I HC QUC GIA HÀ NI
I HC KHOA HC T NHIÊN Phng
NHÂN DÒNG VÀ BIU HIN TRÊN B MT BÀO T
BACILLUS SUBTILIS GEN MÃ HÓA KHÁNG NGUYÊN VP28
CA VIRUS GÂY BM TRNG TÔM
Chuyên ngành: Hóa sinh hc
Mã s: 62 42 01 16
D THO TÓM TT LUN ÁN TIC HÀ NI - 2014
2
M U
1. Tính cp thit c tài
Nuôi tôm Vin mnh trong nh
và tr thành ngành kinh t quan trng. Tuy nhiên, ngành nuôi trng tôm
Vit Nam hi c nhi ch bnh, cht
ng tôm ging sa sút. S bùng n ca các dch bnh nghiêm trng do
virus (WSSV), m
sng tôm, gây thit hi ln v kinh t.
Nhiu nghiên cu trên th gic ti tìm ra gii pháp
hiu qu chng l t qu c còn hn ch. Mt
ng nghiên cc nhiu nhà khoa hc trên th gin là to
các vaccine da trên protein cu trúc c ng
min dch tôm chng li bm trng. VP28 là mt loi protein v
chính ca WSSV, o giúp virus gc hiu lên t bào
c khu cho quá trình lây nhim. Chính vì vy, VP28 là
c la ch to kháng th cho
vaccine cho tôm phòng b m trng (Rout và tp th, 2007;
Witteveldt và tp th, 2004). Tuy nhiên, nhng kt qu nghiên cu to
vaccine phòng bm trng do WSSV mi dng li mc
th nghim nh lc mt vaccine chính thc, hiu qu.
i “Nghiên cứu
nhân dòng và biểu hiện trên bề mặt bào tử Bacillus subtilis gen mã hóa
kháng nguyên VP28 của virus gây bệnh đốm trắng ở tôm” bào
t Bacillus subtilis biu hin kháng nguyên VP28 ca virus gây bm
trng làm cho vic sn xut vaccine dng probiotic bn nhit giúp
phòng bm trng trên tôm.
2
2. Mc tiêu nghiên cu c tài
-
dòng và biu hin gen mã hóa protein VP28 tái t hp E. coli và Bacillus
subtilis nh trình t và mt s a gen VP28 t
các mu WSSV phân lc Vit Nam.
- Nghiên cu biu hin thành công gen mã hóa protein VP28 ca
WSSV trên b mt bào t B. subtilis i dng các cu trúc protein dung
hp CotB-VP28 và CotB-GST-, CotB là protein v ca B.
subtilis và GST (Glutathione S Transferase) là protein trung gian nhm
hn ch cn tr i vi VP28.
- tu kin thu nhn bào t tái t hp B. subtilis biu
hin tt kháng nguyên VP28 ca WSSV trên b mt bào t và nghiên cu
các tính cht ca bào t tái t hp B. subtilis CotB-VP28, CotB-GST-
VP28 trong mt s u king khác nhau.
- c ho ca các enzyme phenoloxidase
(PO), superoxide dismutase (SOD) phn ánh min dch ca tôm
th m trng trên tôm
70% ca bào t B. subtilis biu hin VP28
trên b mt.
6. ng dng thc tin c tài
- Kt qu nghiên cu c to ch phm probiotic
dng bào t B. subtilis tái t hp bn nhit, biu hin VP28 trên bn mt,
có kh ng min dch và bo v tôm khi nhim bm
trng, giúp góp phn kim soát dch bnh trên tôm.
- Thành công c tài s là ti cho vic phát trin các vaccine
tái t hp dng bào t B. subtilis tái t hp có kh nh do các
vi sinh vt khác gây ra tôm.
4
7. B cc ca lun án
Lun án gm 120 trang bao gm: Phn m u (3 trang); Tng quan
tài liu (40 trang); u (19 trang); Kt
t quan trng trong nhu tiên ca quá trình nhim
WSSV vào tôm (Van Hulten và tp th, 2001). i
pháp hiu qu ngn nga s tn công ca loi virus này tôm.
1.2. Nghiên cu to vaccine da trên kháng nguyên v WSSV
Tôm thu min dch ,
t s nghiên cu gy có kh c
hic kích thích bi các dng kháng nguyên VP28.
protein VP28
. c
biu hin thành công E. coli (Zhang và tp th, 2002; Sathish và tp th,
2004; Witteveldt và tp th 2004; Jha và tp th, 2005; Caipang và tp th,
2008; Hou và tp th, 2011; Syed-Musthaq và tp th, 2011; Mu và tp th,
2012). S dng VP28 là mt bi ng
sót ci vi WSSV. , y có là khó
áp dng trên thc t do protein VP28 không bn vng nc cho
trc tim nuôi tôm
sn xut cao.
nghiên cu tp trung vào vic phát trin các
dng vaccine vi khun sng tái t hp biu hin VP28.
cho thy rng các loi bào t tái t hp VP28 giúp bo v l
6
sng ca tôm khi th nghim vi WSSV so vc dùng bào
t tái t hp VP28 (Fu và tp th, 2010; Ning và tp th, 2011). Tuy vy
các kt qu nghiên cu mi ch t loi vaccine
chính thc to ra. Vì vy vic tip tc nghiên c tc
vaccine phòng bm trng là ht sc cn thit.
th chân trng (2-5g/con) dùng trong th nghim th thách kh o
h phòng nga WSSV c Phân viên nghiên cu nuôi trng Thy
sn Bc Trung b thuc Vin nghiên cu nuôi trng thy sn 1.
