B GIÁO DC ÀO TO
TRNG I HC M TP HCM
Tên chuyên đ:
Kho sát tính đ kháng kháng sinh ca các
chng Staphylococcus aureus phân lp đc t các
mu bnh phm máu và m ti Bnh vin Nhi ng
II t tháng 11/2013 đn tháng 04/2014
KHOA: CÔNG NGH SINH HC
CHUYÊN NGÀNH: VI SINH-SHPT
GVHD: ThS.BS Trn Th Ngc Anh
SVTH: Nguyn Th Hunh Nh
MSSV: 1053012551
Lp: SH10A4
Khóa hc: 2010-2014
Tp H Chí Minh, ngày tháng nm
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
Xác nhn ca GVHD
TP.HCM, ngày …… tháng …… nm ……
Ch ký ca Ging viên
(Ký và ghi rõ h tên)
khoa Vi sinh Bnh vin Nhi ng II, cùng các anh ch làm vic trong khoa, đc bit là
các anh ch làm vic ti nhóm nuôi cy Vi Khun nên em đã hoàn thành khóa lun tt
nghip. Trong quá trình thc tp ti Khoa, có điu gì thiu xót, mong cô và các anh
ch thông cm và b qua cho em.
Em xin chân thành cm n Ban giám hiu nhà trng và các thy cô trong
khoa Công ngh sinh hc đã truyn đt cho em nhng kin thc quý báu và to điu
kin cho em trong sut thi gian hc và rèn luyn ti trng.
Cui cùng, em xin gi li chân thành cm n đn gia đình, thy cô, anh
ch, bn bè đã giúp đ và to điu kin cho em trong quá trình thc tp tt nghip ti
bnh vin Nhi đng II.
Em xin chân thành cm n!
DANH SÁCH CH VIT TT.
BA: Blood Agar
Bactrim, SXT: Trimethoprime-sulfamethoxazole
BCP: Bromocresol Purble Agar
BP: Baird Parker
C: Chloramphenicol
CA: Chocolate Agar
CD: Clindamycin
CIP : Ciprofloxacine
CLSI: Clinical and Laboratory Standards Institute
CN: Gentamycine
E: Erythromycin
HIV: Human immunodeficiency virus
MHA: Mueller Hinton Agar
MRSA: Methicillin resistant Staphylococcus Areus
MSA: Manitol sait agar
ODC: Ornithine de hydrolase
Ox: Oxacilline
DANH MC BNG
Bng 1: So sánh nhng đc tính ca S.aureus, S.epidermidis và micrococci (Reginald
W.B. và cs, 2001) Trang 11
Bng 2: Mt s môi trng chn lc cho S.aureus Trang 13
Bng 3: Các enzyme do vi khun tit phá hy kháng sinh Trang 28
Bng 4: Các đa kháng sinh đt cho S.aureus Trang 36
Bng 5: Kt qu nuôi cy phân lp các loài vi khun t bnh phm máu Trang 55
Bng 6: Kt qu nuôi cy phân lp các loài vi khun t bnh phm m Trang 56
B
ng 7: T l các loi vi khun phân lp đc t bnh phm máu Trang 57
Bng 8: T l các loi vi khun phân lp đc t bnh phm m. Trang 58
Bng 9: Kt qu phân lp S.aureus trên bnh phm máu và m Trang 59
Bng 10: T l bnh nhân b nhim S.aureus theo gii tính Trang 60
Bng 11: T l phân lp S.aureus theo đ tui Trang 61
Bng 12: T l b
nh nhân b nhim S.aureus theo khoa trên bnh phm máu Trang 62
Bng 13: T l bnh nhân b nhim S.aureus theo khoa trên bnh phm m…Trang 63
Bng 14: Mc đ nhy cm kháng sinh ca S.aureus phân lp trên bnh phm máu .
