KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: TS.BS V BO CHÂU
SVTH: TRN TH DIM HNG
B GIÁO DC VÀ ÀO TO
TRNG I HC M TP.HCM
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
Tên đ tài:
KHO SÁT KH NNG GÂY BNH VÀ KHÁNG KHÁNG
SINH CA TRC KHUN M XANH TRÊN BNH NHÂN TI
BNH VIN 175 T 11/2013 – 5/2014
KHOA CÔNG NGH SINH HC
CHUYÊN NGÀNH: VI SINH
CBHD: TS-BS V Bo Châu
SVTH: Trn Th Dim Hng
MSSV: 1053010312
Khóa: 2010 – 2014
Tp. H Chí Minh, tháng 05 nm 2014
KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: TS.BS V BO CHÂU
SVTH: TRN TH DIM HNG
LI CM N
thc hin tt đ tài khóa lun tt nghip này, em xin chân thành cm n thy
V Bo Châu ngi đã trc tip ch dy và hng dn, to điu kin cho em hoàn
thành tt bài khóa lun tt nghip trong thi gian qua.
CS Colistin
MEM Meropenem
PT Pristinamycin
TM Tobramycin
P.aeruginosa Pseudomonas aeruginosa
S.aureus Staphylococcus aureus
K.pneumoniae Klepsiella pneumoniae
E.coli Escherichia coli
E.faecalis Enterococcus faecalis
S Susceptible (nhy cm)
I Intermediate (trung gian)
R Resistant (đ kháng)
N S ca dng tính vi P.aeruginosa
KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: TS.BS V BO CHÂU
SVTH: TRN TH DIM HNG ii
MC LC
DANH MC CÁC T VIT TT i
DANH MC HÌNH v
DANH MC BNG BIU vi
T VN 1
Phn I: TNG QUAN TÀI LIU 2
I.1 TRC KHUN M XANH (Pseudomonas aeruginosa) 3
I.1.1 Lch s phát hin 3
I.1.2 Danh pháp: 4
I.1.3 c đim sinh vt hc 4
I.1.3.1. Hình th 4
I.1.3.2 Nuôi cy 5
21
I.3.4.1 Hin tng đ kháng kháng sinh: 21
I.3.4.2 Nguyên nhân vi khun kháng thuc kháng sinh: 22
I.3.4.3 C ch kháng thuc kháng sinh ca vi khun 22
I.3.4.4 Tình hình đ kháng kháng sinh ca Pseudomonas aeruginosa hin nay . 23
PHN II: I TNG, VT LIU VÀ PHNG PHÁP NGHIÊN CU 25
II.1 I TNG NGHIÊN CU: 26
II.2 A IM VÀ THI GIAN NGHIÊN CU: 26
II.3 VT LIU NGHIÊN CU: 26
II.3.1 Môi trng, hóa cht đ nuôi cy vi khun: 26
II.3.2 Dng c, trang thit b 26
II.4 PHNG PHÁP VÀ K THUT NGHIÊN C
U 27
II.4.1 Phng pháp nghiên cu: 27
II.4.2 K thut nghiên cu: 28
II.4.2.1 i vi bnh phm là m dch, cht dch ph qun, nc tiu, dch
màng phi, phân… 28
II.4.2.2 Bnh phm máu: 29
II.5 PHNG PHÁP NH DANH P.AERUGINOSA 32
II.5.1 Kho sát khóm khun trên thch BA 32
KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: TS.BS V BO CHÂU
SVTH: TRN TH DIM HNG iv
II.5.2 nh danh bng môi trng Uriselect 4 32
II.5.3 Kho sát khun lc bng phng pháp nhum gram 33
II.5.3 Th nghim Oxidase 35
II.6 K THUT KHÁNG SINH THEO PHNG PHÁP KIRBY-BAUER. 36
II.6.1 Nguyên tc: 36
II.6.2 Vt liu và phng pháp 36
KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: TS.BS V BO CHÂU
SVTH: TRN TH DIM HNG vi
