B GIÁO DC VÀ ÀO TO
TRNG I HC M TP. HCM
KHOA CÔNG NGH SINH HC
tài:
TÌM HIU CN NGUYÊN VÀ TÌNH HÌNH KHÁNG
KHÁNG SINH CA CÁC LOÀI VI KHUN GÂY VIÊM
NG HÔ HP TRÊN TI BNH VIN 175 T 05/2013
N 04/2014.
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
CHUYÊN NGÀNH: VI SINH-SINH HC PHÂN T
GVHD: TS.BS V BO CHÂU
SVTH: NGUYN PHM PHNG TRÀ
MSSV: 1053010824
NIÊN KHÓA: 2010-2014
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHD: TS.BS V Bo Châu
SVTH: Nguyn Phm Phng Trà
LI CM N
u tiên, em xin gi li cm n chân thành ti thy V Bo Châu, thy đã đnh
hng và tn tình giúp đ em hoàn thành tt bài báo cáo thc tp này.
Em xin cm n các ch trong khoa vi sinh vt ca bnh vin 175 đã tn tình giúp
đ chia s nhng kinh nghim quý báo, nhit tình hng dn trong sut quá trình
em thc tp ti bnh vin 175.
Em xin gi li cm n chân thành ti quý thy cô, các anh ch trong Khoa Công
Ngh Sinh H
c cùng các anh ch trong phòng thí nghim vi sinh ca trng i hc
M Thành Ph H Chí Minh đã ch dy và truyn đt nhng kin thc quý báo
trong sut quá trình hc tp ti trng.
Cui cùng con xin cm n cha m, ngi đã sinh thành nuôi ln dy d đ con
đc trng thành nh ngày hôm nay.
Cm n tt c bn bè đã luôn ng h chia s khó khn đ mình hoàn thành tt bài
báo cáo th
c tp này.
Chân thành cm n!
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHD: TS.BS V Bo Châu
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHD: TS.BS V Bo Châu
SVTH: Nguyn Phm Phng Trà
3.3. Tình hình đ kháng kháng sinh 21
1. I TNG 24
1.1. Mu bnh phm 24
1.2. Cách ly mu bnh phm 24
1.2.1. Mu đàm 24
1.2.2. Dch nhy hng 24
2. VT LIU 24
2.1. Hóa cht 24
2.2. Môi trng 25
2.3. Thit b và dng c 27
3. PHNG PHÁP NGHIÊN CU 27
3.1. Phng pháp nghiên cu 27
3.2. K thut nghiên cu, phân lp đnh danh. 27
3.2.1. Kho sát trc tip 27
3.2.2. K thut nuôi cy, đnh danh 28
PHN III: KT QA NGHIÊN CU 34
VÀ THO LUN 34
1. KT QU 35
1.1. Tình hình nhim khun hô hp chung 35
1.2. Mi liên quan gia viêm đng hô hp trên và đ tui 36
1.3. M
i liên h gia VHHT và gii tính 37
1.4. Mi liên h gia VHHT và mùa. 38
1.5. C cu vi khun gây nhim khun hô hp 39
1.6. Tình hình đ kháng kháng sinh ca các vi khun phân lp đc 41
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHD: TS.BS V Bo Châu
SVTH: Nguyn Phm Phng Trà
DANH MC CÁC BNG
Bng 3. 1. c đim khun lc trên môi trng Uri 28
Bng 3. 2. Nng đ, kí hiu ca tng loi kháng sinh 32
Bng 1. 1. S tng quan gia chn đoán lâm sàng và kt qu xét nghim 35
Bng 1. 2. T l các loài vi khun gây viêm đng hô hp 39
Bng 1. 3. T l đ kháng kháng sinh ca S.feacalis 41
Bng 1. 4. T l đ kháng kháng sinh ca M.cataharrlis 42
Bng 1. 5. T l đ kháng kháng sinh ca K.pneumoniae 45
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHD: TS.BS V Bo Châu
SVTH: Nguyn Phm Phng Trà
DANH MC CÁC BIU
Biu đ 1. 1 Mi tng quan gia chn đoán lâm sàng và kt qu 35
Biu đ 1. 2 S tng quan gia VHHT và đ tui 36
Biu đ 1. 3. Mi liên quan giaVHHT và gii tính 37
Biu đ 1. 4. T l NKHH theo mùa 38
Biu đ 1. 5. T l VHHT theo mùa 38
Biu đ 1. 6. T l vi khun phân lp đc 39
Biu đ 1. 7. T
l đ kháng kháng sinh ca S.faecalis 41
khí hu nóng m nên rt thun li cho các vi khun, vi nm phát trin. Ngoài ra có