Trang 64
Bng 15: Mc đ nhy cm kháng sinh ca S.aureus phân lp trên bnh phm m
Trang 65
Bng 16: Th nghim D-test Trang 66
DANH MC BIU
Biu đ 18: So sánh t l đ kháng kháng sinh ca S.aureus trên 2 mu bnh phm
máu và m t 11/2013 đn 04/2014 vi t l thng kê ti khoa Hi sc tích cc và
Chng đc Bnh vin cp cu Trng Vng nm 2010
Trang 70 DANH MC S
S đ 1: Quy trình cy máu Trang 42
III.3 S đ kháng kháng sinh 27
III.3.1 Ngun gc 27
III.3.2 C ch đ kháng kháng sinh 28
KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: ThS.BS. Trn Th Ngc Anh
SVTH: Nguyn Th Hunh Nh Trang 2
III.3.2.1 Tit enzyme c ch hoc phá hy kháng sinh 28
III.3.2.2 Thay đi cu trúc đích 28
III.3.2.3 Thay đi tính thm vi kháng sinh 26
III.3.2.4 Bm đy kháng sinh 26
III.3.2.5 Thay đi con đng bin dng 29
IV. Tính kháng thuc kháng sinh và kháng sinh thng dùng đ điu tr
Staphylococcus aureus 29
IV.1 Tính kháng thuc kháng sinh ca S.aureus 29
IV.1.1
T cu kháng Methicilline 31
IV.1.2 Th nghim D-test 32
IV.2 Kháng sinh thng dùng đ điu tr S. aureus 32
CHNG II: I TNG VÀ PHNG PHÁP NGHIÊN CU 34
I. i tng nghiên cu 35
II. Vi khun nghiên cu 35
III. Thi gian và đa dim nghiên cu 35
IV. Bnh phm, môi trng phân lp xác đnh vi khun và sinh phm. 35
IV.1 Bnh phm 35
IV.2.Môi trng 35
IV.3 Sinh phm 35
IV.4.Thit b 36
IV.5.Trang b khác 36
V. Phân lp và xác đnh 37
V.1 Phng pháp nghiên cu. 37
V.5 K thut xác đnh tính nhy cm kháng sinh ca S.aureus 50
V.5.1 Nguyên tc 50
V.5.2
Cách tin hành 50
V.5.2.1 Vt liu .50
V.5.2.2 Pha huyn dch vi khun 50
V.5.2.3 Tràn dch khun trên mt thch 51
V.5.2.4 t đa kháng sinh lên mt thch đã tri vi khun .51
V.5.3
Th nghim D-test 51
V.5.4 c và bin lun kt qu 52
KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: ThS.BS. Trn Th Ngc Anh
SVTH: Nguyn Th Hunh Nh Trang 4
V.6. Phng pháp thu thp và x lý s liu. 53
CHNG III: KT QU, BÀN LUN, KT LUN VÀ NGH 54
I. KT QU 55
I.1 Kt qu chung v nuôi cy phân lp các loài vi khun t máu m 55
I.2 T l các loi vi khun phân lp đc t máu và m 57
I.3 Kt qu phân lp S.aureus trên bnh phm máu và m. 59
I.4 S phân b S.aureus theo gii tính. 60
I.5 S phân b S.aureus theo đ tui. 61
I.6 T l phân lp S.aureus theo khoa. 62
I.7 Mc đ nhy ca kháng sinh vi S.aureus . 64
II. BÀN LUN 67
III. KT LUN 71
IV. NGH 73
Tài liu tham kho 74
PH LC 76
Ph lc 1: Mu đc kt qu kháng sinh đ theo CLSI 2012 76
Staphylococcus aureus (T cu khun) mt loi vi khun Gram dng không
to nha bào, không di đng và thng to thành cm ging nh chùm nho. Có th nói
t cu khun là mt trong nhng vi khun đc quan tâm nghiên cu do t l gây
bnh rt cao và có kh nng gây nhiu bnh nng nh: viêm xng ty
xng, nhim trùng huyt, viêm tc tnh mch xoang hang, viêm ni tâm mc, viêm
màng não m, áp xe m, ng đc thc phm…
Cng nh kh nng đ kháng kháng sinh rt mnh:
_ “Methicillin đc coi là kháng sinh hàng đu đc dùng cho điu tr các
nhim trùng do S. aureus kháng Penicillin. Tuy nhiên, ngay t nhng nm đu ca
thp niên 60, S. aureus kháng Methicillin đã đc ghi nhn, và tình trng đ kháng
này bt đu ngày càng nng n t gia thp niên 80. Vancomycin là kháng sinh chn
la hàng đu đ điu tr
S. aureus kháng Methicillin (MRSA), nhng vic ch và s
dng rng rãi Vancomycin có th s làm xut hin vi khun kháng Vancomycin do
s gia tng áp lc chn lc đ kháng. Cho đn nay ti Hoa K đã có 3 trng hp
S.aureus kháng Vancomycin và 24 trng hp ri rác trên th gii xut hin S.
aureus gim nhy cm vi Vancomycin”.
