BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO
TRƢỜNG ĐẠI HỌC NÔNG LÂM TP. HCM
------
KHÓA LUẬN TỐT NGHIỆP
ĐỊNH DANH VÀ PHÂN NHÓM NẤM
Trichoderma spp. PHÂN LẬP
TẠI VIỆT NAM
Ngành học: CÔNG NGHỆ SINH HỌC
Niên khóa: 2003 – 2007
Sinh viên thực hiện: NGUYỄN THỊ KHẢ TÚ Thành phố Hồ Chí Minh
Tháng 9/2007
Thành phố Hồ Chí Minh
Tháng 9/2007iii
tef1
Trichoderma
TreeView 1.6.6.
tef1 Trichoderma
Kết quả đạt đƣợc
Trichoderma.
Trichoderma.
Trichoderma T. longibrachiatum, T. asperellum,
T. atroviride, T. harzianum, T. virens T. asperellum
v
T. asperellum
Kết luận
tef1
Trichoderma.
tef1
Trichoderma
Trichoderma genus were compared with their data at different ecological,
geographic areas on over the world to clear the genetic relationship.
The results show that confirming exactly the species of 10 Trichoderma genus,
T68 genus was identified T. atroviride. Establishing and clearing the genetic
relationship among 11 Trichoderma genus. In which, 11 Trichoderma genus in Viet
Nam of 5 species T. longibrachiatum, T. asperellum, T. atroviride, T. harzianum ,
T. virens (except T. asperellum genus (T6)) have a rather far genetic relationship
from others in the world. 10 genus orginated from locality and
T. asperellum (T6) is the one migrated in our country. Genetic relationship among 5
species is stable and suitable with morphological characteristics.
vii
MỤC LỤC
................................................................................................................. iv
ABSTRACT .............................................................................................................. vi
................................................................................................................. vi
....................................................................... x
..................................................................................... xii
...................................................................................... xii
..................................................................................................................... 0
..................................................................................................................... 0
1.1. ...................................................................................................... 0
1.2. ........................................................................................................ 0
1.3. .......................................................................................................... 0
..................................................................................................................... 2
........................................................................................... 2
2.1. Trichoderma ..................................................................... 2
Trichoderma
............................ 24
g 4 ................................................................................................................... 25
................................................................................. 25
4.1. ................................................................................... 25
4.2. tef1 ........... 26
4.3. ........................................................................... 27
4.4. ..................................................... 35
4.4.1. tef1
................................................................................................................ 35
4.4.2. rDNA ........ 37
4.5. ...... 39
4.6.
tef1 ................................................................. 41
................................................................................................................... 44 ix
....................................................................................... 44
5.1. ........................................................................................................ 44
5.2. ......................................................................................................... 44
RNA: Ribonucleic acid.
SDS: sodium dodecyl sulfate.
Taq: Thermus aquaticus.
TAE: Tris-glacial acetic acid- ethylenne diamine tetra acetic acid.
TE: Tris ethylene diamine tetra acetate.
Tm: Melting Tempereture .
. xi
DANH SÁCH CÁC BẢNG
........... 15
............................... 20
....... 21
................................................................... 21
Trichoderma ....... 22
tef1 Trichoderma ..................... 23
............ 28
. 20
tef1
EF1 986F .............................. 20
Trichoderma
.............................................................. 26
Trichoderma
V, 400 A trong 20 p ............ 26
V, 400
rDNA
...................................................................................... 27
EF1 ............................................................. 27
tef1 (B). ...................................................................................................... 36
rDNA (A) rDNA (B)
................................................................................................................... 38
rDNA
............................................................................. 40
rDNA Trichoderma .......
........................................... 43
tef1
........................................... 42
MỞ ĐẦU
1.1. Đặt vấn đề
Trichoderma
Trichoderma
tef1 986R
Trichoderma
tef1
Trichoderma
tef1
talX 1.83
1.6.6.
tef1 Trichoderma
TreeView 1.6.6.
2
Trichoderma
Hình 2. 1 T. harzianum 2 3
Trichoderma l
T. koningii-
Trichoderma
Trichoderma
T. virens),
m.
4
T. harzianum
hlamydospores
Trichoderma
2.1.4. Đặc điểm sinh lý, sinh hóa, sinh học
Trichoderma
spp., Phytophthora spp., Rhizoctonia spp., Sclerotinia spp., Botrytis spp., Fusarium
Crinipellis spp.
5
-1,3-
Tiết kháng sinh: T. virens ,
Rhizoctonia solani Pythium spp. Isonitriles
T. hamatum, harzianum, viride, koningii, polysporum
T. atroviride T. viride -pentyl alpha-pyrone
pyrones)
Phytophthrora cinnamomea
Botrytis cinnerea. Peptaibols do T. polysporum, harzianum, koningii
T. virens, koningii,
viride sesquiterpenes olyketides T. harzianum Steroids
T. virens.
Ký sinh: Trichoderma
Trichoderma
Trichoderma
glucanase,
2.2. Cấu tạo tế bào Trichoderma
Trichoderma
glucan, mannoprotein (Siu-Wai Chiu
7
Trichoderma
2.3. Các phƣơng pháp định danh tên loài của Trichoderma
Trichoderma
.
Trichoderma.
Hypocrea GliocladiumTrichoderma.
Trichoderma
T. asperellum T. viride
0
).
T. atroviride T. viride
Trichoderma
. (ITS1, ITS2, RAPD)
Trichoderma
Trichoderma/ Hypocrea
h danh Trichoderma
T. viride
T. koningii T. atroviride tef1
(Genealogical Concordance Phylogenetic Species Recognition
Trichoderma
10
N. crassa, Schizosaccharomyces pombe S. cerevisiae,
Vicia faba S. prombe, S. cerevisiae Oryza
sativa
N. crassa,
2.5. Giới thiệu về vùng tef1
Trichoderma
Trichoderma (Gary J.
12
rDNA,
Penicillium spp., Aspergillus spp.
Paecilomyces spp. Trichocomaceae
Acrasiomycota, Myxomycota,
Oomycota Fungi
Schizosaccharomycetales Myxomycota
rDNA (Large Subunit rDNA, 24S),
P. carinii Basidiomycete trong
SSU S. apiospermum
and S. prolificans
ng T.
harzianum rDNA.
Trichoderma
Trichoderma