th là do d ng vi các loi d nguyên khác nhau có trong không khí, các hóa cht,
khói thuc lá, bi và ô nhim môi trng…
Vi khun bao gm nhiu loài khác nhau, nhng có mt s vi khun thng
ký sinh đng hô hp trên, bình thng chúng không gây bnh nhng khi gp
điu kin thun li, đc bit là khi sc đ kháng ca c th b gim sút, vì mt lý do
nào đó thì các vi khun ký sinh đng hô hp phát trin và gây bnh. Mt s vi
khun thng gp đng hô hp trên là h cu khun, trong đó đc bit lu ý là
loi vi khun ph cu (Streptococcus pneumoniae); liên cu, nht là liên cu nhóm
A (Streptococus pyogenes); Haemophilus influenzae, M.catarrhalis, xon khun
Vincent, mt s vi khun đng rut nh E.coli, Enterobacter, Citrobacter, thm
chí còn có c trc khun m xanh (P.aeruginosa), t cu vàng (S. aureus).
Trong nhng nm gn đây, ngi ta nhn thy cn nguyên gây NKHH là các
vi khun gây bnh c hi xut hin ngày càng nhiu vi kh nng đ kháng kháng
sinh rt cao, gây khó khn trong điu tr và kim soát nhim khun trong môi
trng bnh vin. Hu qu trc tip ca s gia tng đ kháng kháng sinh ca vi
khun là tng chi phí điu tr và nguy him hn là tng nguy c t vong cho bnh
nhân.
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHD: TS.BS V Bo Châu
2
SVTH: Nguyn Phm Phng Trà
Xut phát t nhu cu thc t lâm sàng, chúng tôi tin hành nghiên cu đ tài:
“Tìm hiu cn nguyên và tình hình đ kháng kháng sinh ca các loài vi
khun gây viêm đng hô hp trên ti bnh vin 175 t 05/2013 đn
04/2014”.
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHD: TS.BS V Bo Châu
3
Nhim khun hô hp là tình trng tác nhân gây bnh tng sinh trong đng
hô hp, gây nên viêm nhim đng hp, tác nhân đó có th là do vi khun hoc siêu
vi gây ra.
[1,12]
V phng din gii phu
[10]
, đng hô hp chia làm hai phn đng hô hp
trên và đng hô hp di, ly sn np thanh qun làm mc:
Viêm đng hô hp trên:
- Viêm mi
- Viêm hng
- Viêm Amidan
- Viêm tai gia
- Viêm xoang.
Viêm đng hô hp di:
- Viêm thanh qun
- Viêm khí qun
- Viêm ph qun
- Viêm tiu ph qun
- Viêm phi.
Bnh nhim khun hô hp có th
phát trin mnh nu gp điu kin thun
li: S thay đi thi tit nht là vào giai đon chuyn mùa, môi trng b ô nhim,
do n ung, do tip xúc vi hóa cht đc hi, nhng ngi có sc đ kháng yu
(ngi già, tr em),…Bnh có th t khi sau vài ngày, nhng nu không đc điu
tr đúng cách bnh có th ti
n trin nng hn dn ti chng suy hô hp, tràn dch
màng phi, nhim khun huyt, dn ti t vong.
1.2. Tình hình nhim khun đng hô hp
Nhim khun đng hô hp là bnh lý có t l t vong hàng đu trong s nhng
bnh nhim trùng. Interferon là yu t chng nhim trùng không đc hiu, có tác
dng ngn cn s nhân lên ca vi rút.
- Các t
bào thc bào: đi thc bào, h thng võng ni mô bt và tiêu dit các
vsv xâm nhp vào c th qua con đng hô hp. T bào NK (natural killer) là t bào
lympho ngoi vi, có tác dng tiêu dit các t bào đích. Các t bào lympho T
C
có tác
dng tiêu dit t bào đích nh t bào nhim vi rút, các t bào lympho khác nh T h
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHD: TS.BS V Bo Châu
7
SVTH: Nguyn Phm Phng Trà
tr hay T
CD4
vi chc nng điu hòa min dch, nên có vai tò rt quan trng trong
c ch chng nhim trùng.