_ “Trong nhim khun bnh vin, các bác s điu tr đã phi loi b
Methicillin ra khi danh mc điu tr t cu vì có hn 80% là kháng đc Methicillin
(MRSA), và mc dù S. aureus rt him khi đc ghi nhn kháng đc Vancomycin
nhng trên thc t điu tr, t l tht bi điu tr t cu bng Vancomycin là khá cao
mà nguyên do là MIC ca Vancomycin đi vi t cu đã có mt t l khá cao là
2µg/ml”.
Xut phát t tình hình thc t trên tôi xin thc hin đ tài: “Kho sát tính đ
kháng kháng sinh ca các chng Staphylococcus aureus phân lp đc t các
mu bnh phm máu và m ti Bnh vin Nhi ng II t tháng 11/2013 đn
tháng 04/2014”.
([6],[16]
KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: ThS.BS. Trn Th Ngc Anh
SVTH: Nguyn Th Hunh Nh Trang 7 Chng I: TNG QUAN TÀI
LIU
KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: ThS.BS. Trn Th Ngc Anh
SVTH: Nguyn Th Hunh Nh Trang 8
SVTH: Nguyn Th Hunh Nh Trang 9
Chúng không di đng, không sinh nha bào, nang thì có mt trong
nhng t bào còn non nhng bin mt khi t bào giai đon pha n đnh. Màu
sc khun lc trên môi trng không chn lc nh Tryptic soy agar (TSA) có
th màu kem đn màu hng sáng.
Thành t bào cha peptidolican hình thành mt hàng rào vng chc xung
quanh t bào và acid teichoic giúp duy trì môi trng ion thích hp cho màng
cytoplasma, đng thi bo v b mt t cu.( [12],[23])
I.1.2. Tính cht nuôi cy:
Staphylococcus aureus là nhng vi khun hiu khí hoc k khí tùy nghi, có c
quá trình hô hp và lên men. Chúng thu nhn nng lng thông qua s chuyn hoá
glycosis, hexose monophosphate và chu trình axit tricarboxylic.
Staphylococcus aureus có catalase dng và s dng nhiu loi carbonhydrat
khác nhau, có th mc nhiu điu kin và môi trng khác nhau, nhng tt nht là
nhit đ t 30
o
C -37
cu).
S. aureus có enzyme catalase phân gii oxy già gii phóng oxy và nuc:
S. aureus cho phn ng đông huyt tng dng tính do chúng tit ra enzyme
coagulase. Ðây đc xem là tính cht đc trng ca S. aureus, là tiêu chun đ phân
bit S. aureus vi các t cu khác. Có hai dng coagulase: coagulase – “c đnh” (-
“bound” coagulase) gn vào thành t bào và coagulase – “t do” (- “free” coagulase)
đc phóng thích khi thành t bào. Có hai phng pháp d thc hin th nghim
coagulase là thc hin trên lam kính và trong
ng nghim. Phng pháp lam kính
giúp phát hin nhng coagulase – “c đnh” bng cách phn ng trc tip vi
fibrinogen, phng pháp ng nghim phát hin nhng coagulase – “t do” bng phn
ng gián tip vi fibrinogen qua cng hp vi nhng yu t khác trong huyt tng
to thành tng khi hay thành cc. Catalase
H
2
TeO
3
và kh nng thy phân lòng đ
trng ca lethinase). Trên môi trung MSA (Manitol salt agar) hay còn gi là môi
trng Chapman, khun lc tròn, b đu, li, màu vàng nht đn vàng đm và làm
vàng môi trng xung quanh khun lc (do lên men đng manitol). Ða s các dòng S. aureus có th tng hp mt hay nhiu Enterotoxin trong
môi trng có nhit đ trên 15
o
C, nhiu nht khi chúng tng trng nhit đ 35-
37
o
C. ( [12],[23])
Bng 1: So sánh nhng đc tính ca S.aureus, S.epidermidis và Micrococci
c tính S.aureus S.epidermidis Micrococci
Catalase
+ +
+
o
C, vi
nhit đ cc thun là 30-45
o
C; khong pH 4.2-9.3 vi đ pH cc thun là 7-7,5; và
trong môi trng cha trên 15% NaCl. T cu bn vng khi có nng đ đng cao,
nhng b c ch bi nng đ 60%; nng đ t 33 - 55%, t cu vn phát trin, trong
khi các vi khun khác nh Shigella và Salmonella b c ch.
