp, đôi khi trong niêm mc các b phn khác trong c th. rut chúng giúp tng
hp các loi vitamin K và B. Hin nay đư có hƠng trm chng vi khun E.coli. Phân
loi vƠ đánh s chúng da trên kháng nguyên K và kháng nguyên O. Mt s chng vi
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHH: Ths.Bs Lê Quc Thnh
SVTT: Phan Th Kim Hng Trang 5
MSSV:1053010260
khun có gen, hoc thông qua các đt bin hoc t các sinh vt khác cho phép sn xut
cht đc có hi cho con ngi.
7,4 (Nguyn Nh Thanh vƠ cng s, 1997).
[22]
Trong điu kin thích hp E.coli phát
trin rt nhanh, thi gian th h ch 20 đn 30 phút.
[6]
Môi trng thch thng: sau 24 gi nuôi cy 37
0
C, vi khun hình thành
nhng khun lc tròn, t, bóng láng, không trong sut màu tro nht, hi li,
đng kính 2 ậ 3 mm. Nuôi lâu khun lc chuyn màu gn nh nơu nht và
mc rng ra. Có th quan sát c nhng khun lc dng M và R.
Môi trng thch tht Pepton: sau 18 ậ 24 gi bi dng trong t m 37
0
C,
chúng mc thành nhng khun lc m t, ánh mƠu xám kích thc trung bình,
dng tròn, mt khun lc hi li lên, có np nhn vƠ b mt láng.
Môi trng nc tht: vi khun phát trin tt, môi trng rt đc, có cn màu
tro nht lng xung đáy, đôi khi có mƠng mng trên mt môi trng, môi
trng có mùi phân thi.
Môi trng thch máu BA: Sau 24 gi 37
0
C hình thành khun lc màu sáng,
kích thc 1 ậ 2 mm tu thuc vào chng và serotype, có chng dung huyt
hoc .
Môi trng Indol: vi khun hình thành khun lc màu mn chín, có ánh kim
hoc không có ánh kim.
Môi trng EMB có khun lc tím ánh kim.
Môi trng thch SS: E.coli có khun lc mƠu đ.
Môi trng MacConkey (MC) to khóm đ hng.
4.5) môi trng có mƠu đ.
Voges- proskauer (VP): âm tính (vi sinh vt chuyn hóa glucose thành acid
pyruvic acetyl methyl carbinol (AMC), AMC tác dng vi ậ naphtol trong
môi trng kim to thành diacety. Diacety phn ng vi nhân guanidine có
trong pepton đ to hp cht mƠu đ).
[12]
Citrat: âm tính (vi khun E.coli không có enzyme citrat permease nên không có
kh nng s dng citrat cng nh mui amonium vô c NH
4
H
2
PO
4
làm ngun
nito to ra NH
3
làm kim hóa môi trng không lƠm thay đi pH môi trng
môi trng vn gi màu xanh lá ca môi trng ban đu).
[12]
1.1.4.4 KE.coli.
[11]
Kháng nguyên O: gm gn 160 yu t.
Kháng nguyên K đc chia làm các loi: A, B và L.
Kháng nguyên H gm gn 50 yu t.
Escherichia coli đc chia thành nhiu serotype da trên s t hp ca các
kháng nguyên.
Serotype đc ký hiu bng kháng nguyên O và H, ví d O157:H7
huyt áp và có th t vong.
[19]
Khi bnh nhân b nhim E.coli nng (có th làm ri lon máu và suy thn)
Da tr nên xanh xao, cm lnh
Cm thy yu c
Có nhng vt thơm tím trên ngi
i tiu rt ít nc tiu
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHH: Ths.Bs Lê Quc Thnh
SVTT: Phan Th Kim Hng Trang 9
MSSV:1053010260
E.coli là vi khun gây bnh tiêu chy ph bin nht, đc bit là tr em. ng
lây nhim ch yu lƠ qua đng tiêu hoá do s dng ngun nc vƠ n phi thc n b
ô nhim có cha lng ln vi khun E.coli.
iu tr
[15]
iu tr bng kháng sinh da trên bnh lý nhim trùng và kt qu kháng sinh đ.
Phòng nga
[15]
Nc và thc phm b nhim E.coli chng có biu hin gì đc bit nên rt khó
phân bit. Vì th, cn có nhng bin pháp (hay thói quen) phòng nga nhim khun:
Phòng bnh tôn trng quy ch v sinh, chú ý x lý phân, dng c bnh nhân.
Ngun thc phm (sa cha tit trùng, tht cá cha nu chín) có th là ngun
gây bnh.
Ngn nga tình trng nhim trùng bnh vin.