2. VIÊM NG HÔ HP TRÊN
2.1. nh ngha
[21]
Bnh viêm đng hô hp trên là tt c nhng bnh viêm nhim tính t ca
mi trc đn thanh qun. Viêm đng hô hp trên không phi là mt bnh mà là
mt t hp bnh bao gm: cm lnh, viêm mi hng, viêm hng, viêm xoang, viêm
thanh qun. Mc dù có nhiu bnh đn l khác nhau nhng chúng đu có mt s
biu hin chung rt d nhn thy. Nhng triu chng ch
yu bao gm: st cao, ht
hi, s mi, chy mi, ngt mi, tc mi, đau rát hng, ho, khàn ting, lc ting,
ging mi, khn đc có khi mt ting, mt mi, đau đu, đau mi c khp…
c đim quan trng ca viêm đng hô hp trên là thi gian bnh ngn,
n mi
Trong nhng trng hp viêm xoang thng có kèm theo triu chng đau đu Còn
tr em b viêm amidan mn tính kéo dài mà cn nguyên do trc khun m xanh
(Pseudomonas aeruginosa) thì cht nhày chy ra mi thng có màu xanh mà
ngi ta hay gi là “thò lò mi xanh”, ngoài ra tr còn th ngáy, ng mm.
2.2. Mt s bnh liên quan đn đng hô hp trên
Viêm hu hng (pharyngitis):
- Nguyên nhân: thng do t cu, liên cu hoc d ng
- Triu chng: ho, đau hng, ni hch c
- Bin chng: st thp, thp khp hay thp tim, viêm cu thn cp
- iu tr: ung kháng sinh penicillin, Erythromycin, Amoxicillin
Viêm xoang (sinusitis):
- Nguyên nhân: tc nghn trong xoang, do vi khun hoc vi nm, phù niêm
mc xoang.
- Triu chng: ho, s
mi, đau vùng xoang, nhc đu.
- iu tr: ung kháng sinh cephalosporin th h 2, Amoxicillin/clavulanate,
augementin, roxithromycin trong giai đon cp tính và đôi khi phu thut ni soi
trong giai đon mn tính.
Viêm tai gia:
- Nguyên nhân: khi ngun do nhng bt n đng hô hp nh do viêm
hng, viêm các hch lympho,…
- Triu chng: đau tai, ù tai, mt sc nghe, màng tai phòng và mt bóng bình
thng.
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHD: TS.BS V Bo Châu
9
SVTH: Nguyn Phm Phng Trà
- iu tr: Nh đã la chn các thuc kháng sinh đã lit kê đ cha viêm
xoang điu có hiu qu trong điu tr viêm tai gia.
10
SVTH: Nguyn Phm Phng Trà
- Trong môi trng lng: vi khun d hình thành các chui và các chui này
không b gãy, dn dn to thành nhng ht hoc nhng bông ri lng xung đáy
ng, sau 24h nuôi cy môi trng phía trên trong sut, đáy ng có cn.
- Trong môi trng đc: vi khun mc thành các khúm tròn nhn và dt,
đng kính khong 1-2 mm.
S.pneumoniae thng c trú vùng t hu ca ngi lành, vi t l cao t
40 – 70%, VK có th gây viêm đng hô h
p, đin hình là viêm phi. Viêm phi do
S.pneumoniae xy ra sau khi đng hô hp b tn thng do nhim vi rút hoc hóa
cht.
[18]
S.pneumoniae hình thành mt lp v dày ti các ni tn thng, ngn cn
hin tng thc bào, có nhiu fibrin bao quanh ni tn thng, to mt vùng cách
bit làm cho thuc kháng sinh khó tác dng, mc dù vi khun nhy cm vi kháng
sinh. Bnh gp quanh nm, nhng có th phát trin thành dch vào mùa đông
xuân.
[19]
Trên môi trng thch máu, có 3 kiu tiêu huyt:
- Tiêu huyt : Khun lc đc bao quanh bng mt vòng màu xanh lt tng
đi hp (1-2 mm). ây là hin tng tiêu huyt không hoàn toàn, ch có mt phn
hng cu b tiêu dit.