DANH MC BNG BIU
Bng 1: Bng ký hiu các kháng sinh làm kháng sinh đ cho P.aeruginose 40
Bng 2: C cu các loài vi khun gây bnh phân lp đc 42
Biu đ 1: T l các loài vi khun gây bnh phân lp đc 43
Bng 3: Kt qu nhim P.aeruginosa theo tng mu bnh phm 44
Biu đ 2: Kt qu nhim P.aeruginosa theo tng mu bnh phm 45
Bng 4: T l nhim P.aeruginosa theo gii tính: 46
Biu đ 3: K
t qu nhim P.aeruginosa theo gii tính 47
Bng 5: Kt qu nhim P.aeruginosa theo đ tui 47
Biu đ 4: T l nhim P.aeruginosa theo đ tui 48
Bng 6: T l đ kháng kháng sinh ca P.aeruginosa trên bnh nhân 50
Biu đ 5: T l kháng kháng sinh ca P.aeruginosa 51
KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: TS.BS V BO CHÂU
SVTH: TRN TH DIM HNG 1
T VN
Nhim khun bnh vin là mt trong nhng thách thc và là mi quan tâm hàng
SVTH: TRN TH DIM HNG 3
I.1 TRC KHUN M XANH (Pseudomonas aeruginosa)
I.1.1 Lch s phát hin
T đu th k th 19, ngi ta đã thy hin tng nhum màu xanh r đng ca các
cht tit t m các vt thng (Fordo, 1860).
- Nm 1862, Liche phân lp đc các vt thng nhng vi khun có hình que
và gi chúng là “vibrio”.
- Nm 1872, Schroeter phát hin trong m xanh màu r đng mt loi trc khun
Gram âm và ông đt tên cho vi khun đó là Bacterium aeruginosum.
- Nm 1985, Migula đ ngh xp loi vi khun này vào ging Pseudomonas, do
nó thng nhim vào vt thng to m xanh nên gi là Pseudomonas
pyocyanea.
-
Sau đó ngi ta thng nht gi tên vi khun này là Pseudomonas aeruginosa
cho đn ngày nay.
[4] KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: TS.BS V BO CHÂU
SVTH: TRN TH DIM HNG 4
I.1.2 Danh pháp:
Phân loi khoa hc
Gii (regnum)
Bacteria
Ngành (phylum)
Proteobacteria
37-42
o
C và có th mc nhit đ 5 - 42
o
C, pH thích hp là 7,2-7,5. Khun lc
thng ln, trong, b đu hoc không đu, có th có ánh kim loi, màu xám nht
trên nn môi trng màu hi xanh, mùi thm. Cng có th gp loi khun lc xù xì
hoc nhy.
- Tính cht đc trng ca trc khun m xanh là sinh sc t và cht thm.
- Trên môi trng nuôi cy có pepton, vi khun có th tit ra các loi sc t sau:
Pyocyanin: là loi sc t phenazin có màu xanh l, tan trong nc và
Cloroform, khuch tán ra môi trng nuôi cy làm cho môi trng và
khun lc có màu xanh. Sc t này sinh ra thun li vi môi trng tip
xúc vi không khí. Ch có trc khun m xanh sinh sc t pyocyanin.
Pyoverdin: là loi sc t hunh quang, phát màu xanh khi chiu tia cc
tím có bc sóng 400nm, tan trong nc nhng không tan trong
Cloroform. Ngoài trc khun m xanh còn có mt s loài Pseudomonas
khác to thành sc t này.
Pyorubin: sc t màu h
ng nht, ch 1% s chng trc khun m xanh
sinh ra sc t này.
Pyomelanin: sc t màu nâu đen, ch 1-2% s chng trc khun m xanh
sinh sc t này.