2.1.2. Nguyên liệu
Chng vi khun B. subtilis PY79 và vector pDG364, pDG364-CotB;
pDG364-CotB-GST là quà tng ca GS. Simon Cutting, i hc Hoàng
gia Holloway, London, Anh.
Các chng vi khun E. coli E. coli c
mua t hãng Novagen. Vector pET28b ca hãng Novagen (M); các
oligonucleotide ca hãng Life Technology, kit nhân dòng trc tip sn
phm PCR pGEM TA easy và c mua t hãng
Promega; thang chun protein, thang chun DNA 1kb và 100 bp, hn hp
c mua t hãng Fermentas; Hot- c
mua t hãng Enzynomics; kit thôi gel c mua t Bioneer; MagPure
viral DNA/RNc mua t ANABIO R&D; Qiaprep-miniprep
c mua cc mua t hãng Biobasic.
Các cp m c thit k c hi n gen mã hóa cho
VP28 ca virus gây bm trng WSSV, cotB; cp mc hiu cho v
8
trí amyE front, amyE back ca vector pDG 364, cp mi ca vector pGEM
T và cp mi T7 promoter Fw/T7 terminator Rv ca hãng Life Technology.
u
2.2.1. Thu nhn virus gây bm trng t mu tôm nhim bnh
2.2
-time PCR
2.2.3. Nuôi cy to bào t B. subtilis Nicholson và
Setlow (1990)
2.2.4. Tách chit, ANABIO R&D, ng
u có cho mn duy nht v
tính toán lý thuyt (615 bp) ca vp28.
Kt qu này cho phép
khnh rn gen mã hóa cho
VP28 t DNA h gen ca tôm nhim vm trng
3.1.2nh trình t và nghiên ca gen mã hóa VP28
o-
10
gen vp28
trvp28 vp28
( 2003)
AY168644 (3.2)
eotide
(A125G ->D42G, A183G -> T76A, A403G-> T135A, T517C-> C173R).
Bng 3.2: Mt s sai khác ca v à acid amin ca
VP28 thu thp ti Vit Nam so vi trình t (AY168644)
Tên mu
Sai khác
nucleotide
Sai khác mc axit
amin suy din
n, Cam Ranh
1.2 Khánh Hòa và Cn Gi 1, 4, 7, 9,
10 thành ph H Chí Minh
i các mã s
(accession number) ng là JX444992.1, JX444993.1 và JX444994.1.
3.2. NGHIÊN CU BIU HIN GEN MÃ HÓA VP28
3.2.1. B28 bng h thng vector pET28b trong E. coli
pGEM
Cp m c
hiu (VP28.2 Fw/c thit k da trên trình t u ca
gen vp28 nhn bit ca BamHI u và HindIII
cu thun tin cho ghép gen vào vector pET28b v sau.
vp28 VP28.2 Fw/ x lý
HindIII và BamHI pET28b
hai enzyme, bin
np vào chng E. coli BL21-RIL. Vector tái t hp pET28b-
c tách ra, tinh sch và gii trình t n gen vp28, s dng cp mi
T7Fw/Rv. Kt qu c trình t khnh chc chn gen vp28 c
g và v
khvp28 vào vector pET28b.
12
Kt qu biu hin gen vp28 c kim tra bng SDS-PAGE và thm
tách min dch (Hình 3.6) cho thy dch chit t bào BL21-RIL mang
vector pET28b-VP28 có chng chy 7, 8, 9,
mi chng âm (t bào BL21-RIL không
mang vector pET28b-VP28) tein này. Kt qu thm tách
min dch, s dng kháng th c hiy s có
mt c các m ng vi mu trên SDS-
ng chy 7, 8, 9, Hình 3.6B). T t lun r
biu hic VP28 E. coli.
phép khnh ch thành công protein VP28. Kt
qu ng protein cho thy t 100 ml dch nuôi c
c tng s 1,26 mg protein VP28-Histag. Protein VP28 tinh sc
s di chu v biu hin trên b
mt bào t tip theo.
Hình 3.7: Kt qu SDS-PAGE (A) và thm tách min dch (B) kim
tinh sch ca VP28
1: Dch chit t bào có cha protein VP28lên ct His-bind
2: Dch ra ct His-bind bm A có imidazol 5 mM
3: Dch ra ct His-bind bm A có imidazol 80 mM
14
4: Dch ra ct His-bind bm A có imidazol 100 mM
5:
6-9 Dch ra chit ct His-bind bm A có Imidazol 250 mM
3.2.2. Biu hin VP28 dng dung hp vi protein CotB trên b mt
bào t B. subtilis
Plasmid pDG364-cotB, pDG364-cotB-
plasm-
BamHI, HindIII. V (26 kDa)
B.
subtilis , 2008). Vector pDG364-cotB, pDG364-cotB-GST
B. subtilis. Trong
pDG364cotB-VP28, pDG364cotB-GST-VP28
bp, 1325 otB và
.