- Tiêu huyt : Xung quanh khóm vi khun có mt vòng trong sut rng 2-
4mm. ây là kiu tiêu huyt hoàn toàn, không có hng cu chung quanh khúm.
- Tiêu huyt : màu thch xung quanh khóm vn không thay đi. Trong trng
hp này hng cu không b tiêu dit.
Hình 1. 2. Các kiu tiêu huyt trên BA.
bn cht là protein, gây nên các nt đ trong bnh st tinh hng nhit.
d. Kh nng gây bnh
Kh nng gây bnh tùy thuc loi vi khun, s đáp ng ca c th ký ch và
đng vi khun xâm nhp.
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHD: TS.BS V Bo Châu
12
SVTH: Nguyn Phm Phng Trà
2.4.2. Staphylococcus spp
.[1,6]
a. c đim
Staphylococcus spp là loi cu khun Gram dng, hình cu, xp thành
chùm không đu nhau, không di đng và không sinh bào t.
Vi khun mc d dàng trên hu ht môi trng nuôi cy vi khun, trong điu
kin hiu khí, vi hiu khí và k khí tùy nghi.
Trên môi trng đc: S.aureus mc khúm vàng, S.epidermidis thng cho
khúm xám hay trng.
Trên thch máu: S.aureus gây tiêu huyt, còn các loi khác ít gây tiêu huyt.
Hình 1. 3. Hình thái S.aureus vt kính x100
b. Enzyme và đc t
Enzyme.
- Catalase: bin hydrogen peroxide thành nc và oxygen.
- Coagulase: do S.aureus có tác dng làm đông huyt tng, đc xem là 1
yu t đc góp phn vào c ch gây bnh.
- Hyaluronidase: làm tan acid hyaluronic, giúp vi khun lan tràn trong mô c
th.
- Staphylokinase: làm tan fibrin (si huyt).
- Proteinase: phá hy protein.
c. Kh nng gây bnh
Staphylococcus spp đc bit là S.epidermidis thng trú trên da, đng hô
hp và đng tiêu hóa. Khong 40-50% ngi mang S.aureus mi.
Kh nng gây bnh ca S.aureus (coagualase dng) là kt hp cht ngoi bào
và tính xâm ln ca vi khun. Nhng Staphylococcus spp không gây bnh không có
kh nng xâm ln nhng có th gây nhim sau th thut ngoi khoa.
Báo cáo khóa lun tt nghip GVHD: TS.BS V Bo Châu
14
SVTH: Nguyn Phm Phng Trà
2.4.3. Pseudomonas aeruginosa
a. c đim
Hình 1. 4. Hình thái P.aeruginosa vt kính x100
Pseudomonas spp là nhng trc khun Gr (-), hiu khí tuyt đi, có th tit
ra sc t. Ging Pseudomonas có hn 300 loài, trong đó có 11 loài liên quan đn
bnh ngi, 3 loài thng gp nht là: P.aeruginosa, P.cepacia và P.maltophilia.
Pseudomonas aeruginosa còn gi là trc khun m xanh, thng hay cong, di
đng, mc d dàng trên các môi trng thông dng, có mùi nho.thng sng trong
thiên nhiên khp ni trên th gii, nh
t là môi trng m t.
Trên môi trng đc: khun lc thng to ging nh qu trng p (fried
eggs), nhn, dt, trung tâm li, có màu xanh ánh kim và có xu hng mc lan. Khi
nuôi cy vi khun này trên môi trng thch máu, khun lc mc gây tan máu hoàn
toàn ().
Trong môi trng lng vi khun mc thành váng có màu xanh trên mt
môi trng, môi trng đc.
Tit ra 4 loi sc t:
- Pyocyanin: màu xanh l, có th tan trong nc, không phát hunh quang, là
mt s
M.curiculi. Trong đó ch có M.cataharrlis gây bnh cho ngi, các loài còn li gây
bnh cho đng vt nh cu th, chut lang.
[13]
M.cataharrlis đc coi là cn nguyên gây nhim trùng đng hô hp tr
em và ngi ln. nhng ngi b suy gim min dch, M.cataharrlis có th gây ra
nhiu bnh nhim trùng nng nh: viêm màng trong tim, viêm não cp, viêm tai
gia, viêm xoang,…