Ngoài ra, chúng còn có kh nng bám dính tt trên nhiu loi t bào và máy
móc thit b giúp gia tng tính kháng ca t cu v
i s sy khô và lc thm. Chính
nh nhng đc đim trên giúp S. aureus có s phân b rng, ch yu đc phân lp
t da, màng nhày, tóc và mi ca ngi và đng vt máu nóng. S. aureus đc cho là
vi khun khá mnh có th sng tt bên ngoài kí ch. Vi khun này còn có mt trong
không khí, bi và trong nc dù chúng thiu tính di dng và rt nhy vi thuc kháng
sinh và cht dit khun. Tuy nhiên, S. aureus cng khá nhy v
i nhit đ, b dit
60
o
C t 2-50 phút tùy tng loi thc phm và là vi sinh vt cnh tranh yu, d b các
vi sinh vt khác c ch.
Có 10 - 50% dân s vn sng khe mnh dù mang S. aureus. T l mang vi
khun cao hn các nhân viên y t, bnh nhân lc máu, có bnh tiu đng type 1,
chích xì ke, nhim HIV, mc bnh da mãn tính. Sau 2 tun nm vin, t l này lên đn
30%-50% và thng nhim chng kháng thuc. Tuy nhiên kh nng nhim vào thc
ph
m và gây bnh ca S. aureus cng rt ln do chúng phân b khp ni và có kh
nng sinh đc t. T cu nhim vào thc phm ch yu qua con đng ch bin có
các công đon tip xúc trc tip vi ngi. S hin din vi mt đ cao ca S. aureus
trong thc phm cho thy điu kin v sinh ca quá trình ch bi
Potassium tellurite
Glycin
Manitol
Tellurite
Phenol red
3
Egg yolk-sodium
azide
Lithium chloride
Potassium telluride
Polymicin Bsulfate
Egg yolk
Tellurite
4 Barid-Parker Lithium chloride
Potassium tellurite
Egg yolk
Tellurite
Bng 2: Mt s môi trng chn lc cho S.aureus
Phn ln nhng môi trng chn lc thích hp cho S.aureus bình thng
không b tác đng. Tuy nhiên do s tác đng ca quá trình ch bin, bo qun, điu
kin bt li, b tác đng đn ngng gn cht thì vic tng sinh S.aureus cn có
nhng tác nhân chn lc. S. aureus có th không phát trin trên nhng môi trng
t
ng sinh chn lc truyn thng. Môi trng Baird-Parker là môi trng thích hp
nht cho vic tng sinh nhng t bào b tn thng.
“Các loài Staphylococcal có th xác đnh qua mt vài đc đim nh hình thái
khun lc, s to thành coagulase, tan huyt, đ kháng Novobiocin, s to thành
acetoin, s dng ngun carbonhydrat điu kin hiu khí. Trên môi trng không
chn lc nh TSA (tryptic soy agar), thch dinh dng, phn ln các loài
khun lan ra trên mô, phân hy màng t bào eukaryote.
KHÓA LUN TT NGHIP GVHD: ThS.BS. Trn Th Ngc Anh
SVTH: Nguyn Th Hunh Nh Trang 15
Hemolysin:
- toxin ( - hemolysin): đây là đc t kh màng mnh nht ca S. aureus.
Nó dng mt monomer gn kt vi màng t bào mn cm. ngi, tiu cu và
bch cu đc bit nhy vi – toxin do chúng có th th chuyên bit nhn din và
cho phép đc t gn kt hình thành l nh mà cation hóa tr mt có th qua đc.
- toxin: đây là mt mch enzyme phân hy màng giàu lipid. Th nghim
đi vi - toxin là phn ng phân hy hng cu cu.
- toxin: là mt đc t có peptide nh. - toxin có th phân hy mt s
dng t bào khác nhau.
Leukocidin: là protein đa thành phn, do nhiu thành phn riêng r hp li
phân hy màng. Leukocidin cng phân hy máu nhng yu hn – hemolysin. Ch
2% trong tt c các dòng S. aureus
có th to leukocidin, nhng đn gn 90% các
dòng phân lp t vt xc trên da có to đc t này.
Hyaluronidase: làm gim cht gian bào ca t bào ch và giúp t cu lan
rng sang các vùng xung quanh.
Catalase: có chc nng bt hot hydrogen peroxide và các gc t do hình
thành do h thng myeloperoxidase trong t bào ch.
Coagulase và yu t gây đông: coagulase là mt enzyme ngoi bào s gn
vi prothrombin trong t bào ch hình thành phc hp staphylothrombin. Coagulase
là mt ch th thng dùng đ phát hin S. aureus các phòng thí nghim. Tuy nhiên,
đa s bng chng cho thy rng đây không phi là yu t gây đc, mc dù chúng có
th t bo v khi s thc bào và đáp ng min dch bng cách gây đông. Có mt s
nhm ln v mi liên quan gia coagulase và yu t gây đông đâu là yu t quyt