1.1.6 Escherichia coli
T l E.coli kháng thuc cng rt cao khong 20 - 25%. Trên th gii đư tng có
nhng v dch tiêu chy do E.coli kháng thuc vi t l t vong cao ti Thy in,
hot tính nh nhau đi vi tt c các loi vi khun. Kháng sinh có hot ph rng, ngha
là chúng có hot tính đi vi nhiu loi vi khun gây bnh khác nhau, còn mt s có
hot ph hp thì có hot tính đi vi mt hay mt s ít loi vi khun.
So vi thuc sát khun, thuc kháng sinh ít đc vi c th hn vì kháng sinh có
kh nng c ch chn lc đi vi mt s khơu trong quá trình phát trin ca vi khun
gơy bnh. Tuy nhiên, kháng sinh không phi lƠ cht vô hi đi vi c th, mt s
kháng sinh có th gơy đc vi gan, thn, h thng to máu hoc gơy ri lon tiêu
hóa,ầ
1.2.1.2
Kháng sinh (antibiotic) có ngun gc t thut ng antibiosis đc s dng đu
tiên bi Vuillemin (1889) dùng đ ch s tiêu dit mt vt th sng bi mt vt th
sng khác.
Tuy nhiên cho đn nm 1928, Alexander Fleming đư tìm thy Penicillin bt đu
k nguyên kháng sinh ngun gc vi sinh th. Nm 1935, Domagk khám phá đc
Sulfonamides vƠ mưi đn nm 1940 H.W.Florey vƠ E.Chain chng minh kh nng
chng nhim trùng ca Penicillin. T đó m ra mt thi đi huy hoàng v kháng sinh
liu pháp đc đa vƠo s dng lơm sƠng. n nm 1948, nhiu loi kháng sinh đư
đc khám phá dùng đ c ch hoc tiêu dit vi khun vƠ “k nguyên kháng sinh” mi
thc s bt đu.
n đu thp niên 80, đư thng mi hóa trên 50 loi Penicillin, 70 loi
Cephalosporins, 12 loi Tetracyclines, 8 loi Aminoglycosides, 1 Monobactams, 3
Carbapenems, 9 Macrolides và các Fluroquinolones. NgƠy nay đư có hn 4000 kháng
sinh tit ra t nm và vi khun, hn 30000 kháng sinh bán tng hp và trên 100 kháng
sinh đc dùng trong y hc. Nhng kháng sinh có ngun gc vi sinh th còn đc
dùng trong bo qun thc n, bo v cây trng, và dùng trong thc n gia súc vƠ thú y.
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHH: Ths.Bs Lê Quc Thnh
SVTT: Phan Th Kim Hng Trang 11
MSSV:1053010260
1.2.1.3 .
Nhóm Refampin gn vi enzyme RNA polymerase ngn cn quá trình sao mã
to thành mRNA (RNA thông tin)
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHH: Ths.Bs Lê Quc Thnh
SVTT: Phan Th Kim Hng Trang 12
MSSV:1053010260
Nhóm Quinolone c ch tác dng ca enzyme DNA gyrase làm cho hai mch
đn ca DNA không th dui xon lƠm ngn cn quá trình nhơn đôi ca DNA.
Nhóm sulfamide có cu trúc ging PABA (p- aminobenzonic acid) có tác dng
cnh tranh PABA vƠ ngn cn quá trình tng hp acid nucleotid.
Nhóm Trimethoprim tác đng vào enzyme xúc tác cho quá trình to nhân purin
làm c ch quá trình to acid nucleic.
Nh Actinomycin, Mitomycin, Nalidixic acid, Novobiocin, Rifampin,
Sulfonamides, Trimethoprim
1.2.1.4
[27,17, 35]
Kháng sinh ngƠy cƠng đc tng hp nhiu, có nhiu bit dc khác nhau. Ta có
th phân kháng sinh theo nhiu cách.
Vi sinh vt (nm, x khun)
Penicillin t penicillin notatum
Streptomycin t Streptomyces.
Bán tng hp: Gc chính t vi sinh vt vƠ có gn thêm mt s nhóm chc:
Chlorocide.
Tng hp: Gentamycin; Cefotaxime.
Hot ph kháng sinh là phm vi tác đng ca mt kháng sinh ti vi khun. Da
vào hot ph chia kháng sinh ra:
Hot ph rng: Là kháng sinh có tác dng lên c cu khun vƠ trc khun Gram
dng, Gram ơm: Aminoside, Phenicol
Loi c ch enzym beta - lactamase: Acid clavulanic, Sulbactam.
Carbapenem: Imipenem.
Phân nhóm Cephalosporin:
Th h th nht: Cephalothin, Cephalexin, Cefazolin, Cefaclor
Th h th hai: Cefoxitin, Cefamadnole, Cefotetan, Cefmetazole, Cefuroxine .