[15]
I.1.3.3 Tính cht sinh hóa
S dng carbohydrat theo li oxy hóa có sinh axit nh glucose, manitol,
glycerol, arabinose…
KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: TS.BS V BO CHÂU
sc nguy him.
Yu t đc lc ngoi bào (extracellular virulence factors)
KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: TS.BS V BO CHÂU
SVTH: TRN TH DIM HNG 7
- Protease: gm 2 loi là elastase và alkaline protease. Elastase làm ri lon
biu mô hô hp. Alkaline protease ngn cn s hình thành fibrin và làm tan
fibrin.
- Hemolysins: gm phospholipase C và rhamnolipid, có th tác đng hip lc
đ phá v lipid và lecithin. C hai tham gia quá trình xâm ln mô bng các
hiu ng gây đc t bào.
- Ngoi đc t A (Exotoxin A): c ch quá trình sinh tng hp protein, là
nguyên nhân gây tn thng mô cc b, s xâm ln ca vi khun và có th c
ch min dch.
[4]
I.1.4 Dch t hc
Vi khun P.aeruginosa có trên da ca mt s ngi bình thng, nht là
vùng nách và vùng hu môn sinh dc. Vi khun ít có trong phân ngi ln không dùng
kháng sinh. Trong đa s các trng hp, vi khun P.aeruginosa nh là ngun lây th
phát không đc hi, trên các vt thng nông hoc đm ca bnh nhân đc điu
tr kháng sinh. Tuy nhiên, đôi khi P.aeruginosa gây nhim khun ti phi, da hoc
đng tit niu ca bnh nhân, xy ra sau khi vi khun gây bnh đu tiên b tiêu dit
bi kháng sinh. Nhim khun nng xy ra khi luôn có phi hp vi tn thng các mô
ti ch hoc khi sc đ kháng ca vt ch b gim sút. Mt dù các chng Pseudomonas
có nhiu yu t đc lc mnh, nhng vi khun ít khi gây bnh ngi khe mnh.
Bnh nhân b bnh nhy nht (cystic fibrosis) hoc gim bch cu đa nhân d có nguy
c nhim khun nng do trc khun m xanh. Tr s sinh b đ non, tr có d dng bm
não. Hình nh v mô hc là hình nh ca hoi t và xut huyt. in hình là các thành
ca tiu đng mch b thm lâu nng bi vi khun và các mch máu b huyt khi mt
phn hoc toàn b. Phn ln các chng trc khun m xanh sinh ra mt lp nhp giàu
hydrat-carbon và cùng vi thành ca t bào vi khun tham gia vào tính cht kháng
nguyên thân chu nhit. Kháng th đc thù ca typ huyt thanh kháng nguyên nht có
tác dng bo v chng các mu gây bnh thc nghim. Phn ln các chng đc phân
lp cng sinh ra mt s ngoi đc t. Ngoi đc t A, có nhiu tính cht gn ging tính
cht ca đc t bch cu, là đc t mnh nht ca trc khun m xanh. Trong nhim
KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: TS.BS V BO CHÂU
SVTH: TRN TH DIM HNG 9
khun rt nng do trc khun m xanh, nng đ cao kháng th chng ngoi đc t A
tng quan vi s gia tng t l bnh nhân sng.
[16]
I.1.6 Biu hin lâm sàng.
Nhim khun do P.aeruginosa xut hin nhiu ni bao gm da, các mô di
da, xng và khp, mt, tai, xng chm và các xoang hàm, màng não và các van tim.
Cng có th nhim khun huyt mà không phát hin ra nhim khun tiên phát
và cn đt vn đ lây do các thuc tiêm tnh mch, các dch truyn tnh mch hoc các
thuc sát trùng đ sát trùng ni chun b tiêm tnh mch, nht là khi phân lp đc các
chng P.aeruginosa khác ngoài trc khun m xanh.
