B GIÁO DCăVẨăẨOăTO
TRNGăI HC M THÀNH PH H CHÍ MINH
KHOA CÔNG NGH SINH HC
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
tài tt nghip:
KHOăSỄTăTỊNHăHỊNHă KHÁNG KHÁNG
SINH DO TRC KHUN GRAM ÂM GÂY
NHIM TRÙNG HÔ HPăC PHÂN LP
TI BNH VIN NHÂN DÂN 115.
( T THỄNGă11/2013ăN THÁNG 05/2014)
CHUYÊN NGÀNH: VI SINH ậ SINH HC PHÂN T
GVHD : BS CKI NguynăPhngăDung
SVTH : Trn Th M Nhung
MSSV : 1053010549
KHÓA : 2010- 2014
TP.H CHÍ MINH THÁNG 06 NM 2014
Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung
SVTH: Trn Th M Nhung
LIăCỄMăN
Li cám n đu tiên em xin gi đn ba m em đư to điu kin cho em n hc đn
ngày hôm nay. Gia đình luôn là ngun đng viên khuyn khích,c v em hc tp, giúp
em vt qua mi khó khn trong sut thi gian hc tp và cho đn khi ra trng.
Em xin chân thành cám n ging viên hng dn ca em là Bác s chuyên khoa I
trng đn v vi sinh Nguyn Phng Dung đư tn tình ch dy và giúp đ em vt qua
Bng II.4 Màu ca b test sinh hóa Api 10S 41
Bng III.1 T l v gii tính ca bnh nhân có mu cy đàm 51
Bng III.2 T l v đ tui bnh nhân 52
Bng III.3 T l vi sinh sau khi cy đàm 52
Bng III.4 T l các vi khun gây nhim trùng hô hp phân lp đc ti Bnh Vin Nhân
Dân 115 53
Bng III.5 T l các vi khun gây nhim trùng đng hô hp đc xp theo nhóm .
55
Bng III.6 T l nhim trc khun Gram âm theo gii tính 56
Bng III.7 T l nhim trc khun Gram âm theo đ tui 57
Bng III.8 T l nhim trùng hô hp do trc khun Gram âm theo khoa 58
Bng III.9 Kt qu kho sát tình hình đ kháng kháng sinh chung ca trc khun Gram
âm Bnh Vin Nhân Dân 115 59
Bng III.10 Kt qu đ kháng kháng sinh ca 195 chng Acinetobacter baumannii,124
chng Pseudomonas aeruginosa, 105 chng Escherichia coli và 137chng trc khun
Gram âm khác 61
Bng III.11 Kt qu kho sát kh nng sinh men beta- lactamase ph rng (ESBL) ca
trc khun Gram âm đc kho sát Bnh Vin Nhân Dân 115 62
Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung
SVTH: Trn Th M Nhung
DANH MC HÌNH NH
Hình I.1 H hô hp ngi 5
Hình I.2 Cu to mi ngi 6
Hình I.3 Cu to hu ngi 6
Nhân Dân 115 54
Biu đ III.5 T l các vi khun gây nhim trùng đng hô hp đc xp theo nhóm
56
Biu đ III.6 T l nhim trc khun Gram âm theo gii tính 57
Biu đ III.7 T l nhim trc khun Gram âm theo đ tui 57
Biu đ III.8 T l nhim trùng hô hp do trc khun Gram âm theo khoa 58
Biu đ III.9 Kt qu kho sát tình hình đ kháng kháng sinh chung ca trc khun Gram
âm Bnh Vin Nhân Dân 115 60
Biu đ III.10 Kt qu đ kháng kháng sinh ca 195 chng Acinetobacter baumannii,124
chng Pseudomonas aeruginosa, 105 chng Escherichia coli và 137 trc khun Gram
âm khác 61
Biu đ III.11 Kt qu kho sát kh nng sinh men beta- lactamase ph rng (ESBLs)
ca trc khun Gram âm đc kho sát Bnh Vin Nhân Dân 115 63
Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung
SVTH: Trn Th M Nhung
DANH MC T VIT TT
CFU: Colony Forming Unit ( đn v to khúm đi vi vi khun sng).
NCCLS: Nationnal Committee for Clinical Laboratory Standards (y Ban Quc
Gia v tiêu chun ca các phòng thí nghim ti M).
SMART: Study for Monitoring Antimicrobial Resistance Trends ( Nghiên cu
giám sát khuynh hng đ kháng kháng sinh).
R: Resistant ( đ kháng).
S: Susceptible (nhy cm).
I: Intermediate ( trung gian).
FEP: Cefepime.