B) a chn cy chuy
1-30: các khun lc kim tra 1-30
-): B. subtilis PY79 dng th di không chn gen dung hp
kim tra chc chn s có mt ca gen cotB-vp28, CotB-GST-
vp28 trong h gen ca B. subtilis, chúng tôi tin hành nuôi tách
DNA ca 02 khun lt qu phn ng PCR vi các cp
m c nhng kt qu hoàn toàn phù
hp vi tính toán lý thuyt.
16
T kt qu này, có th kt lun rp thành công gen
cotB-vp28, CotB-GST-vp28 vào h gen ca B. subtilis và chng tái t hp
là B. subtilis CotB-VP28 và B. subtilis CotB-GST-VP28.
Mt s khun lc ca 2 chng tái t hp CotB-VP28 và CotB-GST-VP28
c chn nuôi, to bào t kim tra s biu hin ca VP28. So sánh bào
t ca chng chun B. subtilis PY79 vi bào t ca chng CotB-VP28 và
CotB-GST-VP28, chúng tôi nhn thy không có s khác bit v mt hình
thái. Bào t to thành bi 3 chng
nh VP28 có biu hin trên lp áo ca bào t và
dung hp vi CotB hoc CotB-GST hay không, chúng tôi thu dch chit
tng s t 5× 10
9
bào t chng B. subtilis PY79, CotB-VP28 và CotB-
GST-VP28 phân tích 28 bng-
kháng th . Theo tính toán lý
thuyt, protein dung hp gia CotB-VP28 có KLPT khong 63 kDa (CotB
khong 35 kDa và VP28 28 kDa), p
c rt yu, h cùng
u kin kích thích, mu bào t CotB-VP28, CotB-GST-VP28 cho thy
các tín hi sáng nét, rõ ràng, chng t bào t tái t hp biu hin
VP28 mu so vi dng bào t PY79. , protein dung
18
hp CotB-VP28, CotB-GST-VP28 trên b
mt bào t B. subtilis.
Hình 3.14: in dch hunh quang kim tra biu
hin CotB-VP28 và cotB-GST-VP28 trên b mt bào t
B. subtilis
Ning và (2011) u hin protein VP28 trên b mt ca
bào t B. subtilis s dng mt n DNA 825 bp mã hóa cho 275 acid
u tiên ca CotB làm yu t dung hp. Mc dù, m biu hin
ca protein VP28 kc kim
tra bt qu th
nghiu khnh ch phm to ra có kh
li s tn công cm trng.
Các chng CotB-VP28, CotB-GST-VP28 c ly ra và nuôi cy to
bào t và nghiên cu mt s tính cht ca bào t cho thy bào t tái t hp B.
subtilis cotB-VP28 và cotB-GST-VP28 c to thành t
19
ng DSM sau 48 gi t m ng là 3,1 x 10
9
, 4,2 x 10
9
,
bn nhi 80
ca bào t tái t hp
giá kh n dch ca bào t tái t hp,
enzyme superoxide dismutase (SOD) và phenoloxidase
(PO) tôm
. 3.25) o PO tt c các mu
c cho th sung hay có b sung bào t th di PY79,
bào t B. subtillis CotB-GST-VP28 và CotB-VP28 thp nht thm 0
sau 7 hoc 14 ngày tùy theo tng lô.
B. subtilis- (30%)
.
Hình 3.25. Ho phenoloxidase (PO) trong hemolymph ca tôm th
chân tr tái t hp
Kt qu phân O 3.26) cho thy
có s B. subtilis d
B. subtilis--
21
84,3%
B. subtilis
CotB-VP28 B. subtilis PY79.
Hình 3.26. Ho enzyme SOD trong mô tht ca tôm th chân trng
3.3.3. o h trên tôm th chân trng ca bào t
tái t hp
WSSV . B
pháp Real-time PCR c s bn copy ca WSSV
s
94,5% sau 14 ngày. Ti lô trn bào t cotB-
VP28, cotB-GST-i chng âm t l cht sau 14 ngày theo
ghi nhng là 19,23%, 26,67% và 25,81%. Hình 3.32 T l cha các lô tôm khi o
h ca bào t B. subtilis tái t hp
23
bo chân trng
ca các dng bo t CotB-VP28 và CotB-GST-VP28 ( m
bào t 1 x 10
9
CFU/g th) ng là 81% và 73,3%. Các giá tr này
u cao
c hiu qu nh hiu qu
bo v ca vaccine thy sn và thu kin v
hiu qu vaccine dng cho thy sn ca y ban châu Â
phm th nghim này có ti o v tôm chng li bm
trng do WSSV gây ra
.
B. subtilis
--GST-VP28
, (2-10),
(4%)