[16]
I.1.6.1 Nhng yu t liên quân ti nhim khun Pseudomonas aeruginosa
Phá v hàng rào da và niêm mc
Tn thng do bng
Viêm da
Vt thng xuyên thu
đáp ng viêm toàn thân, suy đa c quan và cui cùng gây t vong. Nhim khun không
ch gây nhim khun ti ch bnh nhân b suy gim min dch mà còn có kh nng
xâm nhp và lan ta trong dòng máu rt mnh.
Các vi khun P.aeruginosa thng cy đc các vt thng ngoi khoa, loét
do phình tnh mch, loét nm, các vt bng, nht là sau khi điu tr kháng sinh. Các lô
dò do lao hoc do viêm xng ty có th b nhim khun th phát. S có mt đn
thun ca P.aeruginosa nhng ni này ít có ý ngha vi điu kin là vi khun không
nhân lên phn sâu ca các mô di da và không xy ra nhim khun huyt. Nhim
khun da thng khi sau khi các mô cht đc ly đi hoc bong ra. P.aeruginosa có
th làm móng tay xanh nht nhng ngi ngâm tay quá lâu trong nc, trong xà
phòng và các cht ty, khi tay h có nm móng hoc b chn thng. Vi khun thng
cy đc móng tay P.aeruginosa có th gây viêm da khi tm ch nc nóng.
Nhim khun này nh và khi t nhiên.
[9]
KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: TS.BS V BO CHÂU
SVTH: TRN TH DIM HNG 11
I.1.6.2 Các bnh lý nhim trùng do Pseudomonas aeruginosa
Nhim khun đng hô hp
- Viêm phi nguyên phát, hay viêm phi không nhim khun, do hít phi nhng
cht tit ca đng hô hp trên, thng gp nhng bnh nhân b bnh phi
mãn tính, suy tim sung huyt hoc AIDS.
- Vãng khun huyt do P.aeruginosa khi đu nh mt nhim khun đng hô
hp, nhng khác viêm phi nguyên phát, nó có gim bch cu trung tính, sau đó
vi khun xâm nhp vào máu và lan rng đi xa to nên nhng tn thng đt
trng phi và các tng khác.
- Nhim khun đng hô hp di do P.aeruginosa thng gp tr ln, thanh
niên b x gan, ngoài ra còn gp bnh nhân AIDS.
u th trong viêm tai ngoài, mt quá trình viêm lành tính nh hng đn ng ti
ngoài. Tai đau hoc ch nga, có chy m tai và đau xy ra khi kéo vành tai.
ng tai ngoài sng lên và cha đy các ráy tai làm ta không thy đc màng
nh.
- Thnh thong P.aeruginosa xuyên qua lp biu mô che ph nn ng tai ngoài ti
ch ni gia xng và xâm nhp vào mô mm bên di. Quá trình xâm nhp
này liên quan ti mô mm, sn và v xng thì xy ra chm nhng mang tính
cht phá hy gi là viêm tai ngoài ác tính. Hu ht các trng hp viêm tai
ngoài ác tính đu do P.aeruginosa gây ra.
Nhim khun mt
- P.aeruginosa gây viêm giác mc hay loét giác mc và viêm ni nhãn. Viêm giác
mc do P.aeruginosa có th ch t mt vt thng giác mc nh mà đã phá v
tính toàn vn ca lp biu mô b mt và cho phép vi khun tin vào lp mô đm
bên di. Loét giác mc có th do bin chng ca s dng kính áp tròng mang
trong dài ngày. Viêm giác mc do P.aeruginosa thng bt đu bng mt vt
KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: TS.BS V BO CHÂU
SVTH: TRN TH DIM HNG 13
loét nh trung tâm ri lan đng tâm ra phn ln giác mc, cng mc, mô đm
bên di, có th gây thng giác mc phía sau.
- Viêm ni nhãn do P.aeruginosa đin hình là mt tình trng đe da chc nng th
giác, tin trin nhanh, phi đòi hi can thip điu tr ngay lp tc.
Nhim khun xng và khp.