SCF: Cefoperazone + Sulbactam.
IMP: Imipeneme.
MEM: Memropenem.
ETP: Ertapenem.
AN: Amikacine.
MFX: Moxifloxacine
CIP: Ciprofloxacine
CS: Colistine
CFP: Cefoperazone
CXM: Cefuroxime
CAZ: Ceftazidime.
CAL: Ceftazidime + Clavulanate acid.
Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung
SVTH: Trn Th M Nhung
MC LC
T VNă 1
CHNG I: TNG QUAN 4
I. H HÔ HP 5
1. Khoang mi 5
2. Hu 6
3. Thanh qun 7
4. Khí qun 8
1. Acinetobacter baumannii 15
1.1 Tính cht vi sinh 15
1.2 Ni c trú và tính gây bnh 16
1.3 Tính cht sinh hóa 17
2. Pseudomonas aeruginosa 17
2.1 Tính cht vi sinh 17
2.2 Ni c trú và tính gây bnh 18
2.3 Tính cht sinh hóa 19
2.4 Kháng nguyên 19
3. Escherichia coli ( E.coli) 20
3.1 Tính cht vi sinh 20
3.2 Ni c trú và tính gây bnh 21
3.3 Tính cht sinh hoá 22
3.4 Kháng nguyên và đc t 22
4. Dch t hc 23
5. Bin pháp phòng nga 23
VII. KH NNGă SINHă MENă BETA- LACTAMASE PH RNG
CA CÁC TRC KHUN GRAM ÂM GÂY NHIM TRÙNG HÔ
HP (ESBL - ExpandedăSpectrumă.lactamase) 23
1. nh ngha ESBLs 23
Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung
SVTH: Trn Th M Nhung
2. Tình hình đ kháng kháng sinh do trc khun gram âm tit ESBLs
24
2.1 Trên th gii 24
2.2 Ti Vit Nam 25
VIII. SăLC V KHÁNG SINH 25
CHNG II: VT LIUăPHNGăPHỄP 31
I. VT LIU 32
1. Mu nghiên cu 32
2. X lý mu 32
2.1 Thi đim ly mu 32
2.2 Cách ly mu 32
3. ánh giá mu có giá tr đ kho sát vi khun hc 33
3.1 Kho sát đi th mu đàm 33
3.2 Kho sát vi th 33
II. THIT B- DNG C- HÓA CHTăMỌIăTRNG 36
1. Thit b dng c 36
2. Hóa cht môi trng 36
III. PHNGăPHỄPăTHệăNGHIM 37
1. Phng pháp nhum Gram 37
2.Phng pháp nuôi cy phân lp trên hp đa Petri ( phng pháp
cy 3 chiu) 38
3. nh danh 39
3.1 Nguyên tc 39
3.2 Cách thc tin hành 42
4. Kháng Sinh Theo Phng Pháp Kirby- Bauer 43
4.1 Nguyên tc 43
4.2 Vt liu- Phng pháp 44
4.3 Môi trng 44
4.4 Chun b mm cy 44
4.5 Các bc tin hành 45
Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung
SVTH: Trn Th M Nhung
T VNă
Vit Nam là mt nc nhit đi gió mùa, vì vy bnh nhim khun luôn chim v
trí hàng đu trong mô hình bnh tt. Khác vi nhng nm 1990, hin nay nhim khun do
các vi khun Gram âm đang chim u th so vi các vi khun Gram dng. Nhiu nghiên
cu cho thy đa s cn nguyên nhim khun huyt, nhim khun hô hp, sc nhim
khun, thm chí bnh nhân b t vong đc xác đnh khong 70% là nhim trùng do vi
khun Gram âm . Các vi khun Gram âm gây bnh thng gp ti các bnh vin là
Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter
baumannnii.
Vi đc thù kiu khí hu nhit đi gió mùa , nht là nhng thi đim giao mùa khi
nhit đ ngày và đêm có biên đ dao đng ln, đây là c hi cho các bnh lý hô hp phát
trin. Cùng vi điu kin môi trng không khí ô nhim, nhiu khói bi nên các bnh lý
thng gp nht vn là các bnh viêm đng hô hp. Cn nguyên gây ra các bnh lý này
có th là do virus hoc vi khun, và bnh hô hp thng gp nht là nhim khun đng
hô hp do trc khun Gram âm mà đin hình nht là các trc khun kháng đa kháng sinh.
Nhim khun do trc trùng Gram âm kháng thuc, thng do Acinetobacter
baumannii là mt trong nhng nguyên nhân hàng đu gây t vong do nhim trùng trên
toàn th gii cng nh ti Vit Nam.
T l trc trùng Gram âm gây nhim trùng bnh vin đư tng lên đu đn trong
nhng nm gn đây trên th gii, đc xem là vi khun hàng đu gây viêm phi bnh
vin ti nhng bnh vin ln trong nc. Kt hp vi t l nhim khun tng, mt t l
tng lên ca chng không nhy cm kháng sinh, c th là kháng sinh th h mi nh
Carbapenems thì đc bit đáng lo ngi.
Nu trc đây các nhim khun do các trc trùng Gram âm mà c th là
Escherichia coli, Klebsiella pneumonia và Enterobacter có th đc điu tr bng kháng
sinh h Cephalosporine thì hin nay tình hình không còn d dàng nh vy na vì các vi
khun này đư s hu mt th v khí rt đáng s, đó là kh nng tit men beta – lactamase
ph rng (ESBLs - Expanded Spectrum .lactamase) giúp vi khun kháng đc tt c các
kháng sinh Cephalosporine các th h t 1 đn 4 và hu ht các loi kháng sinh beta –
Mc tiêu tng quát: Kho sát tình hình đ kháng kháng sinh do trc khun Gram
âm gây nhim trùng hô hp đc phân lp ti Bnh Vin Nhân Dân 115 thi gian t
01/11/2013 đn 01/05/2014.
Mc tiêu chuyên bit:
- Kho sát t l trc khun Gram âm gây nhim trùng hô hp phân lp đc
t mu đàm ti Khoa Xét Nghim Bnh Vin Nhân Dân 115 t 01/11/2013 đn
01/05/2014.
- Bit đc quy trình t lúc nhn mu, x lý và bo qun mu cho đn khi tr
li kt qu xét nghim cho bác s lâm sàng.
Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung
SVTH: Trn Th M Nhung Trang 3
- Kho sát t l đ kháng kháng sinh ca trc khun Gram âm gây nhim
khun hô hp phân lp đc t mu đàm ti Khoa Xét Nghim Bnh Vin Nhân
Dân 115 thi gian t 01/11/2013 đn 01/05/2014.
Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung
SVTH: Trn Th M Nhung Trang 5
I. H HÔ HP.
[1]
H hô hp bao gm các đng dn khí t ngoài đn các ph nang ca phi và
ngc li. Các c quan đó là: mi, hu, thanh qun, khí qun, ph qun và phi.
Hình I.1 H hô hp ngi ( Trn Tun Anh, 2013)
1. Khoang mi.
[1]
Cu to ca khoang mi: Mi đc ngn ra thành 2 khoang bi xng lá mía và
mnh thng ca xng sàng. Mi xoang mi gm có 4 thành do các xng: xng lá
mía, xng sàng, xng hàm trên, xng khu cái, 3 đôi xng xon và xng mi to
thành. Thành ca xoang mi có niêm mc cha rt nhiu mao mch, lông và tuyn nhy
làm cho không khí đi qua xoang mi đc si m, làm m và lc sch trc khi vào sâu
hn. Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung
SVTH: Trn Th M Nhung Trang 6 Hình I.2 Cu to mi ngi ( Trn Tun Anh, 2013).
vt l ra ngoài.
Hình I.4 Thanh qun ngi ( Trn Tun Anh, 2013). Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung
SVTH: Trn Th M Nhung Trang 8
C ch phát âm:
Lung không khí đc đy t phi ra do các tác đng ca c hoành, c bng, các
c gian sn làm rung dây thanh âm đ to ra âm thanh. Âm thanh này đc cng hng
và bin đi thích hp bi mi, các xoang cnh mi, hu, màng hu, li, môi đ to ra
ting nói.
4. Khí qun.
[1]
Khí qun là mt đon ng ni tip vi thanh qun, có hình tr dp, tit din ngang
c hình ch D gm 16 vành sn chng lên nhau.
Lp niêm mc lót trong khí qun có nhiu tuyn nhy và nhiu tiêm mao, các tiêm
mao luôn c đng quét t trong ra ngoài đ ly các vt l ra ngoài.
Hình I.5 Khí qun ca ngi ( Trn Tun Anh, 2013). Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung
SVTH: Trn Th M Nhung Trang 9
5. Ph qun.
Hình I.7 Hình thái cu to ngoài ca phi ( Trn Tun Anh, 2013).
II. NHIM TRÙNG HÔ HP.
[4,14,15,17]
1. nhănghaănhim trùng hô hp.
[4,15,17]
Nhim trùng hô hp là tình trng mt hoc mt s b phn thuc b máy hô
hp b viêm nhim do vi khun hoc siêu vi gây ra.