- Viêm ty xng ct sng do P.aeruginosa liên quan ti nhim khun đng
niu có bin chng, s dng dng c hay phu thut đng niu, và s dng
thuc đng tiêm.
- M khp c đòn do P.aeruginosa là mt bin chng khác ca vic s dng
thuc bng đng tiêm chích, trong vài trng hp nó đi kèm theo viêm màng
nhim vi khun này.
Nhim khun P.aeruginosa bnh nhân AIDS
- Trong sut thp niên 80 và 90, nhim khun do P.aeruginosa ngày càng gia tng
nhng bnh nhân AIDS tin trin, nhim khun c hi trc đó. Cn chú ý đa
s nhim khun P.aeruginosa trong dân s này là do mc phi trong cng đng.
- Viêm phi chim mt t l quan trng trong s các nhim khun do
P.aeruginosa bnh nhân b AIDS.
[9]
I.1.6.3 Tình hình nhim Pseudomonas aeruginosa
Theo tng kt ca B Y T nm 2004 v tình hình nhim trùng bnh vin, t l
vi khun P.aeruginosa ti các bnh vin Vit Nam nh sau: Bnh vin Bch Mai
(13,1%), Bnh vin Ch Ry (20,6%), Bnh vin Nhi (16,6%), Bnh vin Bình nh
(11,3%).
Ti bnh vin Nhi ng 1, nm 2011 vi khun P.aeruginosa chim 6,75% trong
tng s 4073 vi khun phân lp đc ti khoa vi sinh.
[3]
Theo nghiên cu ca Trn Vn Ngc v S đ kháng kháng sinh ca vi khun
gây bnh viêm phi bnh vin và phng pháp điu tr thích hp trong giai đon hin
KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: TS.BS V BO CHÂU
SVTH: TRN TH DIM HNG 15
nay, t l t vong do viêm phi bnh vin khong 33-50%, liên quan đn nhim trùng
huyt, đc bit do P.aeruginosa và Acinetobacter.
[6]
Theo nghiên cu v S đ kháng kháng sinh ca vi khun gây bnh thng gp
đc thanh trùng đúng mc.
- Ni sinh (endogenous source): t mt vi khun mt ni khác trên cùng c
th đó.
Ngun nhim trùng trong các bnh vin có th là:
Con ngi: các bnh nhân khác hoc nhân viên y t, hoc có th là ngi thm
bnh. Có th là nhng ngi đang nhim khun, nhng ngi đang trong thi
gian bnh hoc ngi lành mang bnh…
Môi trng: ngun nhim có th là các đ vt, thc phm, nc và không khí
trong môi trng bnh vin b nhim khun. Các ngun này có th b nhim t
các cha vi khun bên ngoài môi trng. Nhim trùng bnh vin lây lan theo
các git nh hoc các ht bi l lng trong không khí.
I.2.3 ng lây nhim:
Nhim trùng bnh vin đc lây lan theo đng không khí hoc do tip xúc vi
các dng c y t dùng trong bnh vin. Cùng mt vi khun có th lây lan qua nhiu con
đng khác nhau.
I.2.4 Các yu t nh hng:
Nhim trùng bnh vin ph thuc vào các yu t:
Vi khun gây bnh: s lng, đc tính, hot lc.
Kí ch: yu t kí ch đóng mt vai trò đc bit quan trng trong các bnh nhim
trùng đc bit ti bnh vin, ni tp trung ca nhiu bnh nhân có sc đ kháng
chng nhim trùng thp.
KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: TS.BS V BO CHÂU
SVTH: TRN TH DIM HNG 17
S lây lan ca các vi khun gây nhim trùng đn các kí ch mi có th là kt qu
ca s thích ng và ny n ca các vi khun qua các nhim trùng th phát trên mt c
đa có bnh cnh lâm sàng rõ ràng và có th đa đn t vong.
I.2.5 Các nhim trùng bnh vin thng gp