[17]
V phng din lâm sàng, nhim trùng hô hp gm hai loi:
- Nhim trùng hô hp trên là tình trng nhim trùng cp tính đng hô hp
trên do nh hng ca các vi sinh vt gây bnh. Bnh thng xy ra vào thi đim
giao mùa (khong tháng 9 đn tháng 3), lúc tri tr lnh, đ m trong không khí
gim thp.
-
Viêm nhim hô hp di thng do vi khun, nhng cng không ít trng
hp do siêu vi.
2. Nguyên nhân và các yu t thun li gây bnh.
[15,17]
Nguyên nhân gây viêm nhim đng hô hp thng do siêu vi hoc vi
khun.
Viêm nhim đng hô hp trên thng do siêu vi nhng cng có th do vi
khun.
Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung
SVTH: Trn Th M Nhung Trang 11
5. Cách x tríăcácătrng hp nhim trùng hô hp (cp).
[15,17]
Nu bnh nhân không th nhanh và khó th, có th điu tr ti nhà bng
cách cho ung các loi nc làm du c hng ví d nh nc chanh hòa vi mt
ong.
Nu bnh nhân có th nhanh nhng cha có du hiu khó th và co rút
lng ngc, cn đa đn c s y t đ điu tr.
Trng hp có khó th và co rút lng ngc cn đa ngay đn bnh vin đ
cp cu.
Khóa lun tt nghip GVHD: Bs CKI Nguyn Phng Dung
SVTH: Trn Th M Nhung Trang 12
6. Cách phòng nga
[15,17]
phòng nga các bnh nhim khun hô hp, cn thc hin tt vic gi
gìn v sinh môi trng, nhà ca, chng cm lnh tránh xa các ngi bnh đang
có triu chng hô hp nh ho, khc, và luôn luôn có bin pháp bi dng, nâng
cao sc đ kháng ca c th, nht là đi vi tr em và ngi cao tui.
III. CÁC BNH NHIM TRÙNG HÔ HP THNG GP.
[4,16,17]
1. Nhim trùng hô hp trên.
[4,16,17]
1.1 Viêm hu hng
Nguyên nhân: thng do t cu hay liên cu hay d ng.
Triu chng: ho, đàm, đau hng, ni hch c.
X lý: h st, gim đau, tr ho, long đàm, kháng sinh ung hay tiêm 14 ngày.
Ngoài ra, nhim trùng hô hp di còn có các bnh : Viêm thanh qun, viêm khí
qun,…vv.
IV.TÌNH HÌNH NHIM TRÙNG HÔ HP HIN NAY VÀ S
KHÁNG SINH.
[21]
Theo T chc Y t Th gii (WHO), viêm đng hô hp là cn bnh có chiu
hng gia tng trong nhng nm gn đây và tình trng bnh ngày càng có chuyn bin
phc tp mà nguyên nhân chính là do s kháng kháng sinh ca các tác nhân gây bnh.
Phn ln bnh nhân đn khám ti các phòng khám chuyên khoa hô hp là do nhim
khun đng hô hp di.
Nhim khun đng hô hp di - mà trc đây cng đng hay gi chung là viêm
phi - là cn bnh thng gp, không ch Vit Nam mà c th gii. Các bnh nhim
khun đng hô hp di thng gp bao gm: Viêm ph qun cp, viêm phi cp, hen
ph qun, bnh phi tc nghn mn tính (COPD), ung th phi, tràn dch màng phi
c tính, có khong 30 – 40% s bnh nhân đn khám do các bnh nhim khun đng
hô hp và 90% bnh nhân đn khám ti các phòng khám chuyên khoa hô hp là do nhim
khun đng hô hp di.
[21]
Nhim khun đng hô hp di là cn bnh do vi khun, virus gây nên. Các tác
nhân chính dn đn tình trng nhim khun này là ph cu khun, Haemophilus
influenzae, Moraxella catarrhalis, trc khun Gram âm (Trc khun m xanh, trc khun
đng rut), các vi khun không đin hình (Chlamydophila pneumoniae, Mycoplasma
pneumonia). Các virus hay gp nh virus cúm, á cúm, virus hp bào hô hp. Nh mi
ngi cng đư bit, hin nay, nhim mt s virus cúm gia cm (H5N1, H1N1) cng có
th gây nên viêm phi nng, thm chí là dn đn t vong.
[21]
Do tình trng ô nhim môi trng nng n, khin các bnh lý hô hp có chiu
hng gia tng mnh. Ngày càng có nhiu loi virus có kh nng gây nhim trùng đng